More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1841 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2215  acetyl-CoA acetyltransferase  97.73 
 
 		 397 aa  788    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3523  acetyl-CoA acetyltransferase  97.23 
 
 		 397 aa  785    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2868  thiolase  80.3 
 
 		 396 aa  664    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1841  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 397 aa  803    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219092  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3456  acetyl-CoA acetyltransferase  95.72 
 
 		 397 aa  772    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614385  normal  0.375478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3164  acetyl-CoA acetyltransferase  75.57 
 
 		 402 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.783453  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2547  acetyl-CoA acetyltransferase  74.87 
 
 		 395 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3031  thiolase  77.04 
 
 		 402 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.589466  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3107  acetyl-CoA acetyltransferase  74.1 
 
 		 396 aa  587  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31530  putative acyl-CoA thiolase  74.23 
 
 		 396 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812461  hitchhiker  0.0000999697 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2683  putative acyl-CoA thiolase  73.47 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0612266  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5725  acetyl-CoA acetyltransferase  72.56 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3105  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  73.35 
 
 		 395 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0273238 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5969  acetyl-CoA acetyltransferases  72.31 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.661429 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5347  acetyl-CoA acetyltransferase  72.82 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0980846 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6652  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  71.54 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408769  normal  0.0141058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2036  acetyl-CoA acetyltransferase  69.54 
 
 		 395 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.657268 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4665  acetyl-CoA acetyltransferase  72.01 
 
 		 398 aa  568  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226383  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4383  acetyl-CoA acetyltransferase  72.31 
 
 		 395 aa  564  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.325311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1599  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  73.08 
 
 		 396 aa  564  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462018  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6232  acetyl-CoA acetyltransferases  73.08 
 
 		 396 aa  564  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  normal  0.0748804 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6708  acetyl-CoA acetyltransferase  73.08 
 
 		 396 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331471  normal  0.555202 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0732  acetyl-CoA acetyltransferase  68.45 
 
 		 402 aa  556  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6505  acetyl-CoA acetyltransferase  72.59 
 
 		 395 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.41485  normal  0.431537 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4941  acetyl-CoA acetyltransferase  69.15 
 
 		 396 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0448  acetyl-CoA acetyltransferase  73.33 
 
 		 396 aa  550  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0178  acetyl-CoA acetyltransferase  68.77 
 
 		 396 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0392  acetyl-CoA acetyltransferase  73.08 
 
 		 396 aa  549  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0344  acetyl-CoA acetyltransferase  67.34 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0417  acetyl-CoA acetyltransferase  68.37 
 
 		 397 aa  534  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2277  acetyl-CoA acetyltransferase  68.37 
 
 		 397 aa  534  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0096  acetyl-CoA acetyltransferase  68.37 
 
 		 397 aa  534  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.825605  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0579  acetyl-CoA acetyltransferase  68.37 
 
 		 397 aa  534  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  68.11 
 
 		 397 aa  534  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2010  acetyl-CoA acetyltransferase  68.37 
 
 		 397 aa  534  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0461  acetyl-CoA acetyltransferase  67.01 
 
 		 397 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.843393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0126  acetyl-CoA acetyltransferase  66.67 
 
 		 393 aa  531  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4255  acetyl-CoA acetyltransferase  66.24 
 
 		 402 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0134  acetyl-CoA acetyltransferase  66.41 
 
 		 393 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2907  acetyl-CoA acetyltransferases  68.37 
 
 		 393 aa  529  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0276  acetyl-CoA acetyltransferase  66.07 
 
 		 393 aa  523  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00380599  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07370  Thiolase  67.43 
 
 		 395 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182394  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0106  acetyl-CoA acetyltransferase  65.32 
 
 		 394 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5096  acetyl-CoA acetyltransferase  67.69 
 
 		 395 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.97471 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  64.45 
 
 		 399 aa  514  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0138  acetyl-CoA acetyltransferase  64.03 
 
 		 393 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.998438  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0098  thiolase  64.3 
 
 		 396 aa  504  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3085  acetyl-CoA acetyltransferase  68.45 
 
 		 398 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.833369  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3980  acetyl-CoA acetyltransferase  68.8 
 
 		 390 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3602  acetyl-CoA acetyltransferase  63.96 
 
 		 394 aa  504  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.324693 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0965  acetyl-CoA acetyltransferase  62.72 
 
 		 394 aa  499  1e-140  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1946  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  66.92 
 
 		 406 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1073  acetyl-CoA acetyltransferase  62.47 
 
 		 394 aa  499  1e-140  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3149  phosphoryl transfer system, HPr  62.76 
 
 		 392 aa  500  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5943  thiolase  64.63 
 
 		 400 aa  494  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3776  acetyl-CoA acetyltransferases  61.62 
 
 		 396 aa  495  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3054  acetyl-CoA acetyltransferase  61.62 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3940  hypothetical protein  66.5 
 
 		 386 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.798805 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3921  acetyl-CoA acetyltransferases  67.51 
 
 		 386 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5988  acetyl-CoA acetyltransferase  62.76 
 
 		 393 aa  488  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304817 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3184  putative thiolase  67.26 
 
 		 386 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4368  acetyl-CoA acetyltransferase  61.93 
 
 		 394 aa  489  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0067  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  64.34 
 
 		 390 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1182  putative acyl-CoA thiolase  63.24 
 
 		 391 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0458  acetyl-CoA acetyltransferases  62.5 
 
 		 393 aa  487  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.902718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4050  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  63.5 
 
 		 387 aa  487  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1788  hypothetical protein  59.64 
 
 		 394 aa  483  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1667  acetyl-CoA acetyltransferase  61.54 
 
 		 396 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00240927  normal  0.0395085 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1789  hypothetical protein  59.64 
 
 		 394 aa  478  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4187  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  60.97 
 
 		 393 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1001  acetyl-CoA acetyltransferase  61.32 
 
 		 400 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1375  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  61.5 
 
 		 392 aa  478  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.692424  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13090  putative acyl-CoA thiolase  63.24 
 
 		 391 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1943  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  60.36 
 
 		 396 aa  475  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3662  acetyl-CoA acetyltransferase  61.44 
 
 		 391 aa  477  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4732  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 		 394 aa  477  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1473  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  59.59 
 
 		 396 aa  472  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066272 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1525  acetyl-CoA acetyltransferase  60.77 
 
 		 396 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6128  acetyl-CoA acetyltransferase  59.09 
 
 		 389 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0513705 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3306  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  60.51 
 
 		 395 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0781  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  58.27 
 
 		 395 aa  472  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  60.98 
 
 		 396 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.184491  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1397  acetyl-CoA acetyltransferase  60.26 
 
 		 396 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1605  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 		 394 aa  468  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2856  acetyl-CoA acetyltransferase  60.51 
 
 		 396 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.700785  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1495  acetyl-CoA acetyltransferase  60.51 
 
 		 396 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2597  acetyl-CoA acetyltransferases  60.51 
 
 		 396 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124801  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1489  acetyl-CoA acetyltransferase  60 
 
 		 396 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2771  acetyl-CoA acetyltransferases  60 
 
 		 396 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384582 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4205  acetyl-CoA acetyltransferase  60.86 
 
 		 395 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000900361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3839  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  60.1 
 
 		 397 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2923  acetyl-CoA acetyltransferases  59.64 
 
 		 394 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2664  acetyl-CoA acetyltransferases  60.51 
 
 		 396 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.304657  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1677  acetyl-CoA acetyltransferase  59.69 
 
 		 396 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3575  acetyl-CoA acetyltransferase  58.57 
 
 		 395 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313168  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1891  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  60.93 
 
 		 391 aa  462  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3202  acetyl-CoA acetyltransferase  58.4 
 
 		 400 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.573759  hitchhiker  0.000000552223 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02410  acetyl-CoA acetyltransferase with thiolase domain  58.38 
 
 		 416 aa  463  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0074  acetyl-CoA acetyltransferase  64.08 
 
 		 392 aa  461  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1338  acetyl-CoA acetyltransferases  58.4 
 
 		 396 aa  461  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.671481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>