More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6443 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6443  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
392 aa  800    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2901  acetyl-CoA acetyltransferase  65.54 
 
 
395 aa  505  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255971  normal  0.0133892 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1910  acetyl-CoA acetyltransferase  64.36 
 
 
393 aa  507  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.126312 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11853  probable acetyl-CoA acetyltransferase  61.7 
 
 
392 aa  488  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359273  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2430  acetyl-CoA acetyltransferase  59.23 
 
 
393 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2669  acetyl-CoA acetyltransferase  57.54 
 
 
391 aa  468  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal  0.441381 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4612  acetyl-CoA acetyltransferase  58.1 
 
 
392 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000000000297368  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1504  acetyl-CoA acetyltransferase  53.98 
 
 
393 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0543686  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2365  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  53.73 
 
 
393 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1594  acetyl-CoA acetyltransferase  53.21 
 
 
393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01409  acetyl-CoA acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04000)  52.66 
 
 
399 aa  402  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0687674 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1499  acetyl-CoA acetyltransferase  53.21 
 
 
393 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2036  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 
395 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.657268 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
395 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31707  acetyl-CoA acetyltransferase  52.53 
 
 
404 aa  395  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.234055  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0106  acetyl-CoA acetyltransferase  51.42 
 
 
394 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0276  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00380599  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2074  thiolase  48.85 
 
 
391 aa  391  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000106789  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67034  Acetyl-CoA acetyltransferase IA (Peroxisomal acetoacetyl-CoA thiolase) (Thiolase IA)  52.17 
 
 
392 aa  393  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.16531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
391 aa  391  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.172514  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3776  acetyl-CoA acetyltransferases  50.64 
 
 
396 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3043  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
391 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3054  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
396 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2187  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
392 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5988  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 
393 aa  388  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304817 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0126  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524714  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0138  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
393 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.998438  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2794  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
391 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456608 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23913  acetyl-coa c-acetyltransferase  51.51 
 
 
396 aa  387  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0134  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
399 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.158877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2547  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 
395 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0458  acetyl-CoA acetyltransferases  50.38 
 
 
393 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.902718  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0732  acetyl-CoA acetyltransferase  52.05 
 
 
402 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1891  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.42 
 
 
391 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3149  phosphoryl transfer system, HPr  50.52 
 
 
392 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2835  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
391 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05280  acetyl-CoA C-acetyltransferase, putative  53.47 
 
 
406 aa  380  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.875142  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  48.46 
 
 
392 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3781  acetyl-CoA acetyltransferase  50.39 
 
 
391 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.338969  normal  0.300645 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2215  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
397 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1378  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
391 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2868  thiolase  50.13 
 
 
396 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3523  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
397 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3456  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 
397 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614385  normal  0.375478 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3574  acetyl-CoA acetyltransferase  48.46 
 
 
392 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384269  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1841  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 
397 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219092  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3602  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
394 aa  371  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.324693 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4368  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 
394 aa  371  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1788  hypothetical protein  48.97 
 
 
394 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1789  hypothetical protein  49.49 
 
 
394 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3031  thiolase  50.39 
 
 
402 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.589466  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3662  acetyl-CoA acetyltransferase  47.06 
 
 
391 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3575  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
395 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313168  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1719  thiolase  49.1 
 
 
391 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000100709  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0344  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
397 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 
393 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2306  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.39 
 
 
398 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4187  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.35 
 
 
393 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  47.37 
 
 
399 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.127109 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  48.08 
 
 
392 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0697  acetyl-CoA acetyltransferases  47.41 
 
 
395 aa  372  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.723631  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3202  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 
400 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.573759  hitchhiker  0.000000552223 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2010  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 
397 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0096  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 
397 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.825605  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5347  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 
396 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0980846 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1073  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 
394 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0579  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 
397 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3302  thiolase  49.1 
 
 
391 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0417  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 
397 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
393 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2277  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 
397 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1182  putative acyl-CoA thiolase  46.55 
 
 
391 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4383  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 
395 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.325311  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  47.19 
 
 
391 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 
397 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  47.31 
 
 
392 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0965  acetyl-CoA acetyltransferase  48.58 
 
 
394 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6652  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.36 
 
 
396 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408769  normal  0.0141058 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  47.83 
 
 
393 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2907  acetyl-CoA acetyltransferases  49.74 
 
 
393 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  47.57 
 
 
393 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  48.08 
 
 
393 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4732  acetyl-CoA acetyltransferase  47.96 
 
 
394 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1441  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.21 
 
 
393 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0922147 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  48.09 
 
 
393 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
393 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
393 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  48.09 
 
 
393 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5725  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 
396 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5969  acetyl-CoA acetyltransferases  49.1 
 
 
396 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.661429 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
392 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  47.18 
 
 
393 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
393 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  48.09 
 
 
393 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  46.92 
 
 
393 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3164  acetyl-CoA acetyltransferase  48.07 
 
 
402 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.783453  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4941  acetyl-CoA acetyltransferase  48.06 
 
 
396 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  46.92 
 
 
393 aa  365  1e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0178  acetyl-CoA acetyltransferase  49.61 
 
 
396 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>