More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3306 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3306  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  100 
 
 		 395 aa  795    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3575  acetyl-CoA acetyltransferase  84.91 
 
 		 395 aa  679    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313168  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5144  acetyl-CoA acetyltransferase  72.56 
 
 		 400 aa  554  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227388  normal  0.833116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3105  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  65.38 
 
 		 395 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0273238 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5969  acetyl-CoA acetyltransferases  64.72 
 
 		 396 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.661429 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3107  acetyl-CoA acetyltransferase  64.19 
 
 		 396 aa  505  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.218228  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5725  acetyl-CoA acetyltransferase  64.72 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4187  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  62.66 
 
 		 393 aa  502  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2547  acetyl-CoA acetyltransferase  62.82 
 
 		 395 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5988  acetyl-CoA acetyltransferase  62.66 
 
 		 393 aa  500  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304817 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0134  acetyl-CoA acetyltransferase  63.43 
 
 		 393 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5347  acetyl-CoA acetyltransferase  64.97 
 
 		 396 aa  498  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0980846 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0732  acetyl-CoA acetyltransferase  62.22 
 
 		 402 aa  499  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0458  acetyl-CoA acetyltransferases  62.92 
 
 		 393 aa  495  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.902718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0126  acetyl-CoA acetyltransferase  62.92 
 
 		 393 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524714  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0276  acetyl-CoA acetyltransferase  62.66 
 
 		 393 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00380599  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3602  acetyl-CoA acetyltransferase  61.79 
 
 		 394 aa  491  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.324693 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4665  acetyl-CoA acetyltransferase  65.55 
 
 		 398 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226383  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4941  acetyl-CoA acetyltransferase  63.01 
 
 		 396 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3054  acetyl-CoA acetyltransferase  61.28 
 
 		 396 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3776  acetyl-CoA acetyltransferases  61.18 
 
 		 396 aa  491  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4368  acetyl-CoA acetyltransferase  61.18 
 
 		 394 aa  490  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6652  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  64.03 
 
 		 396 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408769  normal  0.0141058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0461  acetyl-CoA acetyltransferase  60.93 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.843393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3839  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  61.52 
 
 		 397 aa  491  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0417  acetyl-CoA acetyltransferase  61.7 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0096  acetyl-CoA acetyltransferase  61.7 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.825605  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0579  acetyl-CoA acetyltransferase  61.7 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2277  acetyl-CoA acetyltransferase  61.7 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0178  acetyl-CoA acetyltransferase  60.15 
 
 		 396 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0344  acetyl-CoA acetyltransferase  61.18 
 
 		 397 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2010  acetyl-CoA acetyltransferase  61.7 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4383  acetyl-CoA acetyltransferase  65.99 
 
 		 395 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.325311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  61.44 
 
 		 397 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2036  acetyl-CoA acetyltransferase  62.31 
 
 		 395 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.657268 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1677  acetyl-CoA acetyltransferase  60.87 
 
 		 396 aa  483  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2771  acetyl-CoA acetyltransferases  61.76 
 
 		 396 aa  481  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384582 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4255  acetyl-CoA acetyltransferase  60.77 
 
 		 402 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  60.36 
 
 		 399 aa  482  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158877 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2597  acetyl-CoA acetyltransferases  61.76 
 
 		 396 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124801  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2664  acetyl-CoA acetyltransferases  62.02 
 
 		 396 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.304657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6232  acetyl-CoA acetyltransferases  64.72 
 
 		 396 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  normal  0.0748804 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1788  hypothetical protein  60.15 
 
 		 394 aa  479  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1001  acetyl-CoA acetyltransferase  60.15 
 
 		 400 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1599  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  64.72 
 
 		 396 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462018  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1397  acetyl-CoA acetyltransferase  60.61 
 
 		 396 aa  476  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0448  acetyl-CoA acetyltransferase  64.45 
 
 		 396 aa  476  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1789  hypothetical protein  59.9 
 
 		 394 aa  474  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0392  acetyl-CoA acetyltransferase  64.45 
 
 		 396 aa  476  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4732  acetyl-CoA acetyltransferase  59.18 
 
 		 394 aa  477  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6708  acetyl-CoA acetyltransferase  64.97 
 
 		 396 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.331471  normal  0.555202 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6128  acetyl-CoA acetyltransferase  61.28 
 
 		 389 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0513705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2868  thiolase  61.03 
 
 		 396 aa  477  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4050  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  60 
 
 		 387 aa  478  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0106  acetyl-CoA acetyltransferase  61.18 
 
 		 394 aa  477  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1525  acetyl-CoA acetyltransferase  60.61 
 
 		 396 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1489  acetyl-CoA acetyltransferase  60.61 
 
 		 396 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2856  acetyl-CoA acetyltransferase  60.36 
 
 		 396 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.700785  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0138  acetyl-CoA acetyltransferase  59.08 
 
 		 393 aa  472  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.998438  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1841  acetyl-CoA acetyltransferase  60.51 
 
 		 397 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219092  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1495  acetyl-CoA acetyltransferase  60.36 
 
 		 396 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2215  acetyl-CoA acetyltransferase  60.51 
 
 		 397 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1473  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  59.85 
 
 		 396 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3456  acetyl-CoA acetyltransferase  60.51 
 
 		 397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614385  normal  0.375478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3523  acetyl-CoA acetyltransferase  60.26 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1073  acetyl-CoA acetyltransferase  58.42 
 
 		 394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3202  acetyl-CoA acetyltransferase  59.34 
 
 		 400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.573759  hitchhiker  0.000000552223 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3164  acetyl-CoA acetyltransferase  61.44 
 
 		 402 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.783453  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5096  acetyl-CoA acetyltransferase  62.47 
 
 		 395 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.97471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  59.69 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.184491  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6505  acetyl-CoA acetyltransferase  64.29 
 
 		 395 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.41485  normal  0.431537 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1375  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  60.72 
 
 		 392 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.692424  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0965  acetyl-CoA acetyltransferase  57.91 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1943  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  59.43 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3940  hypothetical protein  64.1 
 
 		 386 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546024  normal  0.798805 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2907  acetyl-CoA acetyltransferases  62.4 
 
 		 393 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0067  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  59.54 
 
 		 390 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1338  acetyl-CoA acetyltransferases  58.66 
 
 		 396 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.671481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2683  putative acyl-CoA thiolase  60 
 
 		 396 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0612266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31530  putative acyl-CoA thiolase  60 
 
 		 396 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812461  hitchhiker  0.0000999697 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3031  thiolase  61.95 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.589466  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0074  acetyl-CoA acetyltransferase  60.93 
 
 		 392 aa  458  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3149  phosphoryl transfer system, HPr  57.8 
 
 		 392 aa  458  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1667  acetyl-CoA acetyltransferase  58.91 
 
 		 396 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00240927  normal  0.0395085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3980  acetyl-CoA acetyltransferase  64.78 
 
 		 390 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07370  Thiolase  62.56 
 
 		 395 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182394  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1331  acetyl-CoA acetyltransferases  61.18 
 
 		 397 aa  455  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349273 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2306  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  58.46 
 
 		 398 aa  451  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3921  acetyl-CoA acetyltransferases  63.33 
 
 		 386 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3085  acetyl-CoA acetyltransferase  60.38 
 
 		 398 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.833369  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1891  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  59.64 
 
 		 391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3184  putative thiolase  62.82 
 
 		 386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0781  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  56.41 
 
 		 395 aa  444  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2011  acetyl-CoA acetyltransferase  55.13 
 
 		 393 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271302  normal  0.806443 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0697  acetyl-CoA acetyltransferases  56.38 
 
 		 395 aa  439  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.723631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1182  putative acyl-CoA thiolase  57.03 
 
 		 391 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4205  acetyl-CoA acetyltransferase  56.41 
 
 		 395 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000900361 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000375  3-ketoacyl-CoA thiolase (isoleucine degradation)  53.96 
 
 		 392 aa  435  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.587204  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2923  acetyl-CoA acetyltransferases  58.25 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13090  putative acyl-CoA thiolase  58.06 
 
 		 391 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>