197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1360 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1171  reductive dehalogenase, putative  96.8 
 
 		 532 aa  1026    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0464828  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  96.05 
 
 		 532 aa  1036    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1360  reductive dehalogenase  100 
 
 		 532 aa  1108    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2620  reductive dehalogenase  33.77 
 
 		 345 aa  206  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2103  hypothetical protein  29.68 
 
 		 507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.66471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0713  reductive dehalogenase  31.87 
 
 		 458 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0711  reductive dehalogenase  30.98 
 
 		 488 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189708  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1349  reductive dehalogenase  25.41 
 
 		 461 aa  115  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0737  reductive dehalogenase  30.66 
 
 		 445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0132568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0689  reductive dehalogenase  33.07 
 
 		 463 aa  114  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0693  reductive dehalogenase  26.5 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2100  tetrachloroethene dehalogenase  32.13 
 
 		 474 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1729  tetrachloroethene dehalogenase  33.22 
 
 		 472 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000209595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3769  hypothetical protein  28.16 
 
 		 468 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_169  reductive dehalogenase  24.18 
 
 		 455 aa  98.6  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.764081  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0173  reductive dehalogenase  27.44 
 
 		 455 aa  98.2  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0180  reductive dehalogenase, putative  27.69 
 
 		 455 aa  97.4  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1538  reductive dehalogenase, putative  28.5 
 
 		 492 aa  97.4  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.308887  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0331  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.58 
 
 		 491 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0696  reductive dehalogenase  27.15 
 
 		 550 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000940573  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1430  reductive dehalogenase  28.04 
 
 		 492 aa  94  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0343  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.14 
 
 		 484 aa  93.6  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1353  reductive dehalogenase  33.51 
 
 		 514 aa  92.8  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0302  reductive dehalogenase, putative  33.7 
 
 		 514 aa  92.8  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0924005  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0355  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.41 
 
 		 474 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0121  reductive dehalogenase  32.61 
 
 		 514 aa  90.9  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1968  reductive dehalogenase  26.67 
 
 		 399 aa  90.5  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.821094  normal  0.460125 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0281  reductive dehalogenase  35.12 
 
 		 470 aa  90.1  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0079  trichloroethene reductive dehalogenase  29.36 
 
 		 554 aa  89.4  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00164109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2872  reductive dehalogenase  25.76 
 
 		 514 aa  88.2  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.111424  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_99  reductive dehalogenase  33.93 
 
 		 470 aa  87.8  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2870  reductive dehalogenase  25.76 
 
 		 514 aa  88.2  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0453791  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4120  hypothetical protein  26.09 
 
 		 489 aa  87.4  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00634153  normal  0.015035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  28.74 
 
 		 1069 aa  85.5  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0876  reductive dehalogenase, putative  28.96 
 
 		 510 aa  85.1  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.177849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_104  reductive dehalogenase  29.73 
 
 		 523 aa  83.6  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0276  reductive dehalogenase  28.36 
 
 		 523 aa  83.6  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1421  reductive dehalogenase  30.51 
 
 		 475 aa  82  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0329  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.84 
 
 		 640 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.09 
 
 		 640 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1263  reductive dehalogenase  26.6 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  27.63 
 
 		 1070 aa  79.7  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1327  reductive dehalogenase  32.97 
 
 		 499 aa  79.7  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0104  reductive dehalogenase  27.49 
 
 		 515 aa  79.7  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0353  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.09 
 
 		 640 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200551  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_88  reductive dehalogenase  29.44 
 
 		 512 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0296  reductive dehalogenase  30.3 
 
 		 512 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0794176  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1545  reductive dehalogenase, putative  25.41 
 
 		 500 aa  77.4  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1347  reductive dehalogenase  25.27 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0235  reductive dehalogenase, putative  32.22 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1436  reductive dehalogenase  23.76 
 
 		 523 aa  77  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1559  reductive dehalogenase, putative  30.46 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.206091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1402  reductive dehalogenase  33.33 
 
 		 499 aa  76.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00204674  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0112  reductive dehalogenase  32.56 
 
 		 506 aa  76.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0311  reductive dehalogenase, putative  25.84 
 
 		 515 aa  75.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1344  reductive dehalogenase  31.14 
 
 		 488 aa  75.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1342  reductive dehalogenase  31.31 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0306  reductive dehalogenase, putative  31.55 
 
 		 505 aa  72.4  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00204473  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1314  reductive dehalogenase  29.19 
 
 		 481 aa  72.8  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1291  vinyl chloride reductive dehalogenase  27.78 
 
 		 519 aa  69.7  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1387  reductive dehalogenase  29.89 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.54917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_82  reductive dehalogenase  34.17 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1260  reductive dehalogenase  29.82 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1427  reductive dehalogenase  29.82 
 
 		 496 aa  67.8  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0173  reductive dehalogenase, putative  25.43 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1535  reductive dehalogenase, putative  31.68 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0185962  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1340  reductive dehalogenase  29.89 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1324  reductive dehalogenase  29.76 
 
 		 493 aa  63.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0687887  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0119  reductive dehalogenase  32.5 
 
 		 480 aa  63.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1399  reductive dehalogenase  30.43 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0618677  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1316  reductive dehalogenase  31.06 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1336  reductive dehalogenase  29.05 
 
 		 496 aa  62.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1371  reductive dehalogenase  24.26 
 
 		 505 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_96  reductive dehalogenase  29.05 
 
 		 496 aa  62.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0284  reductive dehalogenase  29.61 
 
 		 496 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0007  4Fe-4S cluster binding  33.33 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10760  iron-sulfur cluster binding protein, putative  25.31 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00274595  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0847  reductive dehalogenase  23.1 
 
 		 516 aa  60.8  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1364  reductive dehalogenase  28.65 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1528  reductive dehalogenase, putative  29.21 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.636917  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0199  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.94 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1329  reductive dehalogenase  28.49 
 
 		 473 aa  60.1  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0176  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.97 
 
 		 282 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0030917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1522  reductive dehalogenase, putative  28.16 
 
 		 507 aa  59.3  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.664066  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1378  reductive dehalogenase  27.4 
 
 		 508 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1383  reductive dehalogenase  32.17 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1519  reductive dehalogenase, putative  26.78 
 
 		 505 aa  56.6  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.639229  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1334  hypothetical protein  26.58 
 
 		 312 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0007  4Fe-4S cluster binding  30.83 
 
 		 321 aa  55.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00061  hypothetical protein  26.58 
 
 		 312 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1393  reductive dehalogenase  28.12 
 
 		 495 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00328103  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0340  4Fe-4S cluster binding protein  29.63 
 
 		 368 aa  55.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246127  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1375  reductive dehalogenase  26.23 
 
 		 505 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3314  iron-sulfur cluster binding protein  31.09 
 
 		 392 aa  54.3  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.117611  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_002936  DET0318  reductive dehalogenase, putative  26.16 
 
 		 495 aa  53.9  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.82363  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0490  iron-sulfur cluster binding protein  29.41 
 
 		 380 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.414989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3394  uncharacterized Fe-S protein  28.98 
 
 		 229 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.145168  normal  0.150282 
 
 
-
 
NC_002936  DET0088  reductive dehalogenase domain-containing protein  26.13 
 
 		 153 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0721794  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1302  iron-sulfur cluster binding protein, putative  30 
 
 		 373 aa  52.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2775  putative iron-sulfur cluster binding protein  29.41 
 
 		 362 aa  52  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.886764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>