More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1274 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1274  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
264 aa  534  1e-151  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0185  ABC transporter related  63.46 
 
 
268 aa  328  6e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3390  ABC transporter related  62.69 
 
 
268 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0932  ABC transporter related  62.98 
 
 
273 aa  323  1e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.68534  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2149  ABC transporter related  61 
 
 
286 aa  311  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06710  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  59.62 
 
 
295 aa  309  4e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0686921  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08340  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  58.02 
 
 
264 aa  301  9e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.571186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2474  peptide ABC transporter ATP-binding protein  54.23 
 
 
329 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.279573  normal  0.0859764 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.67 
 
 
326 aa  257  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2722  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.61 
 
 
327 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2656  ABC transporter related  47.39 
 
 
552 aa  249  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.29 
 
 
327 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1777  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.74 
 
 
326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000396246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3307  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  46.92 
 
 
349 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.595916  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.49 
 
 
339 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.960319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8930  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.54 
 
 
337 aa  241  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0434  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.67 
 
 
328 aa  241  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.84761  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  47.51 
 
 
592 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0847  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.26 
 
 
325 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3136  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.06 
 
 
321 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.9 
 
 
329 aa  240  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  47.51 
 
 
592 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  46.33 
 
 
609 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13190  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, ATPase component  45.8 
 
 
338 aa  239  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0554278  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  46.39 
 
 
571 aa  238  9e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  47.13 
 
 
592 aa  238  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0680  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.31 
 
 
332 aa  237  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  45.8 
 
 
627 aa  237  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3173  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.77 
 
 
338 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  47.1 
 
 
571 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  44.66 
 
 
566 aa  236  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0032  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.13 
 
 
346 aa  236  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3503  ABC transporter related  49.2 
 
 
288 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.365149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1711  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.71 
 
 
325 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0180  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.8 
 
 
478 aa  235  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.1 
 
 
632 aa  234  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  45.56 
 
 
366 aa  234  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4864  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0550  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 
320 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3626  ABC transporter related  49.2 
 
 
287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.56 
 
 
321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0619  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.15 
 
 
320 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1292  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.88 
 
 
352 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00715286  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0678  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.8 
 
 
445 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106585  normal  0.159459 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D20  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  45.95 
 
 
319 aa  232  4.0000000000000004e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.92 
 
 
465 aa  232  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  46.9 
 
 
573 aa  232  5e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0393  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.02 
 
 
323 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4209  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.9 
 
 
336 aa  232  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0573  ABC transporter related  45.95 
 
 
308 aa  232  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  45.88 
 
 
573 aa  232  6e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.17 
 
 
339 aa  231  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633226  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  43.51 
 
 
617 aa  231  7.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7207  ABC transporter  46.01 
 
 
344 aa  231  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 
360 aa  231  8.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384991  normal  0.757279 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12500  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 
354 aa  231  9e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.96533  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.01 
 
 
349 aa  231  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2029  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  45.56 
 
 
319 aa  231  9e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4045  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.36 
 
 
336 aa  231  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0066  ABC nickel transporter, ATPase subunit  47.79 
 
 
305 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1020  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.21 
 
 
334 aa  230  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113907  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3882  ABC di/oligopeptide transporter, ATPase subunit  46.51 
 
 
342 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0441642  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4158  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.51 
 
 
342 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.47241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3819  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.29 
 
 
336 aa  230  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  45.17 
 
 
623 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.87 
 
 
571 aa  230  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.17 
 
 
308 aa  230  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2174  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.42 
 
 
326 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.837034  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0214  ABC transporter related  45.53 
 
 
586 aa  230  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0229291  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0211  hypothetical protein  45.91 
 
 
332 aa  229  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.62 
 
 
388 aa  229  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  43.23 
 
 
583 aa  230  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3820  ABC transporter related  48.41 
 
 
277 aa  230  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.925873 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0202  hypothetical protein  45.91 
 
 
332 aa  229  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0248  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.88 
 
 
443 aa  230  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0716  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.17 
 
 
308 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000233806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.17 
 
 
308 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0569  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.17 
 
 
308 aa  229  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187494  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  44.57 
 
 
370 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0659  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.17 
 
 
308 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.575275  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08440  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.14 
 
 
599 aa  229  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.508486  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.32 
 
 
703 aa  229  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1901  ABC transporter related  47.1 
 
 
284 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  44.49 
 
 
571 aa  229  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  43.97 
 
 
308 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.77 
 
 
308 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0775  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  45.53 
 
 
322 aa  228  5e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138989  hitchhiker  0.00000000000731431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  44.23 
 
 
593 aa  228  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  45.83 
 
 
546 aa  228  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.08 
 
 
276 aa  228  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  45.74 
 
 
640 aa  228  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2786  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.85 
 
 
340 aa  228  7e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.863606  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6466  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  46.9 
 
 
330 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0987  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.23 
 
 
318 aa  228  8e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000207029  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3800  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 
346 aa  228  8e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2572  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.1 
 
 
337 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.17 
 
 
308 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.53 
 
 
633 aa  227  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2743  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.78 
 
 
320 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.12 
 
 
333 aa  227  1e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>