153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3554 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 77 aa  157  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  50.79 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  46.15 
 
 		 95 aa  67  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  46.67 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  53.73 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  51.67 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.28 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  46.77 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  46.48 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  40.26 
 
 		 174 aa  62  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  47.06 
 
 		 847 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  40.58 
 
 		 578 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  45 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  47.54 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  37.33 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  41.94 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  36.49 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  40.58 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1616  phage shock protein C  33.78 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0788963  normal  0.377929 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  45.76 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2032  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  0.0853583 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  38.33 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  45.59 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  39.39 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0436  phage shock protein C, PspC  35.62 
 
 		 452 aa  53.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000115043  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  42.86 
 
 		 582 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  38.33 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  52  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  41.94 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  31.58 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  41.38 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 169 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  36.84 
 
 		 129 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02831  phage shock protein C  33.33 
 
 		 148 aa  50.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.661382  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2286  hypothetical protein  41.38 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  39.68 
 
 		 233 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  39.34 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  32 
 
 		 81 aa  50.4  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  40.62 
 
 		 515 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1281  phage shock protein C  33.33 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  39.44 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0408  phage shock protein C, PspC  37.68 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  34.67 
 
 		 847 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1812  DNA-binding transcriptional activator PspC  35.21 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000743707 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1874  DNA-binding transcriptional activator PspC  35.21 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1813  DNA-binding transcriptional activator PspC  35.21 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1462  DNA-binding transcriptional activator PspC  35.21 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.269828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1644  DNA-binding transcriptional activator PspC  35.21 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000607871 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  31.67 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  39.06 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1724  DNA-binding transcriptional activator PspC  37.66 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3770  phage shock protein C  34.18 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.289973  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2478  hypothetical protein  33.8 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  35.29 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 466 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  38.33 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  36.07 
 
 		 71 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  34.48 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  37.1 
 
 		 190 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  36.23 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  46.43 
 
 		 306 aa  47.4  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  37.7 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  39.34 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  37.7 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  37.7 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  37.7 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  37.7 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2576  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05619  PspC domain superfamily  45.1 
 
 		 52 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0146785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  39.34 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  38.03 
 
 		 346 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  36.36 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  44 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  35.21 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  51.35 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2167  DNA-binding transcriptional activator PspC  36.92 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0755267 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2340  phage shock protein C, PspC  34.38 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00136748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  35.62 
 
 		 256 aa  44.7  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  47.5 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1788  DNA-binding transcriptional activator PspC  36.92 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1421  DNA-binding transcriptional activator PspC  34.38 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1516  DNA-binding transcriptional activator PspC  34.38 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01294  hypothetical protein  34.38 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2535  DNA-binding transcriptional activator PspC  36.92 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1896  DNA-binding transcriptional activator PspC  36.92 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2319  DNA-binding transcriptional activator PspC  34.38 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.033719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1816  DNA-binding transcriptional activator PspC  34.38 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1542  DNA-binding transcriptional activator PspC  34.38 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>