More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06710 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_06710  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  100 
 
 
295 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0686921  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2149  ABC transporter related  76.3 
 
 
286 aa  424  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0932  ABC transporter related  72.01 
 
 
273 aa  402  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.68534  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3390  ABC transporter related  60.53 
 
 
268 aa  339  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0185  ABC transporter related  60.9 
 
 
268 aa  338  5.9999999999999996e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08340  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  58.33 
 
 
264 aa  312  3.9999999999999997e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.571186  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1274  ABC transporter, ATP-binding protein  59.62 
 
 
264 aa  309  4e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2474  peptide ABC transporter ATP-binding protein  56.7 
 
 
329 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.279573  normal  0.0859764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3503  ABC transporter related  47.18 
 
 
288 aa  241  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.365149  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3626  ABC transporter related  48.67 
 
 
287 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3599  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  47.74 
 
 
327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0478  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.93 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015743  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  46.21 
 
 
573 aa  232  6e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.62 
 
 
326 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  46.79 
 
 
619 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  43.63 
 
 
627 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2765  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.18 
 
 
339 aa  230  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633226  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3820  ABC transporter related  44.94 
 
 
277 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.925873 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0560  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.32 
 
 
334 aa  229  5e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.204279  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2722  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.93 
 
 
327 aa  228  8e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2786  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.14 
 
 
340 aa  228  8e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.863606  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.28 
 
 
327 aa  228  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  42.5 
 
 
578 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2851  ABC transporter related  44.91 
 
 
310 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 
320 aa  227  2e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.213688 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1385  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 
335 aa  227  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  42.86 
 
 
617 aa  226  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  46.18 
 
 
640 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1565  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 
335 aa  226  3e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000744963  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2029  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  41.86 
 
 
319 aa  226  3e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1777  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.85 
 
 
326 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000396246 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03560  ABC-type dipeptide transport system, ATPase component  40.7 
 
 
564 aa  226  4e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26140  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  44.36 
 
 
665 aa  226  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0117472  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.94 
 
 
307 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0211  hypothetical protein  42.8 
 
 
332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  46.56 
 
 
640 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0202  hypothetical protein  42.8 
 
 
332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0999  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.23 
 
 
326 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  41.46 
 
 
617 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.87 
 
 
703 aa  225  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1901  ABC transporter related  45.49 
 
 
284 aa  225  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  44.4 
 
 
615 aa  225  7e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1839  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.35 
 
 
329 aa  225  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0180  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.87 
 
 
478 aa  225  9e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.94 
 
 
339 aa  224  9e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.960319  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D20  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  42.47 
 
 
319 aa  224  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1007  ABC transporter related  44.76 
 
 
313 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4864  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  47.86 
 
 
316 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6466  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  46.01 
 
 
330 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0988  ABC transporter related  44.76 
 
 
313 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  46.79 
 
 
573 aa  223  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4158  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.29 
 
 
342 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.47241 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.06 
 
 
338 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.116668  normal  0.025409 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  44.44 
 
 
546 aa  223  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 
632 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.52 
 
 
347 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.35 
 
 
625 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  43.35 
 
 
566 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.51 
 
 
617 aa  222  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  45.59 
 
 
571 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001850  ABC-type oligopeptide transport system ATPase component  44.62 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4730  ABC transporter related  44.87 
 
 
273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.45 
 
 
632 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.83 
 
 
465 aa  222  6e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282444  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  44.85 
 
 
624 aa  222  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1914  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.12 
 
 
321 aa  222  7e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.212102  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0248  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.57 
 
 
443 aa  221  8e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  44.85 
 
 
624 aa  221  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5623  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.33 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0190299  normal  0.692526 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3102  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.45 
 
 
643 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.94565  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0066  ABC nickel transporter, ATPase subunit  48.36 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  44.49 
 
 
571 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  43.21 
 
 
612 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3882  ABC di/oligopeptide transporter, ATPase subunit  46.9 
 
 
342 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0441642  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  44.74 
 
 
592 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2496  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 
454 aa  221  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0573  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  44.49 
 
 
312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.481261  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.97 
 
 
643 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0981  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.76 
 
 
328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3783  ABC transporter related  41.95 
 
 
328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259832  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  44.91 
 
 
592 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1164  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.22 
 
 
329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  44.96 
 
 
370 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.186774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  44.62 
 
 
541 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  44.91 
 
 
592 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0032  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.78 
 
 
346 aa  220  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  42.29 
 
 
623 aa  219  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0672  ABC transporter related  46.15 
 
 
261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.92463  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0063  ABC transporter related  45.74 
 
 
282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0307573  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.55 
 
 
629 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1227  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.91 
 
 
339 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0783  ABC transporter related  42.12 
 
 
295 aa  219  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.806728 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5658  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.7 
 
 
314 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.521536 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.7 
 
 
629 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2262  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.17 
 
 
322 aa  218  7e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0262403  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0500  ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 
328 aa  218  7e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3902  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.96 
 
 
337 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3136  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.36 
 
 
321 aa  218  7.999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170739  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3838  dipeptide transporter ATP-binding subunit  40.96 
 
 
337 aa  218  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  39.71 
 
 
609 aa  218  7.999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>