More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1114 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  100 
 
 		 384 aa  759    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  53.48 
 
 		 371 aa  368  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0977  aminotransferase class V  51.36 
 
 		 379 aa  340  2e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  43.42 
 
 		 395 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1789  Serine--pyruvate transaminase  45.43 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  43.75 
 
 		 396 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  43.75 
 
 		 396 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  44.04 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2957  aminotransferase class V  44.69 
 
 		 392 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.351742 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1765  aminotransferase class V  41.3 
 
 		 388 aa  269  7e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.333913  normal  0.0106496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  41.6 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  41.53 
 
 		 381 aa  258  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  42.19 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1895  Serine--pyruvate transaminase  39.35 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  40.89 
 
 		 394 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  41.05 
 
 		 401 aa  256  6e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0447  Serine--pyruvate transaminase  39.02 
 
 		 380 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002358  serine--pyruvate aminotransferase/L-alanine:glyoxylate aminotransferase  39.84 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1207  alanine-glyoxylate aminotransferase  42.47 
 
 		 394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.811059 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3277  Serine--pyruvate transaminase  40.54 
 
 		 376 aa  252  7e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0019  aminotransferase class V  40.26 
 
 		 404 aa  252  9.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03710  aminotransferase  39.57 
 
 		 382 aa  252  9.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2128  aminotransferase, class V  39.02 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  38.36 
 
 		 369 aa  249  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10251  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  41.26 
 
 		 366 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.656234  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  41.57 
 
 		 384 aa  249  5e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2538  Serine--pyruvate transaminase  37.84 
 
 		 413 aa  249  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102161  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  43.22 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2509  alanine-glyoxylate aminotransferase  38.9 
 
 		 377 aa  247  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  37.98 
 
 		 396 aa  247  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3795  aminotransferase class V  39.83 
 
 		 375 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4160  Serine--pyruvate transaminase  38.38 
 
 		 380 aa  247  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0366  alanine-glyoxylate aminotransferase  38.96 
 
 		 377 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  38.08 
 
 		 394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4343  aminotransferase, class V  38.69 
 
 		 378 aa  246  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0350  Serine--pyruvate transaminase  38.46 
 
 		 378 aa  245  9e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  38.08 
 
 		 394 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3660  alanine-glyoxylate aminotransferase  38.69 
 
 		 377 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3847  aminotransferase class V  39.26 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.15565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3610  alanine--glyoxylate transaminase  38.8 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  39.08 
 
 		 412 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  38.79 
 
 		 412 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4124  Serine--pyruvate transaminase  38.42 
 
 		 377 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2043  Serine--pyruvate transaminase  39.34 
 
 		 375 aa  243  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  37.6 
 
 		 373 aa  243  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09401  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  38.08 
 
 		 394 aa  242  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0294  alanine--glyoxylate transaminase  37.43 
 
 		 380 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1551  Alanine--glyoxylate transaminase  38.21 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4027  Serine--pyruvate transaminase  38.15 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.710058  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2190  aminotransferase, class V  38.48 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0995229  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3930  Serine--pyruvate transaminase  38.15 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0404  Serine--pyruvate transaminase  38.48 
 
 		 379 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0360  alanine-glyoxylate aminotransferase  38.96 
 
 		 377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4005  Serine--pyruvate transaminase  37.87 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2810  aminotransferase, class V  40.05 
 
 		 372 aa  239  9e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0127  alanine-glyoxylate aminotransferase  38.57 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.791837  normal  0.0695554 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0426  alanine--glyoxylate transaminase  37.84 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10021  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  37.21 
 
 		 394 aa  232  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3274  alanine-glyoxylate aminotransferase  42.05 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0628031  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01996  putative serine-pyruvate aminotransferase  38.19 
 
 		 344 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.033045  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0552  aminotransferase, class V  38.93 
 
 		 312 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0262  Serine--pyruvate transaminase  39.44 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0217  Serine--pyruvate transaminase  36.39 
 
 		 415 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378021 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  32.23 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  35.76 
 
 		 382 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  35.76 
 
 		 382 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2078  Serine--pyruvate transaminase  35.64 
 
 		 455 aa  199  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2785  aminotransferase class V  37.43 
 
 		 412 aa  197  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000830032 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.05 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.52 
 
 		 383 aa  193  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3706  Serine--pyruvate transaminase  36.36 
 
 		 436 aa  192  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.873168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02497  aminotransferase, class V  32.47 
 
 		 426 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.242157  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03786  purine catabolism protein PucG  36.39 
 
 		 418 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0914  Serine--pyruvate transaminase  36.13 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0199987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2424  Serine--pyruvate transaminase  32.01 
 
 		 410 aa  186  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102293 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  34.51 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  37.24 
 
 		 376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0881  aminotransferase class V  33.07 
 
 		 414 aa  183  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  34.99 
 
 		 386 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  33.91 
 
 		 381 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  31.56 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2052  aminotransferase, class V  30.95 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  33.92 
 
 		 363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0865  aminotransferase class V  31.94 
 
 		 409 aa  179  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.065762  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.19 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  37.57 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  30.35 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0911  aminotransferase class V  33.07 
 
 		 414 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345537  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  31.3 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  30.35 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  31.41 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  34.6 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  35.38 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  32.65 
 
 		 385 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0454  aminotransferase class V  29.72 
 
 		 406 aa  175  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  34.39 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  31.99 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3465  aminotransferase class V  31.14 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  31.64 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  33.24 
 
 		 390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>