More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1886 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1886  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  100 
 
 		 1037 aa  2101    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0567  pyruvate, water dikinase  41.83 
 
 		 1062 aa  743    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266468  normal  0.689283 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2666  pyruvate, water dikinase  35.55 
 
 		 868 aa  474  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0630  pyruvate, water dikinase  34.05 
 
 		 875 aa  462  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2815  pyruvate, water dikinase  35.17 
 
 		 853 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.217826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2339  Pyruvate, water dikinase  35.2 
 
 		 868 aa  439  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0634  pyruvate, water dikinase  34.62 
 
 		 898 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2044  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  34.57 
 
 		 830 aa  424  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2045  Pyruvate, water dikinase  32.99 
 
 		 887 aa  413  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1355  pyruvate, water dikinase  32.66 
 
 		 870 aa  412  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.590002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  31.67 
 
 		 893 aa  409  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1644  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.85 
 
 		 853 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  32.85 
 
 		 871 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1988  Pyruvate, water dikinase  32.93 
 
 		 817 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0604  pyruvate,water dikinase  34.48 
 
 		 828 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.722423  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  33.33 
 
 		 884 aa  376  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  32.22 
 
 		 918 aa  369  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  33.02 
 
 		 859 aa  369  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.9 
 
 		 861 aa  361  3e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.75 
 
 		 811 aa  355  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2393  pyruvate, water dikinase  31.32 
 
 		 819 aa  352  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0705  Pyruvate, water dikinase  32.97 
 
 		 877 aa  352  3e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  32.64 
 
 		 923 aa  294  6e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0151  pyruvate, water dikinase  25.81 
 
 		 887 aa  261  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.293715  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1990  Pyruvate, water dikinase  27.09 
 
 		 931 aa  251  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  36.61 
 
 		 779 aa  244  6e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  32.66 
 
 		 781 aa  227  8e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  30.7 
 
 		 782 aa  224  6e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  33.77 
 
 		 824 aa  222  3e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  38.46 
 
 		 760 aa  219  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  33.71 
 
 		 758 aa  219  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  32.37 
 
 		 794 aa  215  3.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 754 aa  215  3.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  34.29 
 
 		 809 aa  211  5e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  34.91 
 
 		 810 aa  211  8e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  30.37 
 
 		 812 aa  209  1e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  35.43 
 
 		 788 aa  208  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  31.25 
 
 		 758 aa  208  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  33.41 
 
 		 809 aa  207  7e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  33.85 
 
 		 769 aa  206  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  36.84 
 
 		 780 aa  206  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  34.23 
 
 		 761 aa  204  7e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  33.63 
 
 		 762 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  31.54 
 
 		 758 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  34.76 
 
 		 799 aa  203  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1568  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.65 
 
 		 869 aa  201  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  31.63 
 
 		 758 aa  201  5e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  31.25 
 
 		 758 aa  201  6e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  30.58 
 
 		 758 aa  201  6e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  32.05 
 
 		 757 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  33.78 
 
 		 762 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  31.11 
 
 		 764 aa  197  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  35.07 
 
 		 785 aa  197  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  33.12 
 
 		 793 aa  196  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  31.3 
 
 		 793 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  31.12 
 
 		 798 aa  195  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  31.74 
 
 		 758 aa  194  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  31.38 
 
 		 803 aa  194  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  32.04 
 
 		 795 aa  194  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  33.05 
 
 		 805 aa  194  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  32.35 
 
 		 805 aa  193  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  34.46 
 
 		 785 aa  191  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1583  phosphoenolpyruvate synthase  33.48 
 
 		 805 aa  191  8e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000580674  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  34.42 
 
 		 814 aa  190  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.8 
 
 		 810 aa  190  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  33.26 
 
 		 789 aa  189  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1871  phosphoenolpyruvate synthase  30.46 
 
 		 790 aa  189  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000196099  hitchhiker  0.000000414181 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  31.25 
 
 		 795 aa  189  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  31.73 
 
 		 794 aa  187  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  33.91 
 
 		 810 aa  187  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1363  phosphoenolpyruvate synthase  30.52 
 
 		 799 aa  187  8e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  33.26 
 
 		 761 aa  187  8e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  30.82 
 
 		 795 aa  187  9e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  30.85 
 
 		 794 aa  187  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  30.53 
 
 		 790 aa  187  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  31.02 
 
 		 789 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  31.06 
 
 		 794 aa  186  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  32.84 
 
 		 806 aa  185  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  30.8 
 
 		 789 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  30.59 
 
 		 789 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  30.59 
 
 		 789 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3257  phosphoenolpyruvate synthase  30.06 
 
 		 839 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2864  phosphoenolpyruvate synthase  30.06 
 
 		 839 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00890686  decreased coverage  0.000201975 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  31.12 
 
 		 795 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  29.44 
 
 		 825 aa  184  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  29.86 
 
 		 789 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  31.67 
 
 		 800 aa  184  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  30.9 
 
 		 795 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  30.26 
 
 		 789 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  32.1 
 
 		 804 aa  182  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  30.21 
 
 		 795 aa  182  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4106  phosphoenolpyruvate synthase  31.6 
 
 		 798 aa  182  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.826747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  31.98 
 
 		 792 aa  181  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  31.06 
 
 		 815 aa  182  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  31.1 
 
 		 808 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  31.39 
 
 		 798 aa  181  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2456  phosphoenolpyruvate synthase  31.89 
 
 		 792 aa  181  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2046  phosphoenolpyruvate synthase  30.9 
 
 		 799 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0453767  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  31.55 
 
 		 821 aa  181  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2481  phosphoenolpyruvate synthase  29.93 
 
 		 789 aa  181  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0281757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>