More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0587 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0587  transglutaminase domain-containing protein  100 
 
 		 571 aa  1183    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110498  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1902  transglutaminase domain protein  31.33 
 
 		 631 aa  210  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.37601  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  30.2 
 
 		 1305 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0389  transglutaminase domain protein  32.84 
 
 		 677 aa  79  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  32.14 
 
 		 274 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1966  transglutaminase domain-containing protein  28.7 
 
 		 742 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.524806  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6586  transglutaminase domain protein  32.64 
 
 		 730 aa  77.4  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615613  normal  0.702317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  34 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  31.58 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2203  membrane-bound protease, putative  30.77 
 
 		 742 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4178  transglutaminase domain-containing protein  30.92 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00683366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1117  transglutaminase domain protein  31.1 
 
 		 720 aa  73.9  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  30.13 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1927  transglutaminase superfamily protease  30.77 
 
 		 742 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0890481  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2146  transglutaminase-like  31.54 
 
 		 744 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360106  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1951  transglutaminase superfamily protease  30.77 
 
 		 742 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2272  putative membrane-bound protease  30.77 
 
 		 635 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1972  membrane-bound protease  30.77 
 
 		 742 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.608731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2155  putative membrane-bound protease  30.77 
 
 		 742 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2120  membrane-bound protease  30.77 
 
 		 742 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.901767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3615  transglutaminase domain protein  30.19 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.859951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3183  putative membrane-bound protease  31.47 
 
 		 742 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2132  putative membrane-bound protease  31.47 
 
 		 742 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  32.12 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  32.12 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3274  transglutaminase domain protein  34.35 
 
 		 792 aa  69.3  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1168  transglutaminase domain-containing protein  26.49 
 
 		 634 aa  69.3  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  35.42 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  29.09 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04340  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  27.51 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  32.99 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0628  transglutaminase domain protein  26.72 
 
 		 736 aa  67.4  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0435182 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  31.71 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  30.47 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2535  transglutaminase domain protein  28.22 
 
 		 748 aa  67  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0069  transglutaminase-like  25.83 
 
 		 303 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3524  transglutaminase domain-containing protein  28.89 
 
 		 352 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0116091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3240  transglutaminase domain-containing protein  28.05 
 
 		 492 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0138  transglutaminase domain protein  25.2 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.792413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0236  transglutaminase domain protein  31.21 
 
 		 728 aa  64.7  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  31.08 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  27.07 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  28.33 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0053  transglutaminase-like  29.87 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.538035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  32.88 
 
 		 273 aa  63.5  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2041  transglutaminase domain protein  26.27 
 
 		 336 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2855  transglutaminase domain protein  26.96 
 
 		 276 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0224006  normal  0.37841 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  29.83 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  27.07 
 
 		 338 aa  62.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25050  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  30.71 
 
 		 827 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.973327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4007  transglutaminase domain-containing protein  28.52 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.188369 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  27.84 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  28.1 
 
 		 361 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2845  transglutaminase domain protein  30.71 
 
 		 243 aa  62  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  26.73 
 
 		 336 aa  62  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1711  transglutaminase domain protein  30.71 
 
 		 806 aa  62  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3909  transglutaminase domain-containing protein  31.43 
 
 		 279 aa  62  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  27.84 
 
 		 367 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  34.41 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3887  transglutaminase domain protein  28.89 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.978849 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  31.41 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3361  transglutaminase domain-containing protein  30.88 
 
 		 515 aa  60.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  29.54 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  29.13 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0661  transglutaminase domain-containing protein  32.71 
 
 		 706 aa  60.5  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.233246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  34.34 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  33.78 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3081  transglutaminase-like protein  26.21 
 
 		 280 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3803  transglutaminase domain protein  29.77 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  27.27 
 
 		 337 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0862  transglutaminase domain protein  30.81 
 
 		 649 aa  60.1  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4917  transglutaminase domain-containing protein  27.34 
 
 		 794 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.428939  normal  0.508817 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  27.24 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  33.33 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  28.76 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  24.79 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1556  transglutaminase domain-containing protein  25.85 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  26.24 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2413  transglutaminase-like  29.57 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329453  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  32.37 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2668  transglutaminase domain-containing protein  32.26 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0332836  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3938  transglutaminase domain protein  30.95 
 
 		 743 aa  58.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.344249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65050  hypothetical protein  31.86 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00894338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  35.48 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  26.19 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3586  transglutaminase domain-containing protein  31.5 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2938  transglutaminase domain protein  26.97 
 
 		 810 aa  57.4  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00806271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4224  transglutaminase domain protein  28.86 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.849724  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  34.78 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3460  transglutaminase domain-containing protein  35.16 
 
 		 822 aa  57.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0458672 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  36.73 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  32.2 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  29.33 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  29.53 
 
 		 270 aa  57  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  28.9 
 
 		 276 aa  57  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>