More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1910 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1910  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
393 aa  798    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.126312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6443  acetyl-CoA acetyltransferase  64.36 
 
 
392 aa  507  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2430  acetyl-CoA acetyltransferase  59.38 
 
 
393 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2901  acetyl-CoA acetyltransferase  61.66 
 
 
395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255971  normal  0.0133892 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4612  acetyl-CoA acetyltransferase  59.13 
 
 
392 aa  458  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000000000297368  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11853  probable acetyl-CoA acetyltransferase  57.95 
 
 
392 aa  457  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359273  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2669  acetyl-CoA acetyltransferase  56.63 
 
 
391 aa  448  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal  0.441381 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23913  acetyl-coa c-acetyltransferase  54.89 
 
 
396 aa  414  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2365  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  53.59 
 
 
393 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1504  acetyl-CoA acetyltransferase  53.33 
 
 
393 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0543686  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1594  acetyl-CoA acetyltransferase  52.82 
 
 
393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1499  acetyl-CoA acetyltransferase  52.82 
 
 
393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67034  Acetyl-CoA acetyltransferase IA (Peroxisomal acetoacetyl-CoA thiolase) (Thiolase IA)  53.32 
 
 
392 aa  397  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.16531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3149  phosphoryl transfer system, HPr  51.55 
 
 
392 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01409  acetyl-CoA acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04000)  51.88 
 
 
399 aa  389  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0687674 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31707  acetyl-CoA acetyltransferase  51.65 
 
 
404 aa  390  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.234055  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05280  acetyl-CoA C-acetyltransferase, putative  51.41 
 
 
406 aa  385  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.875142  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2835  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
391 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2074  thiolase  49.23 
 
 
391 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000106789  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2794  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
391 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1378  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
391 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433921 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
391 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.172514  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3575  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
395 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313168  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02410  acetyl-CoA acetyltransferase with thiolase domain  52.19 
 
 
416 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0697  acetyl-CoA acetyltransferases  49.74 
 
 
395 aa  375  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.723631  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1473  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.1 
 
 
396 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00066272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5988  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 
393 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304817 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1677  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 
396 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0732  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
402 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4368  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 
394 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  47.45 
 
 
392 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3043  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 
391 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0106  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 
394 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1441  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  47.97 
 
 
393 aa  372  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0922147 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10512  acetyl-CoA-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14200)  48.74 
 
 
435 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2907  acetyl-CoA acetyltransferases  51.41 
 
 
393 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0276  acetyl-CoA acetyltransferase  47.95 
 
 
393 aa  368  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00380599  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1397  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 
396 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4732  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 
394 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3602  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 
394 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.324693 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2306  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.61 
 
 
398 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2547  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
395 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4255  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 
402 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3107  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
396 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2923  acetyl-CoA acetyltransferases  50.13 
 
 
394 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0178  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 
396 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2036  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 
395 aa  368  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.657268 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2856  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 
396 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.700785  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  46.95 
 
 
395 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 
399 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.158877 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1788  hypothetical protein  48.97 
 
 
394 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1789  hypothetical protein  48.71 
 
 
394 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  47.83 
 
 
394 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3662  acetyl-CoA acetyltransferase  47.19 
 
 
391 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2771  acetyl-CoA acetyltransferases  48.84 
 
 
396 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1841  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 
397 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219092  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 
394 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1525  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 
396 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  47.58 
 
 
393 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3781  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
391 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.338969  normal  0.300645 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0134  acetyl-CoA acetyltransferase  48.2 
 
 
393 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0126  acetyl-CoA acetyltransferase  48.2 
 
 
393 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524714  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1182  putative acyl-CoA thiolase  46.43 
 
 
391 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1495  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 
396 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4187  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.2 
 
 
393 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0458  acetyl-CoA acetyltransferases  48.46 
 
 
393 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.902718  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3105  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.62 
 
 
395 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0273238 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3306  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.97 
 
 
395 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  47.45 
 
 
394 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1489  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 
396 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2597  acetyl-CoA acetyltransferases  48.59 
 
 
396 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124801  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2664  acetyl-CoA acetyltransferases  48.59 
 
 
396 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.304657  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  47.45 
 
 
394 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3202  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
400 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.573759  hitchhiker  0.000000552223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  48.08 
 
 
394 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3054  acetyl-CoA acetyltransferase  47.56 
 
 
396 aa  364  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2011  acetyl-CoA acetyltransferase  48.32 
 
 
393 aa  364  2e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271302  normal  0.806443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3456  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
397 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614385  normal  0.375478 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3776  acetyl-CoA acetyltransferases  47.3 
 
 
396 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3574  acetyl-CoA acetyltransferase  47.83 
 
 
392 aa  364  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384269  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 
392 aa  363  3e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5725  acetyl-CoA acetyltransferase  48.09 
 
 
396 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  48.32 
 
 
396 aa  362  4e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.184491  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2868  thiolase  48.72 
 
 
396 aa  363  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1667  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
396 aa  363  4e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00240927  normal  0.0395085 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0461  acetyl-CoA acetyltransferase  47.56 
 
 
397 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.843393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1001  acetyl-CoA acetyltransferase  47.56 
 
 
400 aa  362  5.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5969  acetyl-CoA acetyltransferases  48.09 
 
 
396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.661429 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3016  acetyl-CoA acetyltransferase  47.19 
 
 
393 aa  362  6e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4113  acetyl-CoA acetyltransferase  46.94 
 
 
393 aa  362  6e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000455591 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000375  3-ketoacyl-CoA thiolase (isoleucine degradation)  48.96 
 
 
392 aa  362  6e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.587204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3166  acetyl-CoA acetyltransferase  46.94 
 
 
393 aa  362  8e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.989786  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2215  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
397 aa  362  9e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2117  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 
393 aa  361  9e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.465032  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02692  acetyl-CoA acetyltransferase  46.94 
 
 
393 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2992  acetyl-CoA acetyltransferase  46.94 
 
 
393 aa  361  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.936911  normal  0.139342 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0138  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 
393 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.998438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0871  acetyl-CoA acetyltransferase  46.94 
 
 
393 aa  361  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02655  hypothetical protein  46.94 
 
 
393 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.990226  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4205  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
395 aa  361  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000900361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>