97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1787 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1787  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  642    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0237  transposase, putative  33.21 
 
 
499 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0198  transposase, putative  33.21 
 
 
499 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  40.36 
 
 
950 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  33.59 
 
 
969 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2035  transposase Tn3 family protein  38.26 
 
 
659 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1094  hypothetical protein  88.46 
 
 
107 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0095899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3614  transposase Tn3 family protein  31.32 
 
 
1009 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5219  transposase Tn3 family protein  32.35 
 
 
570 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  27.06 
 
 
974 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  32.95 
 
 
988 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  28.57 
 
 
969 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  29.03 
 
 
988 aa  76.3  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5125  transposase Tn3 family protein  26.32 
 
 
874 aa  72.8  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  29.25 
 
 
1006 aa  67.4  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  27.93 
 
 
961 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  27.2 
 
 
992 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  27.2 
 
 
992 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1567  transposase  28.5 
 
 
358 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.385647  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  30.13 
 
 
988 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  30.13 
 
 
988 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  30.13 
 
 
988 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  24.9 
 
 
985 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  25.65 
 
 
731 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4307  hypothetical protein  26.29 
 
 
400 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  26.98 
 
 
1004 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  26.98 
 
 
1004 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  25 
 
 
1007 aa  59.3  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  25 
 
 
1007 aa  59.3  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  21.08 
 
 
987 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3975  hypothetical protein  26.23 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  23.26 
 
 
612 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  24.71 
 
 
988 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  25.44 
 
 
992 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  24.71 
 
 
988 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  24.71 
 
 
988 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  24.71 
 
 
988 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  29.18 
 
 
1029 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  25.71 
 
 
983 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  26.36 
 
 
988 aa  56.2  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  23.72 
 
 
988 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  25.1 
 
 
988 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  25.39 
 
 
988 aa  54.7  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  23.32 
 
 
988 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  23.32 
 
 
988 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  23.32 
 
 
988 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1877  transposase Tn3  25.7 
 
 
409 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  33.12 
 
 
996 aa  53.1  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  25.22 
 
 
1015 aa  53.1  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  26.38 
 
 
990 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  26.38 
 
 
990 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  25.59 
 
 
990 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  24.9 
 
 
990 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  25.97 
 
 
988 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  24.9 
 
 
990 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  24.9 
 
 
990 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  24.9 
 
 
990 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  24.9 
 
 
526 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  25.22 
 
 
988 aa  50.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  25.22 
 
 
988 aa  50.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  25.48 
 
 
995 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  26.32 
 
 
991 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  26.32 
 
 
991 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  29.87 
 
 
996 aa  49.7  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  29.87 
 
 
996 aa  49.7  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  29.87 
 
 
996 aa  49.7  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  24.14 
 
 
877 aa  49.3  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  26.2 
 
 
993 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  24.62 
 
 
990 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  26.2 
 
 
993 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  25.53 
 
 
995 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  28.15 
 
 
968 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  25.38 
 
 
989 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  24.15 
 
 
991 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  24.15 
 
 
991 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  21.89 
 
 
738 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  28.9 
 
 
916 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  25.69 
 
 
1004 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  28.76 
 
 
1028 aa  46.2  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  25.1 
 
 
986 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  24.07 
 
 
994 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  23.53 
 
 
988 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  23.38 
 
 
1006 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  23.38 
 
 
1006 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  23.53 
 
 
979 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  27.94 
 
 
997 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4930  transposase Tn3 family protein  29.75 
 
 
492 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142055  normal  0.882247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6366  transposase  25.3 
 
 
260 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714765  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  22.83 
 
 
994 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  22.22 
 
 
994 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  23.21 
 
 
977 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  23.21 
 
 
977 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  25 
 
 
999 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  25 
 
 
999 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  25 
 
 
999 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  25 
 
 
999 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  28.18 
 
 
976 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>