More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0180 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0180  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
273 aa  553  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2852  response regulator receiver protein  58.27 
 
 
268 aa  317  9e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0178  response regulator receiver domain-containing protein  57.31 
 
 
272 aa  315  7e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1937  response regulator receiver protein  56.98 
 
 
269 aa  294  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0621  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.08 
 
 
415 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.649156 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0085  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.08 
 
 
453 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0659  diguanylate cyclase  36.96 
 
 
417 aa  195  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0149639  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1933  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.31 
 
 
411 aa  192  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380329  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03265  hypothetical protein  39.77 
 
 
403 aa  189  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2407  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.54 
 
 
443 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0296488 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03374  Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  39.53 
 
 
419 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.67607  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2233  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.67 
 
 
428 aa  186  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1193  diguanylate cyclase  34.38 
 
 
415 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1723  diguanylate cyclase  39.3 
 
 
420 aa  182  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  hitchhiker  0.00000158997 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2466  diguanylate cyclase  38.91 
 
 
406 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0503371  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0579  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 
487 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721447  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0478  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.22 
 
 
422 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.60604  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1511  response regulator receiver protein  38.52 
 
 
416 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.37 
 
 
1691 aa  180  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2855  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.08 
 
 
415 aa  179  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.220747  hitchhiker  0.000676798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0581  response regulator  37.74 
 
 
417 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000040809  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1780  diguanylate cyclase  34.92 
 
 
414 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
500 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2154  response regulator receiver protein  35.09 
 
 
268 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193377  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0081  response regulator/GGDEF domain-containing protein  37.4 
 
 
419 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2153  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.15 
 
 
443 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257798  normal  0.276429 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2408  response regulator receiver protein  35.09 
 
 
276 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2518  GGDEF domain-containing protein  36.43 
 
 
407 aa  166  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1795  response regulator receiver protein  37.07 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00918371  hitchhiker  0.000651153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1684  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.96 
 
 
400 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3346  response regulator/GGDEF domain-containing protein  34.24 
 
 
417 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2323  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.43 
 
 
445 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.123075  unclonable  0.0000172862 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0462  3-deoxy-d-manno-octulosonic-acid transferase  32.18 
 
 
422 aa  161  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2726  two component response regulator  35.02 
 
 
277 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1984  threonine dehydratase  31.15 
 
 
418 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.241676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00466  Putative two-component system regulatory protein with GGDEF domain  35.8 
 
 
414 aa  150  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.6149  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  39.2 
 
 
526 aa  149  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1334  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.85 
 
 
447 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4080  diguanylate cyclase  33.07 
 
 
418 aa  145  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0746  response regulator/GGDEF domain-containing protein  28.3 
 
 
414 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0447686  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0671  response regulator/GGDEF domain-containing protein  28.3 
 
 
414 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.78 
 
 
427 aa  142  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1356  response regulator/GGDEF domain-containing protein  26.24 
 
 
414 aa  142  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00199  response regulator/GGDEF domain protein  31.65 
 
 
426 aa  135  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0652  two component response regulator  29.32 
 
 
414 aa  133  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.267728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4418  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.1 
 
 
466 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  35.38 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2000  response regulator receiver protein  37.61 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0493  signal transduction histidine kinase, LytS  34.92 
 
 
1022 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000359244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2453  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.38 
 
 
461 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000196128  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1429  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
122 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  31.2 
 
 
1526 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 
1130 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3940  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.97 
 
 
467 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000637809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4024  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.97 
 
 
467 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42797e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1777  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.85 
 
 
465 aa  73.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1943  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
1468 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 
225 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  34.45 
 
 
1133 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1763  response regulator receiver  37.38 
 
 
121 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0845  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.54 
 
 
508 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.903712  hitchhiker  0.00198769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2396  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
126 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.612966  normal  0.464694 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1259  chemotaxis protein CheY  36.45 
 
 
125 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.529849  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  34.51 
 
 
139 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.08 
 
 
1038 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1965  response regulatory protein, sigma 54 related  28.79 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0275961  normal  0.129103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  35.65 
 
 
1119 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2191  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
139 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  38.6 
 
 
121 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  38.89 
 
 
1016 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  36.45 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 
1165 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1261  chemotaxis protein CheY  35.51 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0812291  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1136  chemotaxis protein CheY  35.51 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0603  chemotaxis protein CheY  35.51 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0298  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator, interruption-C  35.29 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
1195 aa  69.3  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0846  response regulator receiver protein  35.4 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282438 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3583  response regulator receiver protein  30.83 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2145  two component signal transduction response regulator  30.3 
 
 
492 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
989 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0337  response regulator receiver protein  35.4 
 
 
139 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2678  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.54 
 
 
457 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.71 
 
 
900 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  36.04 
 
 
127 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 
896 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  36.89 
 
 
781 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.34 
 
 
216 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
989 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  32.76 
 
 
121 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3597  response regulator receiver  37.04 
 
 
131 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.593554  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.34 
 
 
216 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  31.19 
 
 
896 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  30.4 
 
 
1018 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0338  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.64 
 
 
513 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1257  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 
229 aa  67  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.536699  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>