More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08340 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_08340  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  100 
 
 
264 aa  513  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.571186  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0185  ABC transporter related  64.86 
 
 
268 aa  341  5e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3390  ABC transporter related  64.09 
 
 
268 aa  334  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0932  ABC transporter related  60.61 
 
 
273 aa  317  1e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.68534  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06710  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  58.33 
 
 
295 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0686921  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2149  ABC transporter related  60 
 
 
286 aa  310  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1274  ABC transporter, ATP-binding protein  58.02 
 
 
264 aa  301  9e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2474  peptide ABC transporter ATP-binding protein  62.31 
 
 
329 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.279573  normal  0.0859764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3820  ABC transporter related  49.02 
 
 
277 aa  246  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.925873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3503  ABC transporter related  50.6 
 
 
288 aa  244  9e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.365149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3626  ABC transporter related  51.39 
 
 
287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0066  ABC nickel transporter, ATPase subunit  52.79 
 
 
305 aa  242  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2722  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.58 
 
 
327 aa  243  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  52.51 
 
 
573 aa  238  9e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6466  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  47.49 
 
 
330 aa  235  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2572  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
337 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0393  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.83 
 
 
323 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  49.81 
 
 
571 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4730  ABC transporter related  49.41 
 
 
273 aa  232  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.36 
 
 
338 aa  232  6e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.116668  normal  0.025409 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.24 
 
 
465 aa  232  6e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282444  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0248  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.85 
 
 
443 aa  231  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3173  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  54.51 
 
 
338 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2263  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  50.21 
 
 
340 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301256  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4209  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.71 
 
 
336 aa  229  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0065  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.54 
 
 
444 aa  229  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0310035 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3599  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  49.78 
 
 
327 aa  230  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  48.44 
 
 
573 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0870  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  47.66 
 
 
322 aa  229  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.772702  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0965  ABC transporter related  47.37 
 
 
686 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.346759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  50.85 
 
 
588 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.3 
 
 
339 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633226  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3882  ABC di/oligopeptide transporter, ATPase subunit  49.62 
 
 
342 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0441642  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3307  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  47.37 
 
 
349 aa  228  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.595916  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4158  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.62 
 
 
342 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.47241 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1007  ABC transporter related  45.99 
 
 
313 aa  228  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0988  ABC transporter related  45.99 
 
 
313 aa  228  6e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26180  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.27 
 
 
575 aa  228  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.204743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0938  ABC transporter related  46.56 
 
 
686 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  46.24 
 
 
620 aa  228  9e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0680  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.85 
 
 
332 aa  228  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  49.79 
 
 
627 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3819  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
336 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0573  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  46.41 
 
 
312 aa  227  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.481261  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.35 
 
 
327 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  49.44 
 
 
548 aa  226  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3800  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.85 
 
 
346 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  43.94 
 
 
311 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 
311 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1667  ABC transporter related  48.29 
 
 
283 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1839  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.85 
 
 
329 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0900  ABC transporter-related protein  43.56 
 
 
311 aa  225  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0155747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.56 
 
 
311 aa  224  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 
311 aa  224  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 
311 aa  224  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  43.56 
 
 
311 aa  224  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 
311 aa  224  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 
311 aa  224  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  45.74 
 
 
546 aa  224  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0999  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.7 
 
 
326 aa  224  9e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3497  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.84 
 
 
329 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  50.43 
 
 
370 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  48.71 
 
 
576 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8930  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.04 
 
 
337 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.53 
 
 
326 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
311 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 
423 aa  223  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302511  normal  0.155474 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4180  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.21 
 
 
346 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1586  ABC transporter related  46.43 
 
 
282 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4337  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.41 
 
 
332 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.640243  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.76 
 
 
339 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D20  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  42.69 
 
 
319 aa  224  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2029  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  41.63 
 
 
319 aa  223  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  48.06 
 
 
600 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0180  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.21 
 
 
478 aa  223  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  45.77 
 
 
555 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.18 
 
 
311 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1582  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.03 
 
 
282 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.322929  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1064  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.86 
 
 
343 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4501  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.73 
 
 
332 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.229817 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0202  hypothetical protein  44.14 
 
 
332 aa  223  3e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0211  hypothetical protein  44.14 
 
 
332 aa  223  3e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  45.35 
 
 
339 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02945  hypothetical protein  48.31 
 
 
336 aa  222  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1528  ABC transporter related  44.4 
 
 
583 aa  222  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12500  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.66 
 
 
354 aa  223  4e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.96533  normal  0.120346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3136  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50.85 
 
 
321 aa  222  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170739  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000989  oligopeptide transport ATP-binding protein OppF  44.23 
 
 
310 aa  223  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19580  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.51 
 
 
389 aa  222  4e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0475544 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4071  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.57 
 
 
358 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2644  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.09 
 
 
322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.277235  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0143  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  48.25 
 
 
579 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.18152 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  50 
 
 
592 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  46.49 
 
 
366 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4060  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.57 
 
 
358 aa  222  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0092  dipeptide transporter ATP-binding subunit  44.57 
 
 
358 aa  222  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.15 
 
 
388 aa  222  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0419  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.86 
 
 
355 aa  221  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2366  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  49.36 
 
 
332 aa  221  7e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.343189  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0128  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.15 
 
 
346 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>