More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5681 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5681  porin  100 
 
 		 179 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00336613  normal  0.546745 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0933  porin  69.44 
 
 		 374 aa  245  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0662  porin Gram-negative type  60.45 
 
 		 397 aa  197  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228009  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3010  outer membrane protein (porin)  39.06 
 
 		 398 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0680  porin Gram-negative type  41.56 
 
 		 373 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4019  OmpC family outer membrane porin  40.26 
 
 		 373 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000373158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0400  porin  37.43 
 
 		 375 aa  111  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.676022  normal  0.200977 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  34.64 
 
 		 354 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2990  porin  40.12 
 
 		 387 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0177619  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  38.5 
 
 		 389 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  39.25 
 
 		 387 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4800  porin  40.76 
 
 		 367 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5712  porin  39.44 
 
 		 378 aa  104  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  37.97 
 
 		 392 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  37.97 
 
 		 392 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  37.64 
 
 		 373 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  37.64 
 
 		 373 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  37.64 
 
 		 373 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  37.84 
 
 		 388 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  44.69 
 
 		 338 aa  101  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  38.51 
 
 		 376 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  38.64 
 
 		 413 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4994  porin  38.04 
 
 		 381 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  38.2 
 
 		 352 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  38.01 
 
 		 379 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  36.87 
 
 		 378 aa  99  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5504  outer membrane porin  36.52 
 
 		 379 aa  98.6  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  38.71 
 
 		 373 aa  98.6  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4171  porin  37.42 
 
 		 381 aa  97.4  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.315389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  36.31 
 
 		 377 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  39.61 
 
 		 347 aa  97.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  36.31 
 
 		 377 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  40.71 
 
 		 471 aa  97.1  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  36.31 
 
 		 377 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  36.31 
 
 		 377 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  36.31 
 
 		 377 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  36.31 
 
 		 377 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  40.25 
 
 		 382 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  36.31 
 
 		 377 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  38.71 
 
 		 384 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6354  outer membrane protein, (porin)  38.06 
 
 		 373 aa  96.7  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  43.09 
 
 		 390 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3786  putative outer membrane porin  38.38 
 
 		 391 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  36.17 
 
 		 393 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  37.14 
 
 		 376 aa  95.9  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2917  porin  38.71 
 
 		 384 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  36.57 
 
 		 376 aa  95.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2538  porin  35.58 
 
 		 382 aa  95.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.47604 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  36.63 
 
 		 375 aa  94.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  37.34 
 
 		 352 aa  94.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0969  putative outer membrane porin  38.89 
 
 		 359 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.449227  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1952  putative outer membrane porin  38.89 
 
 		 359 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.832177  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3860  putative outer membrane porin signal peptide protein  35.48 
 
 		 384 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.087708  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  37.85 
 
 		 354 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5757  outer membrane porin  36.96 
 
 		 387 aa  93.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  38.42 
 
 		 355 aa  93.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1256  putative outer membrane porin  38.89 
 
 		 359 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2230  putative outer membrane porin  38.89 
 
 		 359 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.856101  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  37.89 
 
 		 374 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  37.5 
 
 		 364 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  36.76 
 
 		 398 aa  92.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  37.5 
 
 		 403 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  37.5 
 
 		 403 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  40.8 
 
 		 365 aa  92  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  39.55 
 
 		 363 aa  92  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5889  porin  37.5 
 
 		 398 aa  91.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1084  porin transmembrane protein  39.1 
 
 		 364 aa  91.7  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00229533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  38.27 
 
 		 379 aa  91.3  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  39.55 
 
 		 396 aa  91.7  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4306  porin Gram-negative type  34.48 
 
 		 354 aa  91.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  36.81 
 
 		 386 aa  91.3  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4416  porin Gram-negative type  34.48 
 
 		 354 aa  91.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  42.54 
 
 		 384 aa  90.9  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  44.03 
 
 		 386 aa  90.9  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  39.52 
 
 		 377 aa  90.9  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  37.36 
 
 		 390 aa  90.9  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1722  outer membrane protein (porin)  35.23 
 
 		 357 aa  90.9  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0914033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  37.09 
 
 		 385 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  38.89 
 
 		 368 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  34.08 
 
 		 367 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1274  porin  38.89 
 
 		 359 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.688217  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3041  outer membrane porin  39.88 
 
 		 359 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2917  outer membrane porin  38.89 
 
 		 359 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  37.36 
 
 		 430 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  36.81 
 
 		 386 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  35.96 
 
 		 371 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  39.31 
 
 		 418 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  37.36 
 
 		 430 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  37.3 
 
 		 430 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  37.36 
 
 		 430 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  39.11 
 
 		 386 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  39.11 
 
 		 386 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  37.36 
 
 		 430 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  38.55 
 
 		 353 aa  89.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  38.89 
 
 		 436 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  37.36 
 
 		 430 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  39.11 
 
 		 386 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  39.11 
 
 		 386 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  36 
 
 		 381 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  38.89 
 
 		 436 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>