More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5075 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 262 aa  528  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3389  GntR domain protein  53.81 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422325  hitchhiker  0.000247854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0567  GntR family transcriptional regulator  53.81 
 
 		 234 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.837361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2597  GntR domain-containing protein  52.02 
 
 		 230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130942 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3461  GntR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 230 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.488404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3424  GntR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 230 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2462  GntR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 230 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3459  GntR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0381  GntR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 230 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3324  GntR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 230 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1242  GntR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 230 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1202  GntR family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 230 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3731  GntR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.069841  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0566  GntR domain-containing protein  50.67 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821673  normal  0.241322 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0540  GntR domain-containing protein  50.67 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0230635  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0612  GntR domain-containing protein  51.12 
 
 		 240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0162  GntR-like  46.67 
 
 		 291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0645  GntR domain-containing protein  51.12 
 
 		 230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2741  GntR domain-containing protein  50.67 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0412292  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  46.85 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5458  GntR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 235 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5244  transcriptional regulator, GntR family  41.63 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0299  transcriptional regulator GntR  40.79 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2978  GntR domain-containing protein  34.67 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3484  GntR domain-containing protein  34.27 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0607093  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  33.48 
 
 		 254 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0016  GntR domain protein  33.77 
 
 		 254 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  36.21 
 
 		 255 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2254  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385472  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  37.13 
 
 		 222 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0011  GntR domain protein  33.33 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0212  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4879  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1728  GntR domain-containing protein  31.16 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0231  GntR domain-containing protein  36.61 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1885  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  37.68 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  34.9 
 
 		 233 aa  99.4  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  33.02 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  33.82 
 
 		 241 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  30.54 
 
 		 251 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 235 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 233 aa  93.2  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  31.05 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  31.19 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 265 aa  92.8  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  27.94 
 
 		 227 aa  92.8  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01470  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 		 228 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.763826 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  31.36 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 242 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  30.43 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.76 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  29.3 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  30.09 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  27.65 
 
 		 239 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0195  putative transcriptional regulator  31.62 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.361489  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  32.76 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  32.89 
 
 		 239 aa  89.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.09 
 
 		 258 aa  89.4  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  31.13 
 
 		 227 aa  89  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  32.13 
 
 		 249 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  34.42 
 
 		 223 aa  89  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 246 aa  88.6  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  30.22 
 
 		 270 aa  88.6  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0489  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.19 
 
 		 264 aa  89  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298725  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 246 aa  88.6  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0552  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.19 
 
 		 264 aa  89  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.406636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1106  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.19 
 
 		 264 aa  89  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000240199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  30.59 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  32.13 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 236 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  32.53 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  32.53 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  35.44 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  28.3 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  32.24 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  32.24 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  32.24 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.19 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  32.43 
 
 		 235 aa  86.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 228 aa  86.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 229 aa  86.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 226 aa  85.9  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  29.29 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  33.82 
 
 		 231 aa  85.5  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.39 
 
 		 268 aa  85.1  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  32.3 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>