More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11853 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11853  probable acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
392 aa  798    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359273  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4612  acetyl-CoA acetyltransferase  78.26 
 
 
392 aa  629  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000000000297368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6443  acetyl-CoA acetyltransferase  61.7 
 
 
392 aa  488  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2669  acetyl-CoA acetyltransferase  61.6 
 
 
391 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.415213  normal  0.441381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2430  acetyl-CoA acetyltransferase  61.48 
 
 
393 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2901  acetyl-CoA acetyltransferase  62.86 
 
 
395 aa  465  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255971  normal  0.0133892 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1910  acetyl-CoA acetyltransferase  57.95 
 
 
393 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.126312 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1504  acetyl-CoA acetyltransferase  56.67 
 
 
393 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0543686  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31707  acetyl-CoA acetyltransferase  58.31 
 
 
404 aa  441  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.234055  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2365  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  56.92 
 
 
393 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01409  acetyl-CoA acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04000)  56.92 
 
 
399 aa  428  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0687674 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23913  acetyl-coa c-acetyltransferase  56.85 
 
 
396 aa  429  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1594  acetyl-CoA acetyltransferase  55.9 
 
 
393 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1499  acetyl-CoA acetyltransferase  55.64 
 
 
393 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67034  Acetyl-CoA acetyltransferase IA (Peroxisomal acetoacetyl-CoA thiolase) (Thiolase IA)  51.54 
 
 
392 aa  402  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.16531 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05280  acetyl-CoA C-acetyltransferase, putative  53.57 
 
 
406 aa  400  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.875142  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3149  phosphoryl transfer system, HPr  52.94 
 
 
392 aa  396  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0697  acetyl-CoA acetyltransferases  50.77 
 
 
395 aa  393  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.723631  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3781  acetyl-CoA acetyltransferase  54.1 
 
 
391 aa  388  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.338969  normal  0.300645 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10512  acetyl-CoA-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14200)  54.22 
 
 
435 aa  388  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 
393 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0276  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
393 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00380599  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1677  acetyl-CoA acetyltransferase  51.41 
 
 
396 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3202  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 
400 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.573759  hitchhiker  0.000000552223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2187  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
392 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1473  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.16 
 
 
396 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00066272 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1397  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 
396 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  51.41 
 
 
393 aa  378  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  50.52 
 
 
399 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.158877 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2597  acetyl-CoA acetyltransferases  51.41 
 
 
396 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124801  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2664  acetyl-CoA acetyltransferases  51.15 
 
 
396 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.304657  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1375  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.16 
 
 
392 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.692424  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2856  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
396 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.700785  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
393 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0732  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 
402 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  51.03 
 
 
393 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1489  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
396 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0126  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
393 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.524714  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
393 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
396 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.184491  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2771  acetyl-CoA acetyltransferases  51.41 
 
 
396 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384582 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
393 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1943  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.51 
 
 
396 aa  378  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 
393 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  51.41 
 
 
393 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 
393 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 
394 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1495  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
396 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 
393 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1525  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 
396 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1667  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
396 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00240927  normal  0.0395085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3602  acetyl-CoA acetyltransferase  51.55 
 
 
394 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.324693 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
393 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2036  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 
395 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.657268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
393 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
393 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1841  acetyl-CoA acetyltransferase  51.29 
 
 
397 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219092  normal  0.268333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
393 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0134  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 
393 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
393 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1338  acetyl-CoA acetyltransferases  50.13 
 
 
396 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.671481  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
393 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2215  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 
397 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
392 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0138  acetyl-CoA acetyltransferase  48.47 
 
 
393 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.998438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
393 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3523  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 
397 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
393 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  49.1 
 
 
390 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 
398 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02410  acetyl-CoA acetyltransferase with thiolase domain  51.28 
 
 
416 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3575  acetyl-CoA acetyltransferase  48.6 
 
 
395 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.313168  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 
393 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
394 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3456  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
397 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614385  normal  0.375478 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
393 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
393 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
394 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4205  acetyl-CoA acetyltransferase  48.84 
 
 
395 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000900361 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
393 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  47.57 
 
 
392 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5988  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
393 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304817 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  48.08 
 
 
392 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
394 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
393 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
393 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
391 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
393 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
392 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2955  acetyl-CoA acetyltransferase  53.35 
 
 
391 aa  364  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000192341  hitchhiker  0.000874312 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 
392 aa  364  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  0.0000152049 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
392 aa  364  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  51.41 
 
 
392 aa  363  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2868  thiolase  50.52 
 
 
396 aa  363  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.106284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 
393 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
392 aa  363  4e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0106  acetyl-CoA acetyltransferase  48.45 
 
 
394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6128  acetyl-CoA acetyltransferase  51.29 
 
 
389 aa  362  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0513705 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1891  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.35 
 
 
391 aa  362  6e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 
393 aa  362  8e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>