More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2187 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2187  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
392 aa  793    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311845  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  56.74 
 
 
393 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  55.98 
 
 
393 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 
392 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  54.08 
 
 
392 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  56.01 
 
 
392 aa  432  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  56.35 
 
 
399 aa  431  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.127109 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  55.47 
 
 
393 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  55.22 
 
 
393 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  53.32 
 
 
392 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  53.83 
 
 
392 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 
392 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  55.24 
 
 
393 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1441  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  56.12 
 
 
393 aa  426  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0922147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  54.85 
 
 
392 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  55.47 
 
 
393 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  55.1 
 
 
392 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  54.85 
 
 
392 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  53.57 
 
 
392 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  54.34 
 
 
393 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 
393 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  56.12 
 
 
392 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  54.85 
 
 
393 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2074  acetyl-CoA acetyltransferase  54.34 
 
 
393 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  54.34 
 
 
393 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2073  acetyl-CoA acetyltransferase  56.12 
 
 
392 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 
393 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 
393 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 
393 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  53.83 
 
 
395 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 
393 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 
393 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  53.83 
 
 
393 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 
393 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  54.08 
 
 
395 aa  414  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  53.83 
 
 
393 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  53.83 
 
 
393 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  53.83 
 
 
393 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  54.08 
 
 
393 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  53.83 
 
 
393 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  52.69 
 
 
394 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  53.57 
 
 
393 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  53.57 
 
 
393 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  53.57 
 
 
393 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 
392 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  56.63 
 
 
392 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  53.83 
 
 
393 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  53.57 
 
 
393 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  52.16 
 
 
401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  54.08 
 
 
393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 
392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3299  acetyl-CoA acetyltransferase  51.53 
 
 
392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 
393 aa  402  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  52.04 
 
 
392 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  53.06 
 
 
392 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  52.81 
 
 
392 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2478  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 
393 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  53.44 
 
 
396 aa  403  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  53.71 
 
 
393 aa  403  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  54.85 
 
 
393 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  54.71 
 
 
393 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  52.55 
 
 
392 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  0.0000152049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  55.1 
 
 
393 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  52.67 
 
 
396 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02692  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
393 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0846  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
393 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.874703  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4113  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
393 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000455591 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3188  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
392 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0402  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0871  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
393 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  52.03 
 
 
390 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  54.08 
 
 
393 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02655  hypothetical protein  50.38 
 
 
393 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.990226  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2901  acetyl-CoA acetyltransferase  53.63 
 
 
395 aa  395  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255971  normal  0.0133892 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3016  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
393 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2992  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
393 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.936911  normal  0.139342 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  52.04 
 
 
393 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.362583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2991  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
393 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00959201  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0412  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  395  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  53.83 
 
 
393 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  54.08 
 
 
393 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3352  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
402 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3171  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
392 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3166  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
393 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.989786  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3237  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
392 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000800068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3251  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
392 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00372711 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1869  acetyl-CoA acetyltransferase  52.84 
 
 
393 aa  391  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1668  acetyl-CoA acetyltransferase  51.91 
 
 
401 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2086  acetyl-CoA acetyltransferase  52.81 
 
 
392 aa  391  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.849145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 
393 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  53.32 
 
 
393 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6443  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
392 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0522  acetyl-CoA acetyltransferase  52.82 
 
 
395 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.061167  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2026  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 
391 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2561  acetyl-CoA acetyltransferase  52.04 
 
 
392 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306934  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  51.68 
 
 
394 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  51.55 
 
 
394 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  51.91 
 
 
394 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2074  thiolase  52.17 
 
 
391 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000106789  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5341  acetyl-CoA acetyltransferase  52.82 
 
 
394 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>