More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1090 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1090  rare lipoprotein A  100 
 
 		 388 aa  773    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.499967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2966  rare lipoprotein A  69.39 
 
 		 381 aa  524  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  61.92 
 
 		 370 aa  455  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  62.44 
 
 		 375 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1199  rare lipoprotein A  56.48 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.670363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  55.7 
 
 		 360 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00602  minor lipoprotein  48.58 
 
 		 362 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0208162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0685  rare lipoprotein A  48.58 
 
 		 362 aa  311  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.7076e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0653  rare lipoprotein A  48.58 
 
 		 362 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000226966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00591  hypothetical protein  48.58 
 
 		 362 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0164207  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0658  rare lipoprotein A  48.58 
 
 		 362 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2993  rare lipoprotein A  48.58 
 
 		 362 aa  309  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000212264  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0618  rare lipoprotein A  48.32 
 
 		 362 aa  310  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00356673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3012  rare lipoprotein A  48.32 
 
 		 362 aa  309  5e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000245758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0721  rare lipoprotein A  48.06 
 
 		 362 aa  307  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000475341  normal  0.474734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1168  rare lipoprotein A  47.95 
 
 		 365 aa  305  9.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0694  rare lipoprotein A  48.61 
 
 		 377 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0798  rare lipoprotein A  48.86 
 
 		 377 aa  298  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00108325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0740  rare lipoprotein A  48.74 
 
 		 377 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.012679  normal  0.997721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0680  rare lipoprotein A  48.74 
 
 		 377 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202974  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0754  rare lipoprotein A  48.49 
 
 		 377 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  43.26 
 
 		 267 aa  142  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  42.7 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  44.51 
 
 		 263 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  39.31 
 
 		 278 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  42.14 
 
 		 260 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  35.34 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  45.52 
 
 		 269 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  44.03 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  40.59 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  38.24 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  29.44 
 
 		 381 aa  119  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  43.92 
 
 		 186 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  37.42 
 
 		 270 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  38.61 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  40.11 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  40.3 
 
 		 283 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  41.18 
 
 		 260 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  39.55 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  39.26 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  39.26 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 297 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  37.04 
 
 		 264 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  38.06 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  33.84 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  40.46 
 
 		 261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  38.06 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  38.06 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  40.46 
 
 		 265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  38.06 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  39.87 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  31.72 
 
 		 281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  33.94 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  41.32 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  29.09 
 
 		 409 aa  109  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  33.51 
 
 		 442 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  50.45 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  40.49 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  38.36 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  34.46 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  42.96 
 
 		 285 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  38.57 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  45.61 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  37.44 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 391 aa  106  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  44.8 
 
 		 238 aa  106  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  40.12 
 
 		 315 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  37.5 
 
 		 408 aa  106  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  36.26 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  49.49 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  49.49 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  49.49 
 
 		 230 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  42.2 
 
 		 346 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  40.91 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  49.49 
 
 		 211 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  50.5 
 
 		 202 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  49.49 
 
 		 230 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  46.96 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  49.49 
 
 		 211 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  38.33 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  44.74 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  44.17 
 
 		 324 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  49.49 
 
 		 211 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2921  rare lipoprotein A, putative  45.08 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.303868  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  37.08 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  37.64 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  38.75 
 
 		 290 aa  104  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2535  rare lipoprotein A  45.08 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.456339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2228  rare lipoprotein A  34.72 
 
 		 194 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  37.78 
 
 		 341 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  28.26 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  37.5 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  45.45 
 
 		 281 aa  103  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  37.08 
 
 		 364 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2624  hypothetical protein  42.73 
 
 		 160 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2475  hypothetical protein  42.73 
 
 		 160 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  44.74 
 
 		 398 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2972  lipoprotein A domain-containing protein  46.09 
 
 		 143 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>