43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4325 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4866  acetyl-CoA acetyltransferase  71.68 
 
 		 509 aa  713    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48661  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1869  acetyl-CoA acetyltransferase  72.44 
 
 		 509 aa  718    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.02103 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4411  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 509 aa  1020    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4705  acetyl-CoA acetyltransferase  98.62 
 
 		 509 aa  1007    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4325  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 509 aa  1020    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.93 
 
 		 797 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  43.84 
 
 		 510 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3240  acetyl-CoA acetyltransferase  36.25 
 
 		 517 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1476  acetyl-CoA acetyltransferase  35.73 
 
 		 506 aa  228  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2792  acetyl-CoA acetyltransferase  31.96 
 
 		 492 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  31.96 
 
 		 492 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2819  acetyl-CoA acetyltransferase  32.74 
 
 		 492 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0575944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11895  acetyl-CoA acetyltransferase  33.01 
 
 		 494 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.220519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  33.08 
 
 		 491 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3340  acetyl-CoA acetyltransferase  33.27 
 
 		 491 aa  212  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0178545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4625  acetyl-CoA acetyltransferase  34.93 
 
 		 439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3224  acetyl-CoA acetyltransferase  34.22 
 
 		 474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3235  acetyl-CoA acetyltransferase  34.22 
 
 		 474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.650899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3286  acetyl-CoA acetyltransferase  34.22 
 
 		 474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8290  acetyl-coenzyme A synthetase  32.61 
 
 		 486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.502294  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05853  conserved hypothetical protein  36.06 
 
 		 477 aa  188  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00153276 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1809  acetyl-CoA acetyltransferase  32.56 
 
 		 498 aa  179  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1858  acetyl-CoA acetyltransferase  31.35 
 
 		 503 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1956  acetyl-CoA acetyltransferase  32.6 
 
 		 504 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797319  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2912  acetyl-CoA acetyltransferase  31.15 
 
 		 504 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20230  acetyl-CoA acetyltransferase  32.92 
 
 		 515 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00768675  normal  0.711797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3311  acetyl-CoA acetyltransferase  31.85 
 
 		 494 aa  146  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  30.48 
 
 		 503 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  26.57 
 
 		 382 aa  53.9  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  27.03 
 
 		 389 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1527  acetyl-CoA acetyltransferase  29.66 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340504  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1469  acetyl-CoA acetyltransferase  28.97 
 
 		 398 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.336544  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  25.21 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0743  lipid-transfer protein  23.41 
 
 		 389 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  25 
 
 		 379 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3832  lipid-transfer protein  25.24 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  25.37 
 
 		 391 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  28.75 
 
 		 389 aa  44.3  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  25.66 
 
 		 383 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  22.76 
 
 		 388 aa  43.9  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1655  acetyl-CoA acetyltransferases  27.42 
 
 		 443 aa  43.9  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00972339  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  23.43 
 
 		 388 aa  43.5  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  25.23 
 
 		 388 aa  43.5  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>