More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2736 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2736  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  485  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  33.99 
 
 		 258 aa  122  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 258 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2381  IclR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0190  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 241 aa  112  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.49367  normal  0.390724 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 254 aa  89  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  30.16 
 
 		 267 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  34.6 
 
 		 253 aa  86.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  23.27 
 
 		 248 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 260 aa  85.5  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.95 
 
 		 252 aa  85.1  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  27.84 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  27.53 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  30.43 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  26.56 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  28.63 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  28.57 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4439  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.325495  normal  0.819621 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1587  transcriptional regulator, IclR family  32.68 
 
 		 835 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0088004 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  24.08 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  31.23 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  28.9 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  28.23 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  33.64 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.08 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  28.9 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0408  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.317858  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  26.09 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  28.26 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  25.69 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  23.51 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3330  transcriptional regulator, IclR family  28.92 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3717  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0598808 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0440  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  23.29 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  28.14 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  23.35 
 
 		 257 aa  72  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  26.83 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  28.8 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  30.42 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  28.76 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2810  IclR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.162852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  25.77 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  28.17 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  27.02 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6149  IclR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.508102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2376  transcriptional regulator, IclR family  28.02 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157038  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  27.57 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  25.91 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>