More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3105 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4665  acetyl-CoA acetyltransferase  82.86 
 
 
398 aa  648    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226383  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5347  acetyl-CoA acetyltransferase  79.44 
 
 
396 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0980846 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6652  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  78.63 
 
 
396 aa  634    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408769  normal  0.0141058 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5725  acetyl-CoA acetyltransferase  80.2 
 
 
396 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2547  acetyl-CoA acetyltransferase  91.9 
 
 
395 aa  749    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3105  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  100 
 
 
395 aa  795    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0273238 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5969  acetyl-CoA acetyltransferases  79.95 
 
 
396 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.661429 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3107  acetyl-CoA acetyltransferase  75.57 
 
 
396 aa  627  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6232  acetyl-CoA acetyltransferases  79.19 
 
 
396 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  normal  0.0748804 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1599  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  79.19 
 
 
396 aa  621  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462018  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4383  acetyl-CoA acetyltransferase  78.01 
 
 
395 aa  618  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.325311  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6708  acetyl-CoA acetyltransferase  78.93 
 
 
396 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331471  normal  0.555202 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0448  acetyl-CoA acetyltransferase  79.54 
 
 
396 aa  611  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0392  acetyl-CoA acetyltransferase  79.28 
 
 
396 aa  610  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4941  acetyl-CoA acetyltransferase  75.7 
 
 
396 aa  609  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6505  acetyl-CoA acetyltransferase  78.77 
 
 
395 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.41485  normal  0.431537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2868  thiolase  73.21 
 
 
396 aa  595  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2215  acetyl-CoA acetyltransferase  73.35 
 
 
397 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3523  acetyl-CoA acetyltransferase  73.1 
 
 
397 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3456  acetyl-CoA acetyltransferase  73.6 
 
 
397 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614385  normal  0.375478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1841  acetyl-CoA acetyltransferase  73.35 
 
 
397 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219092  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31530  putative acyl-CoA thiolase  73.21 
 
 
396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812461  hitchhiker  0.0000999697 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2907  acetyl-CoA acetyltransferases  75.7 
 
 
393 aa  580  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0178  acetyl-CoA acetyltransferase  71.61 
 
 
396 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2683  putative acyl-CoA thiolase  72.19 
 
 
396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0612266  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2036  acetyl-CoA acetyltransferase  70.69 
 
 
395 aa  568  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.657268 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0732  acetyl-CoA acetyltransferase  69.64 
 
 
402 aa  569  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5096  acetyl-CoA acetyltransferase  73.91 
 
 
395 aa  567  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.97471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3164  acetyl-CoA acetyltransferase  70.77 
 
 
402 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.783453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4255  acetyl-CoA acetyltransferase  69.92 
 
 
402 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0461  acetyl-CoA acetyltransferase  69.67 
 
 
397 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.843393 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0344  acetyl-CoA acetyltransferase  69.9 
 
 
397 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3031  thiolase  70.48 
 
 
402 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.589466  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0126  acetyl-CoA acetyltransferase  69.15 
 
 
393 aa  551  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524714  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2277  acetyl-CoA acetyltransferase  69.9 
 
 
397 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0417  acetyl-CoA acetyltransferase  69.9 
 
 
397 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0096  acetyl-CoA acetyltransferase  69.9 
 
 
397 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.825605  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0579  acetyl-CoA acetyltransferase  69.9 
 
 
397 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0134  acetyl-CoA acetyltransferase  68.64 
 
 
393 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  69.64 
 
 
397 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2010  acetyl-CoA acetyltransferase  69.9 
 
 
397 aa  550  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0276  acetyl-CoA acetyltransferase  67.52 
 
 
393 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00380599  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0106  acetyl-CoA acetyltransferase  66.33 
 
 
394 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0138  acetyl-CoA acetyltransferase  66.41 
 
 
393 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.998438  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07370  Thiolase  68.19 
 
 
395 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3776  acetyl-CoA acetyltransferases  64.36 
 
 
396 aa  526  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  66.33 
 
 
399 aa  526  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.158877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5988  acetyl-CoA acetyltransferase  65.64 
 
 
393 aa  525  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304817 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1073  acetyl-CoA acetyltransferase  64.87 
 
 
394 aa  521  1e-147  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3054  acetyl-CoA acetyltransferase  64.36 
 
 
396 aa  524  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3085  acetyl-CoA acetyltransferase  70.11 
 
 
398 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.833369  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0965  acetyl-CoA acetyltransferase  65.13 
 
 
394 aa  521  1e-146  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3602  acetyl-CoA acetyltransferase  66.33 
 
 
394 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.324693 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3940  hypothetical protein  69.8 
 
 
386 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.798805 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0098  thiolase  65.06 
 
 
396 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714635  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3306  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  65.38 
 
 
395 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3149  phosphoryl transfer system, HPr  64.45 
 
 
392 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0067  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  65.72 
 
 
390 aa  512  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4368  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 
394 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3921  acetyl-CoA acetyltransferases  70.66 
 
 
386 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4050  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  65.9 
 
 
387 aa  511  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3980  acetyl-CoA acetyltransferase  70.15 
 
 
390 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1001  acetyl-CoA acetyltransferase  64.8 
 
 
400 aa  508  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4732  acetyl-CoA acetyltransferase  63.27 
 
 
394 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3184  putative thiolase  70.41 
 
 
386 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0781  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  62.47 
 
 
395 aa  505  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3575  acetyl-CoA acetyltransferase  63.78 
 
 
395 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313168  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1788  hypothetical protein  62.5 
 
 
394 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0458  acetyl-CoA acetyltransferases  63.68 
 
 
393 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.902718  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2597  acetyl-CoA acetyltransferases  64.36 
 
 
396 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124801  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2664  acetyl-CoA acetyltransferases  64.62 
 
 
396 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.304657  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2771  acetyl-CoA acetyltransferases  64.36 
 
 
396 aa  500  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1182  putative acyl-CoA thiolase  64.78 
 
 
391 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1677  acetyl-CoA acetyltransferase  63.59 
 
 
396 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  63.31 
 
 
396 aa  499  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.184491  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1397  acetyl-CoA acetyltransferase  63.59 
 
 
396 aa  498  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3202  acetyl-CoA acetyltransferase  63.82 
 
 
400 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.573759  hitchhiker  0.000000552223 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4187  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  61.89 
 
 
393 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1473  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  62.92 
 
 
396 aa  499  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00066272 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1338  acetyl-CoA acetyltransferases  62.27 
 
 
396 aa  498  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.671481  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1789  hypothetical protein  61.22 
 
 
394 aa  497  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5943  thiolase  66.33 
 
 
400 aa  495  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1525  acetyl-CoA acetyltransferase  64.08 
 
 
396 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2856  acetyl-CoA acetyltransferase  63.82 
 
 
396 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.700785  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1943  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  61.89 
 
 
396 aa  496  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1495  acetyl-CoA acetyltransferase  63.82 
 
 
396 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1667  acetyl-CoA acetyltransferase  61.89 
 
 
396 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00240927  normal  0.0395085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3839  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  61.36 
 
 
397 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3662  acetyl-CoA acetyltransferase  62.21 
 
 
391 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0697  acetyl-CoA acetyltransferases  62.4 
 
 
395 aa  492  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.723631  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1489  acetyl-CoA acetyltransferase  63.31 
 
 
396 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2306  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  62.92 
 
 
398 aa  491  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2011  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 
393 aa  491  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271302  normal  0.806443 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1375  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  62.5 
 
 
392 aa  488  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.692424  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0074  acetyl-CoA acetyltransferase  64.95 
 
 
392 aa  485  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13090  putative acyl-CoA thiolase  64.52 
 
 
391 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2696  acetyl-CoA acetyltransferase  61.27 
 
 
394 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0145764  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0252  putative acetyl-CoA acyltransferase  60.46 
 
 
393 aa  478  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.152844  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6128  acetyl-CoA acetyltransferase  61.48 
 
 
389 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0513705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1946  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  64.78 
 
 
406 aa  481  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>