217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_20251 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_20251  hypothetical protein  100 
 
 
573 aa  1193    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.625545 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  24.49 
 
 
661 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
878 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.16 
 
 
810 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
512 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  33.96 
 
 
1694 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.9 
 
 
632 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
1737 aa  70.1  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.22 
 
 
620 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.27 
 
 
586 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 
620 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 
486 aa  67.4  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.61 
 
 
707 aa  67  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  25.66 
 
 
833 aa  66.6  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 
1276 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.32 
 
 
725 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
594 aa  64.7  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  28.92 
 
 
682 aa  64.3  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  27.95 
 
 
566 aa  63.9  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.59 
 
 
878 aa  63.9  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  26.52 
 
 
560 aa  63.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
892 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
3172 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  28.76 
 
 
573 aa  62.4  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 
4079 aa  62  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  26.06 
 
 
750 aa  61.6  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
356 aa  61.6  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
3145 aa  61.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 
448 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.25 
 
 
397 aa  60.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 
1371 aa  60.8  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
3560 aa  60.5  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
315 aa  59.7  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 
3035 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
634 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.95 
 
 
293 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  26.21 
 
 
1014 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.92 
 
 
626 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.75 
 
 
878 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1345  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
332 aa  57.4  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.59 
 
 
576 aa  57.4  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.43 
 
 
292 aa  57  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
1061 aa  57  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
414 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.88 
 
 
887 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
927 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
602 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.88 
 
 
358 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 
279 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
452 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 
265 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 
595 aa  55.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 
374 aa  55.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  33.76 
 
 
1013 aa  55.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.94 
 
 
565 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.51 
 
 
758 aa  54.7  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 
824 aa  54.7  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
1121 aa  54.3  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 
968 aa  53.9  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
626 aa  53.5  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30 
 
 
863 aa  53.5  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 
543 aa  53.9  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.74 
 
 
764 aa  53.9  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  26 
 
 
340 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 
1827 aa  53.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
767 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 
4489 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  22.58 
 
 
955 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
423 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 
258 aa  52.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 
784 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  29.24 
 
 
452 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 
1297 aa  52.8  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
804 aa  52.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.29 
 
 
3301 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 
245 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
711 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  29.24 
 
 
780 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  29.93 
 
 
436 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  22.4 
 
 
1266 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1669  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.99 
 
 
476 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42993  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 
402 aa  51.6  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 
1096 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  25.33 
 
 
889 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.76 
 
 
626 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.76 
 
 
626 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 
614 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.76 
 
 
614 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3352  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 
404 aa  51.2  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000220615  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 
614 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.76 
 
 
614 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25.17 
 
 
1007 aa  50.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 
614 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  27.33 
 
 
561 aa  50.4  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  27.33 
 
 
561 aa  50.8  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 
635 aa  50.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 
635 aa  50.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.16 
 
 
622 aa  50.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
344 aa  50.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2252  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 
188 aa  50.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>