More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2498 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0048  aminotransferase class-III  81.08 
 
 
458 aa  756    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0067  aminotransferase class-III  82.62 
 
 
447 aa  758    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1546  aminotransferase class-III  85.26 
 
 
448 aa  779    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.634671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2403  aminotransferase class-III  89.66 
 
 
447 aa  834    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.634591  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2498  aminotransferase class-III  100 
 
 
446 aa  915    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2916  aminotransferase class-III  84.35 
 
 
448 aa  773    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5225  aminotransferase class-III  52.84 
 
 
427 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.502422  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5426  aminotransferase class-III  53.05 
 
 
442 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341099  normal  0.107268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0414  aminotransferase  52.91 
 
 
416 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3214  aminotransferase class-III  51.67 
 
 
433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1796  aminotransferase class-III  50.8 
 
 
436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2224  aminotransferase class-III  52.28 
 
 
434 aa  438  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5905  aminotransferase class-III  51.57 
 
 
465 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2538  aminotransferase class-III  51.2 
 
 
434 aa  433  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043195  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3009  aminotransferase  50.11 
 
 
443 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1272  aminotransferase class-III  48.71 
 
 
424 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0982  aminotransferase class-III  51.38 
 
 
436 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1957  aminotransferase class-III  49.43 
 
 
436 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.796788  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0312  aminotransferase  49.52 
 
 
436 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1165  aminotransferase, class III  47.06 
 
 
427 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4354  aminotransferase  43.81 
 
 
427 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4438  aminotransferase class-III  45.09 
 
 
427 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0985724  normal  0.717239 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1377  aminotransferase  44.05 
 
 
429 aa  349  6e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427783  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2246  aminotransferase class-III  45.04 
 
 
978 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256947  normal  0.907649 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0949  hypothetical protein  42.55 
 
 
1023 aa  319  7e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0891  hypothetical protein  42.32 
 
 
1049 aa  317  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1405  hypothetical protein  41.37 
 
 
1016 aa  317  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.920355  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2601  hypothetical protein  42.14 
 
 
1015 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.338016  normal  0.0406059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3361  hypothetical protein  40.94 
 
 
1015 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2397  hypothetical protein  41.19 
 
 
1015 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2578  hypothetical protein  41.43 
 
 
1018 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.54149  normal  0.14969 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3343  aminotransferase class-III  41.67 
 
 
413 aa  306  7e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.65062 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2711  hypothetical protein  40.37 
 
 
994 aa  297  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0583099  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4205  hypothetical protein  38.24 
 
 
973 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4495  hypothetical protein  38 
 
 
973 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3387  hypothetical protein  37.33 
 
 
1003 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276595  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0622  aminotransferase class-III  38.95 
 
 
448 aa  283  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.570795  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4154  hypothetical protein  36.38 
 
 
910 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1713  hypothetical protein  36.38 
 
 
976 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5395  aminotransferase, class III  37.12 
 
 
970 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4934  hypothetical protein  36.94 
 
 
970 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4943  hypothetical protein  36 
 
 
966 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.870078  hitchhiker  0.0000072077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4321  hypothetical protein  36.83 
 
 
981 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0290  hypothetical protein  35.76 
 
 
970 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4091  hypothetical protein  36.83 
 
 
981 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.565558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4167  hypothetical protein  36.83 
 
 
981 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.989146  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_52110  hypothetical protein  40.29 
 
 
427 aa  271  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3725  hypothetical protein  35.68 
 
 
976 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4610  hypothetical protein  34.76 
 
 
977 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.102283  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2580  hypothetical protein  34.82 
 
 
975 aa  260  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6010  hypothetical protein  36.34 
 
 
974 aa  259  7e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2095  hypothetical protein  34.74 
 
 
967 aa  256  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.174405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14780  4-aminobutyrate aminotransferase  34.12 
 
 
437 aa  239  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0220  aminotransferase  34.29 
 
 
436 aa  226  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1532  aminotransferase  31.48 
 
 
436 aa  201  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0305  4-aminobutyrate aminotransferase  30 
 
 
454 aa  190  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0941  aminotransferase class-III  30.66 
 
 
431 aa  189  9e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.224071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  29.24 
 
 
478 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0293  4-aminobutyrate aminotransferase  29.24 
 
 
454 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0310  4-aminobutyrate aminotransferase  29.24 
 
 
454 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0325  4-aminobutyrate aminotransferase  29.24 
 
 
454 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0297  4-aminobutyrate aminotransferase  29.24 
 
 
454 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0399  4-aminobutyrate aminotransferase  28.57 
 
 
454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0326575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0371  4-aminobutyrate aminotransferase  29.1 
 
 
479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0354  4-aminobutyrate aminotransferase  29.18 
 
 
468 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4949  4-aminobutyrate aminotransferase  28.85 
 
 
454 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2903  4-aminobutyrate aminotransferase  30.79 
 
 
438 aa  180  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0048698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0566  4-aminobutyrate aminotransferase  29.63 
 
 
428 aa  180  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2755  4-aminobutyrate aminotransferase  27.58 
 
 
448 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4758  Acetylornithine transaminase  33 
 
 
418 aa  176  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.569005 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2913  4-aminobutyrate aminotransferase  30.79 
 
 
434 aa  176  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.976227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2104  aminotransferase class-III  30.79 
 
 
430 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2400  4-aminobutyrate aminotransferase  30.92 
 
 
430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.681516  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  35.1 
 
 
450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0827  aminotransferase class-III  32.43 
 
 
422 aa  173  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0303  4-aminobutyrate aminotransferase  27.64 
 
 
454 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3215  aminotransferase class-III  31.78 
 
 
436 aa  173  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26914  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3989  4-aminobutyrate aminotransferase  28.34 
 
 
461 aa  172  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0232  4-aminobutyrate aminotransferase  31.06 
 
 
440 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  33.33 
 
 
450 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1947  aminotransferase  31.23 
 
 
433 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3380  aminotransferase class-III  31.43 
 
 
431 aa  171  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.130996  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4970  aminotransferase class-III  30.32 
 
 
431 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.260445  normal  0.117498 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2081  4-aminobutyrate aminotransferase  31.03 
 
 
439 aa  169  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.703939  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0592  4-aminobutyrate aminotransferase  29.69 
 
 
432 aa  169  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2993  aminotransferase class-III  32.17 
 
 
436 aa  169  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  30.13 
 
 
449 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  31.79 
 
 
402 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  31.68 
 
 
403 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4229  4-aminobutyrate aminotransferase  30.24 
 
 
428 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.94603  normal  0.717078 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2630  4-aminobutyrate aminotransferase  30.69 
 
 
430 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2754  4-aminobutyrate aminotransferase  28.78 
 
 
445 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5114  aminotransferase class-III  29.83 
 
 
436 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.128293 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5089  aminotransferase class-III  30.2 
 
 
451 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.447769  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1916  Acetylornithine transaminase  30.1 
 
 
417 aa  167  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5339  aminotransferase class-III  34.22 
 
 
437 aa  166  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  29.16 
 
 
449 aa  166  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  28.92 
 
 
449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30190  aminotransferase  29.98 
 
 
419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.168399  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  30.32 
 
 
397 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>