More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5132 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5132  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  645    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1829  hypothetical protein  52.52 
 
 		 327 aa  328  8e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4060  hypothetical protein  48.15 
 
 		 334 aa  278  7e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.354383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3405  hypothetical protein  48.15 
 
 		 330 aa  278  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3604  hypothetical protein  46.67 
 
 		 356 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0822  hypothetical protein  43.29 
 
 		 375 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3448  hypothetical protein  45.97 
 
 		 360 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1076  hypothetical protein  45.42 
 
 		 345 aa  264  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  43.79 
 
 		 330 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4699  hypothetical protein  46.86 
 
 		 343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2519  hypothetical protein  43.77 
 
 		 324 aa  252  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0124  twin-arginine translocation pathway signal  44.44 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1233  hypothetical protein  42.37 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1011  hypothetical protein  42.44 
 
 		 395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1427  twin-arginine translocation pathway signal  43.73 
 
 		 334 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  40.19 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  38.77 
 
 		 323 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  44.77 
 
 		 328 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  43.67 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.44 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  41.04 
 
 		 327 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  43.48 
 
 		 328 aa  222  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.33 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.2 
 
 		 336 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  36.84 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  36.73 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.8 
 
 		 331 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  39.03 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  41.92 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  39.38 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  40.4 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  38.65 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.4 
 
 		 339 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  40.79 
 
 		 341 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  41.58 
 
 		 314 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.53 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.53 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  37.82 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.7 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.53 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.2 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.38 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  39.13 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  41.32 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  38.62 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  39.13 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.38 
 
 		 325 aa  210  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  37.42 
 
 		 344 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0546  hypothetical protein  39.51 
 
 		 332 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.371672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  38.24 
 
 		 326 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  34.56 
 
 		 327 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.54 
 
 		 332 aa  208  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  38.7 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  41.01 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.49 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  37.72 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  38.96 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.02 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  40.55 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  37.78 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  41.14 
 
 		 331 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  38.19 
 
 		 343 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  38.82 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.73 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  38.63 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  40.43 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  40.85 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.35 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  38.87 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  38.59 
 
 		 324 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  40.54 
 
 		 326 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3910  hypothetical protein  38.49 
 
 		 332 aa  205  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.032337  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  39.55 
 
 		 324 aa  205  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  39.41 
 
 		 328 aa  205  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  41.7 
 
 		 329 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.46 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.98 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  37.29 
 
 		 324 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4085  hypothetical protein  41.05 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  37.75 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.14 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3683  twin-arginine translocation pathway signal  39.43 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0852906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2931  hypothetical protein  40 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  38.56 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  39.4 
 
 		 335 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  38.1 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  37.77 
 
 		 326 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  35.64 
 
 		 339 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  38.46 
 
 		 337 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.05 
 
 		 333 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.01 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  38.44 
 
 		 331 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  36.75 
 
 		 332 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  35.65 
 
 		 328 aa  202  7e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  41.11 
 
 		 330 aa  202  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  38.96 
 
 		 330 aa  202  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  37.07 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  39.56 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.8 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>