More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3528 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  100 
 
 		 586 aa  1189    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  45.64 
 
 		 553 aa  466  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  43.59 
 
 		 558 aa  465  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  45.09 
 
 		 553 aa  465  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  45.54 
 
 		 555 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  44.62 
 
 		 871 aa  449  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  44.2 
 
 		 553 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  45.32 
 
 		 558 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  44.67 
 
 		 557 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  44.18 
 
 		 557 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  43.83 
 
 		 570 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  40.1 
 
 		 787 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  44.08 
 
 		 559 aa  436  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.71 
 
 		 568 aa  435  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  40.81 
 
 		 573 aa  432  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  42.34 
 
 		 556 aa  434  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  41.79 
 
 		 568 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  40.71 
 
 		 571 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  41.79 
 
 		 561 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  41.29 
 
 		 577 aa  427  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  42.8 
 
 		 891 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.53 
 
 		 568 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  40.65 
 
 		 562 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.5 
 
 		 568 aa  425  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  43.73 
 
 		 561 aa  424  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.92 
 
 		 568 aa  425  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  41 
 
 		 554 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  40.83 
 
 		 564 aa  422  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  40.07 
 
 		 563 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  41.32 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  41.64 
 
 		 568 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.24 
 
 		 568 aa  422  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  43.06 
 
 		 575 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.79 
 
 		 571 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.46 
 
 		 568 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  42.18 
 
 		 564 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  41.22 
 
 		 561 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  40.39 
 
 		 568 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  41.19 
 
 		 558 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  42.41 
 
 		 572 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.64 
 
 		 568 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  41.41 
 
 		 885 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.74 
 
 		 568 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.86 
 
 		 563 aa  413  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  41.29 
 
 		 571 aa  415  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  42.06 
 
 		 553 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  41.52 
 
 		 578 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  42.83 
 
 		 599 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  42.4 
 
 		 603 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  40 
 
 		 568 aa  402  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  42.76 
 
 		 599 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  42.83 
 
 		 599 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  40.89 
 
 		 570 aa  402  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  39.53 
 
 		 586 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  41.99 
 
 		 570 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  39.61 
 
 		 587 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  39.02 
 
 		 888 aa  402  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  39.6 
 
 		 561 aa  402  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  41.09 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  39.13 
 
 		 584 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  40 
 
 		 560 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.55 
 
 		 571 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  40.78 
 
 		 568 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  40.45 
 
 		 610 aa  393  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  49.48 
 
 		 503 aa  395  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  50.26 
 
 		 514 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  38.81 
 
 		 585 aa  392  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  49.48 
 
 		 499 aa  391  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  41.84 
 
 		 557 aa  392  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  49.22 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  40.14 
 
 		 612 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  48.97 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  44.44 
 
 		 520 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  38.99 
 
 		 586 aa  392  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  39.43 
 
 		 573 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  43.93 
 
 		 514 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  40.63 
 
 		 823 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  41.59 
 
 		 578 aa  385  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  40.86 
 
 		 563 aa  389  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  40.47 
 
 		 587 aa  386  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  38.99 
 
 		 577 aa  388  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  50.65 
 
 		 520 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  50.65 
 
 		 520 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  39.96 
 
 		 580 aa  383  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  49.22 
 
 		 523 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3344  type II secretion system protein E  39.43 
 
 		 586 aa  385  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0160309  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  38.11 
 
 		 570 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  49.74 
 
 		 417 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  48.96 
 
 		 521 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.97 
 
 		 569 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  48.7 
 
 		 521 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3859  type II secretion system protein E  39.19 
 
 		 568 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  40.08 
 
 		 577 aa  381  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  37.39 
 
 		 576 aa  380  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  48.96 
 
 		 521 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  48.96 
 
 		 514 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  48.96 
 
 		 521 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  40.04 
 
 		 552 aa  379  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.39 
 
 		 569 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2744  type II secretion system protein E  42.21 
 
 		 527 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.322952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>