More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3574 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3574  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 392 aa  779    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2074  thiolase  71.21 
 
 		 391 aa  556  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000106789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  69.15 
 
 		 391 aa  541  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.172514  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2794  acetyl-CoA acetyltransferase  69.41 
 
 		 391 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3043  acetyl-CoA acetyltransferase  66.92 
 
 		 391 aa  524  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1378  acetyl-CoA acetyltransferase  62.82 
 
 		 391 aa  501  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1719  thiolase  63.85 
 
 		 391 aa  500  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000100709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2835  acetyl-CoA acetyltransferase  62.82 
 
 		 391 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3302  thiolase  62.76 
 
 		 391 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2117  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.465032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 		 393 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6443  acetyl-CoA acetyltransferase  48.46 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1397  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1677  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 396 aa  368  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2856  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 396 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.700785  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1525  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 396 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1495  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 396 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1489  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4255  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2597  acetyl-CoA acetyltransferases  49.87 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124801  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2664  acetyl-CoA acetyltransferases  49.87 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.304657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2771  acetyl-CoA acetyltransferases  50.13 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384582 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1943  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.59 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2011  acetyl-CoA acetyltransferase  47.67 
 
 		 393 aa  368  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271302  normal  0.806443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2430  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 393 aa  364  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1473  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.1 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 		 396 aa  363  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.184491  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 392 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 		 393 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1910  acetyl-CoA acetyltransferase  47.83 
 
 		 393 aa  364  2e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.126312 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 		 393 aa  363  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0461  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 		 397 aa  362  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.843393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  47.57 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1789  hypothetical protein  47.45 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  361  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1667  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 		 396 aa  360  3e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00240927  normal  0.0395085 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2696  acetyl-CoA acetyltransferase  48.58 
 
 		 394 aa  360  4e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0145764  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1788  hypothetical protein  47.19 
 
 		 394 aa  359  5e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1891  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.36 
 
 		 391 aa  359  6e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 392 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5969  acetyl-CoA acetyltransferases  49.23 
 
 		 396 aa  358  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.661429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 392 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0732  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 		 402 aa  358  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5725  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3149  phosphoryl transfer system, HPr  47.19 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2187  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311845  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1338  acetyl-CoA acetyltransferases  48.2 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.671481  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 		 393 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3344  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 392 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0618953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 		 393 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 		 395 aa  356  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3202  acetyl-CoA acetyltransferase  47.44 
 
 		 400 aa  355  5e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.573759  hitchhiker  0.000000552223 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01631  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 		 395 aa  355  5e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 393 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 		 393 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2923  acetyl-CoA acetyltransferases  48.59 
 
 		 394 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0276  acetyl-CoA acetyltransferase  47.83 
 
 		 393 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00380599  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02410  acetyl-CoA acetyltransferase with thiolase domain  48.33 
 
 		 416 aa  355  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 		 393 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 		 393 aa  353  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1375  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.1 
 
 		 392 aa  354  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.692424  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0178  acetyl-CoA acetyltransferase  48.3 
 
 		 396 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 		 393 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 		 393 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2547  acetyl-CoA acetyltransferase  48.46 
 
 		 395 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 		 393 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0846  acetyl-CoA acetyltransferase  47.57 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.874703  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  47.95 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3299  acetyl-CoA acetyltransferase  47.96 
 
 		 392 aa  350  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2074  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6652  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.46 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408769  normal  0.0141058 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  47.95 
 
 		 393 aa  351  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 		 392 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5347  acetyl-CoA acetyltransferase  48.46 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0980846 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000375  3-ketoacyl-CoA thiolase (isoleucine degradation)  45.38 
 
 		 392 aa  350  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.587204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02692  acetyl-CoA acetyltransferase  47.31 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0871  acetyl-CoA acetyltransferase  47.31 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0252  putative acetyl-CoA acyltransferase  46.63 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.152844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  46.33 
 
 		 399 aa  350  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.127109 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02655  hypothetical protein  47.31 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.990226  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  46.97 
 
 		 396 aa  350  3e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2992  acetyl-CoA acetyltransferase  47.31 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.936911  normal  0.139342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>