More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3352 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02692  acetyl-CoA acetyltransferase  91.33 
 
 
393 aa  722    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0846  acetyl-CoA acetyltransferase  91.58 
 
 
393 aa  724    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.874703  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3299  acetyl-CoA acetyltransferase  86.22 
 
 
392 aa  686    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2992  acetyl-CoA acetyltransferase  91.33 
 
 
393 aa  722    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.936911  normal  0.139342 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0871  acetyl-CoA acetyltransferase  91.33 
 
 
393 aa  722    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2991  acetyl-CoA acetyltransferase  91.07 
 
 
393 aa  721    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00959201  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3352  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
402 aa  810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4113  acetyl-CoA acetyltransferase  91.07 
 
 
393 aa  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000455591 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02655  hypothetical protein  91.33 
 
 
393 aa  722    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.990226  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3188  acetyl-CoA acetyltransferase  99.74 
 
 
392 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3237  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
392 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000800068 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3166  acetyl-CoA acetyltransferase  91.07 
 
 
393 aa  719    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.989786  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3016  acetyl-CoA acetyltransferase  90.82 
 
 
393 aa  716    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3251  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
392 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00372711 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3171  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
392 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  70.15 
 
 
392 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  69.39 
 
 
392 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  69.64 
 
 
392 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  69.39 
 
 
392 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  68.11 
 
 
392 aa  551  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  68.96 
 
 
393 aa  551  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  68.7 
 
 
393 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  68.45 
 
 
393 aa  552  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  68.45 
 
 
393 aa  548  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  69.64 
 
 
395 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  68.11 
 
 
392 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  67.09 
 
 
392 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2074  acetyl-CoA acetyltransferase  67.6 
 
 
393 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  66.41 
 
 
401 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1668  acetyl-CoA acetyltransferase  65.39 
 
 
401 aa  514  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  65.05 
 
 
392 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  63.52 
 
 
393 aa  494  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  62.76 
 
 
392 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  63.36 
 
 
393 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  63.52 
 
 
393 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  66.07 
 
 
393 aa  494  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.362583  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 
393 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 
393 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 
393 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  62.76 
 
 
393 aa  491  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  62.76 
 
 
393 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  63.01 
 
 
393 aa  488  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 
393 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 
393 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 
393 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 
393 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 
393 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 
393 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 
393 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 
393 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 
393 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 
393 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 
393 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 
393 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  60.2 
 
 
392 aa  481  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  60.46 
 
 
392 aa  482  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  0.0000152049 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  62.11 
 
 
394 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  61.13 
 
 
393 aa  475  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 
393 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 
393 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  60.2 
 
 
393 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 
393 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2561  acetyl-CoA acetyltransferase  61.99 
 
 
392 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306934  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  61.99 
 
 
393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  60.56 
 
 
393 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  60.05 
 
 
393 aa  465  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2086  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 
392 aa  462  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.849145 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  58.93 
 
 
392 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1869  acetyl-CoA acetyltransferase  61.03 
 
 
393 aa  461  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  60.46 
 
 
393 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  60.46 
 
 
393 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  57.8 
 
 
390 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01631  acetyl-CoA acetyltransferase  57.29 
 
 
395 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  56.12 
 
 
392 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  55.87 
 
 
392 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  58.82 
 
 
392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5341  acetyl-CoA acetyltransferase  60.26 
 
 
394 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  57.91 
 
 
393 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2256  acetyl-CoA acetyltransferase  58.16 
 
 
390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.672895  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2073  acetyl-CoA acetyltransferase  60.2 
 
 
392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 
392 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2478  acetyl-CoA acetyltransferase  59.69 
 
 
393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  57.51 
 
 
392 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  55.9 
 
 
394 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  57.29 
 
 
394 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  56.15 
 
 
392 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  57.14 
 
 
395 aa  440  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  56.78 
 
 
390 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3053  acetyl-CoA acetyltransferase  58.21 
 
 
391 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927009  normal  0.280487 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  56.3 
 
 
392 aa  438  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  56.41 
 
 
398 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0493  acetyl-CoA acetyltransferase  54.85 
 
 
391 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  55.58 
 
 
396 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2401  acetyl-CoA acetyltransferase  55.5 
 
 
391 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2466  acetyl-CoA acetyltransferase  55.24 
 
 
391 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5961  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  54.87 
 
 
392 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  54.82 
 
 
394 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  54.82 
 
 
394 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 
394 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2365  acetyl-CoA acetyltransferase  58.16 
 
 
394 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>