More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0328 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0328  ABC transporter related  100 
 
 
204 aa  424  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1275  ABC transporter related  58.71 
 
 
199 aa  261  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1864  ABC transporter related  57.35 
 
 
205 aa  260  8.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2554  ABC transporter related  56.16 
 
 
212 aa  248  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0272018  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1341  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.25 
 
 
203 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0039  ABC transporter related  49.21 
 
 
202 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.118925  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0015  ABC transporter-like  46.23 
 
 
205 aa  210  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.794177  normal  0.0136608 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0212  ABC transporter-like  46 
 
 
209 aa  205  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2199  ABC transporter related  44.16 
 
 
200 aa  200  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0438677  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0191  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.88 
 
 
208 aa  198  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1325  ATPase  43.59 
 
 
200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525584  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1469  ABC transporter related protein  45.36 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1075  nickel ABC transporter, ATP-binding protein  49.13 
 
 
221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1129  ABC transporter related  49.13 
 
 
221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3551  nickel ABC transporter ATP-binding protein  49.13 
 
 
221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00474231  normal  0.0402539 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1380  ABC transporter ATP-binding protein  40.31 
 
 
196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1365  ATP-binding protein of ABC transport system  41.15 
 
 
196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290603  hitchhiker  0.00148941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1349  ATP-binding protein of ABC transport system  41.15 
 
 
196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000774102  normal  0.444548 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2102  ABC transporter ATP-binding protein  41.15 
 
 
196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000123245 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1921  ATP-binding protein of ABC transport system  41.15 
 
 
196 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000629617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3640  ABC transporter related  40.61 
 
 
198 aa  157  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3035  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 
215 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3070  ABC transporter related  38.35 
 
 
212 aa  145  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.024747  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1679  putative dipeptide ABC transporter  39.3 
 
 
196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2273  nickel transporter ATP-binding protein NikE  36.49 
 
 
277 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0306  ABC transporter-like protein  38.24 
 
 
216 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0885  oligopeptide/dipeptide ABC transporter  35.94 
 
 
322 aa  131  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0857  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.67 
 
 
558 aa  131  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0641  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 
230 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0446  ABC transporter related  31.36 
 
 
264 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.051216 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3778  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  34.63 
 
 
328 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3447  ABC transporter related  32.13 
 
 
282 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.491828 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3117  ABC type ATPase  34.83 
 
 
331 aa  129  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0682716 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.29 
 
 
323 aa  128  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3672  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.86 
 
 
305 aa  128  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1094  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.57 
 
 
332 aa  128  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00802536  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0672  ABC transporter related  34.16 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.92463  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5294  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  31.05 
 
 
549 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.26421  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1297  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.82 
 
 
342 aa  127  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  32.85 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.496272  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  35.9 
 
 
572 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.57 
 
 
564 aa  126  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0939  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.27 
 
 
355 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134085  normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0716  acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase-like protein  36.5 
 
 
305 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.699539 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0867  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.68 
 
 
338 aa  126  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0669  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.78 
 
 
344 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5293  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.09 
 
 
294 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0691  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.78 
 
 
344 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0219399 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4117  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
332 aa  125  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.725576  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  31.94 
 
 
543 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3139  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  34.38 
 
 
321 aa  124  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  33.04 
 
 
571 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1469  ABC transporter related  33.65 
 
 
233 aa  124  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0083934  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1440  ABC transporter related  33.65 
 
 
233 aa  124  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.926008  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.34 
 
 
260 aa  124  9e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2406  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.78 
 
 
744 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  32.16 
 
 
571 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1967  ABC transporter related protein  35.11 
 
 
220 aa  123  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.234063  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 
571 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0889  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.33 
 
 
338 aa  123  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  36.27 
 
 
538 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0204  ABC transporter related  37.76 
 
 
307 aa  122  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637035  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2116  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  35.75 
 
 
333 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0492101  normal  0.0207459 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3885  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.5 
 
 
326 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.171572  normal  0.0376469 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3547  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.02 
 
 
426 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877618  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  31.05 
 
 
541 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  32.41 
 
 
552 aa  122  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  31.63 
 
 
531 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1274  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
264 aa  122  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 
544 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  32.08 
 
 
545 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  30.94 
 
 
566 aa  122  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2236  ATPase  33.33 
 
 
554 aa  121  6e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.274783 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1029  ABC transporter related  35.5 
 
 
544 aa  121  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1234  ABC transporter related  33.94 
 
 
270 aa  121  6e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2964  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.97 
 
 
364 aa  121  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  33.66 
 
 
550 aa  121  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.14 
 
 
388 aa  121  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  33.64 
 
 
547 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1668  oligopeptidee ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
659 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  32.71 
 
 
547 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12500  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.84 
 
 
354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.96533  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0426  dipeptide transporter ATP-binding subunit  31.8 
 
 
317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.153009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  32.11 
 
 
322 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4045  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.09 
 
 
336 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.18 
 
 
326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0560  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.18 
 
 
334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.204279  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3764  nickel transporter ATP-binding protein NikE  32.52 
 
 
268 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0453  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.53 
 
 
336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.219882  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  30.77 
 
 
558 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.214566 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03329  nickel transporter subunit  32.52 
 
 
268 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0987  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.35 
 
 
318 aa  119  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000207029  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03282  hypothetical protein  32.52 
 
 
268 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3679  nickel transporter ATP-binding protein NikE  32.52 
 
 
268 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1611  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 
232 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4797  ABC transporter related  34.57 
 
 
565 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115874  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  33.17 
 
 
559 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2853  putative ATP-binding protein of oligopeptide ABC transporter  32.47 
 
 
323 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  33.17 
 
 
559 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0236  nickel transporter ATP-binding protein NikE  32.52 
 
 
268 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>