More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2901 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2901  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
395 aa  801    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255971  normal  0.0133892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6443  acetyl-CoA acetyltransferase  65.54 
 
 
392 aa  518  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11853  probable acetyl-CoA acetyltransferase  62.86 
 
 
392 aa  478  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359273  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4612  acetyl-CoA acetyltransferase  63.9 
 
 
392 aa  475  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000000000297368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2669  acetyl-CoA acetyltransferase  61.92 
 
 
391 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal  0.441381 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1910  acetyl-CoA acetyltransferase  61.66 
 
 
393 aa  476  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.126312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2430  acetyl-CoA acetyltransferase  61.2 
 
 
393 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1504  acetyl-CoA acetyltransferase  56.1 
 
 
393 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0543686  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2365  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  56.36 
 
 
393 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3781  acetyl-CoA acetyltransferase  59.16 
 
 
391 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.338969  normal  0.300645 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1594  acetyl-CoA acetyltransferase  56.1 
 
 
393 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1499  acetyl-CoA acetyltransferase  55.84 
 
 
393 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01409  acetyl-CoA acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04000)  58.35 
 
 
399 aa  410  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0687674 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23913  acetyl-coa c-acetyltransferase  54.2 
 
 
396 aa  410  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0732  acetyl-CoA acetyltransferase  56.85 
 
 
402 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3662  acetyl-CoA acetyltransferase  53.11 
 
 
391 aa  401  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2187  acetyl-CoA acetyltransferase  53.63 
 
 
392 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311845  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3149  phosphoryl transfer system, HPr  55.09 
 
 
392 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0276  acetyl-CoA acetyltransferase  55.3 
 
 
393 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00380599  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0134  acetyl-CoA acetyltransferase  54.26 
 
 
393 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31707  acetyl-CoA acetyltransferase  55.7 
 
 
404 aa  398  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.234055  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  54.05 
 
 
393 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  54.57 
 
 
393 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0126  acetyl-CoA acetyltransferase  54.26 
 
 
393 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524714  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  54.57 
 
 
393 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0106  acetyl-CoA acetyltransferase  54.4 
 
 
394 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  54.57 
 
 
393 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  54.57 
 
 
393 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  53.52 
 
 
393 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  54.31 
 
 
393 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  54.05 
 
 
393 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2074  thiolase  52.07 
 
 
391 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000106789  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  53 
 
 
393 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  54.05 
 
 
393 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1182  putative acyl-CoA thiolase  52.85 
 
 
391 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4255  acetyl-CoA acetyltransferase  53.37 
 
 
402 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  54.31 
 
 
393 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  53 
 
 
393 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3776  acetyl-CoA acetyltransferases  54.55 
 
 
396 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5988  acetyl-CoA acetyltransferase  53.65 
 
 
393 aa  388  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304817 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1788  hypothetical protein  54.03 
 
 
394 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  53.26 
 
 
392 aa  388  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3054  acetyl-CoA acetyltransferase  54.29 
 
 
396 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  53 
 
 
393 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  52.74 
 
 
393 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  53.79 
 
 
393 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  52.48 
 
 
393 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  52.74 
 
 
393 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  53 
 
 
393 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1789  hypothetical protein  53.51 
 
 
394 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0138  acetyl-CoA acetyltransferase  52.33 
 
 
393 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.998438  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  52.48 
 
 
393 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  50.91 
 
 
395 aa  385  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  54.05 
 
 
393 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0461  acetyl-CoA acetyltransferase  52.85 
 
 
397 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.843393 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  54.05 
 
 
393 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  52.22 
 
 
393 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05280  acetyl-CoA C-acetyltransferase, putative  54.95 
 
 
406 aa  382  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.875142  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3456  acetyl-CoA acetyltransferase  54.43 
 
 
397 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614385  normal  0.375478 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  52.22 
 
 
393 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  52.48 
 
 
393 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02410  acetyl-CoA acetyltransferase with thiolase domain  54.86 
 
 
416 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0344  acetyl-CoA acetyltransferase  54.15 
 
 
397 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  52.22 
 
 
393 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  52.48 
 
 
393 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1441  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  53.26 
 
 
393 aa  382  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0922147 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0458  acetyl-CoA acetyltransferases  51.81 
 
 
393 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.902718  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0067  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  54.52 
 
 
390 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  52.22 
 
 
393 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5522  acetyl-CoA acetyltransferase  51.96 
 
 
427 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5475  acetyl-CoA acetyltransferase  51.7 
 
 
393 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1841  acetyl-CoA acetyltransferase  54.43 
 
 
397 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219092  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  51.17 
 
 
392 aa  381  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  52.48 
 
 
399 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.158877 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2835  acetyl-CoA acetyltransferase  51.81 
 
 
391 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5142  acetyl-CoA acetyltransferase  51.96 
 
 
393 aa  378  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2696  acetyl-CoA acetyltransferase  53.12 
 
 
394 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0145764  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  51.65 
 
 
399 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.127109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3043  acetyl-CoA acetyltransferase  50.78 
 
 
391 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  51.44 
 
 
393 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2215  acetyl-CoA acetyltransferase  53.91 
 
 
397 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5193  acetyl-CoA acetyltransferase  51.7 
 
 
393 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5028  acetyl-CoA acetyltransferase  51.44 
 
 
393 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5044  acetyl-CoA acetyltransferase  51.7 
 
 
393 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  51.17 
 
 
393 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5485  acetyl-CoA acetyltransferase  51.44 
 
 
427 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000736039  hitchhiker  2.33e-22 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4368  acetyl-CoA acetyltransferase  51.56 
 
 
394 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5589  acetyl-CoA acetyltransferase  51.7 
 
 
393 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2794  acetyl-CoA acetyltransferase  51.81 
 
 
391 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5467  acetyl-CoA acetyltransferase  51.7 
 
 
427 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00479259  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3523  acetyl-CoA acetyltransferase  53.91 
 
 
397 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2547  acetyl-CoA acetyltransferase  52.6 
 
 
395 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  51.94 
 
 
392 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  51.68 
 
 
392 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  51.55 
 
 
391 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.172514  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0178  acetyl-CoA acetyltransferase  52.59 
 
 
396 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  51.55 
 
 
393 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  53.26 
 
 
393 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13090  putative acyl-CoA thiolase  52.33 
 
 
391 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3031  thiolase  52.86 
 
 
402 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.589466  normal  0.04757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>