67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4917 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4917  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 214 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000226435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0830  hypothetical protein  31.16 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000551764  normal  0.344384 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0451  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.13 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000076324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1097  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 543 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2204  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0332088  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0037  tetratricopeptide TPR_2  28.44 
 
 		 466 aa  48.5  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3296  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173177  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 878 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  25.32 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.17 
 
 		 256 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  24.14 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.28 
 
 		 810 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 297 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 297 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 265 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.58 
 
 		 2240 aa  45.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 762 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 187 aa  45.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0957  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 161 aa  45.4  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000843973  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 		 313 aa  45.1  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 250 aa  45.1  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1981  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 		 391 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804142 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.13 
 
 		 882 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  24.52 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.84 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  25.45 
 
 		 340 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.72 
 
 		 1838 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 287 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 391 aa  43.5  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  31.4 
 
 		 324 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 		 291 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3320  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 180 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  36.21 
 
 		 612 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  51.28 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00051  Flp pilus assembly protein TadD  26.57 
 
 		 297 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 597 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.96 
 
 		 1056 aa  42.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0987  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.33 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00201205  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0070  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000134059  normal  0.0131239 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 		 409 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0438  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 164 aa  42.4  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000401129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 		 647 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.96 
 
 		 208 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36370  predicted protein  32.18 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.08989  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 466 aa  42.4  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2908  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 203 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0479  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 265 aa  42  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2555  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 728 aa  42  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2600  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 223 aa  42  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 686 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28.68 
 
 		 795 aa  41.6  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40310  type IV pilus biogenesis protein PilF  35.14 
 
 		 252 aa  42  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 		 277 aa  42  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 		 718 aa  42  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  27.01 
 
 		 732 aa  41.6  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0757  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 222 aa  41.6  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20251  hypothetical protein  33.73 
 
 		 573 aa  41.6  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.625545 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1897  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 598 aa  41.6  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00502769  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 566 aa  41.6  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0006  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 293 aa  41.6  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>