234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3666 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_3531  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  82.28 
 
 
508 aa  903    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3466  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  82.28 
 
 
508 aa  906    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1838  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  78.54 
 
 
508 aa  844    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0579609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3812  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  81.69 
 
 
508 aa  900    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0124586 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2892  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  81.5 
 
 
508 aa  889    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3666  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  100 
 
 
507 aa  1062    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3204  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  81.89 
 
 
508 aa  897    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0359  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  82.87 
 
 
508 aa  908    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3480  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  39.35 
 
 
544 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1537  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.71 
 
 
563 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.61403  hitchhiker  0.000999524 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0325  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.2 
 
 
535 aa  372  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00842285  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2259  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.78 
 
 
532 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0202081  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0216  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.64 
 
 
525 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1909  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  41.79 
 
 
568 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2028  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  38.38 
 
 
533 aa  370  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0312494 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2387  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  37.32 
 
 
535 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2193  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.7 
 
 
535 aa  361  2e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1814  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.98 
 
 
540 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1636  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.45 
 
 
526 aa  348  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6416  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.67 
 
 
517 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2041  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.82 
 
 
508 aa  335  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5360  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.04 
 
 
530 aa  333  6e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0246686  normal  0.191395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1731  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.78 
 
 
540 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4815  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.87 
 
 
531 aa  330  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.427716  normal  0.0343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5282  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.5 
 
 
531 aa  326  5e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1009  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.25 
 
 
522 aa  324  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3735  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.56 
 
 
535 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  hitchhiker  0.00212976 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1314  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.82 
 
 
530 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3980  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.1 
 
 
541 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1874  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.78 
 
 
525 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05991  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.78 
 
 
525 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.694309 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3719  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  36.89 
 
 
506 aa  317  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38806  hitchhiker  0.00209828 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0160  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.14 
 
 
519 aa  316  6e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1847  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.32 
 
 
532 aa  316  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.756784  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3535  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.06 
 
 
528 aa  316  8e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0286  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.64 
 
 
534 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1620  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.39 
 
 
541 aa  307  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.374988  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05461  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.39 
 
 
531 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.121172  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1929  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  33.64 
 
 
534 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.86894  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06001  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.85 
 
 
523 aa  307  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0746  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.35 
 
 
524 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0544  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.08 
 
 
525 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.846124  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06081  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.65 
 
 
526 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07941  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  34.2 
 
 
536 aa  303  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05701  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  35.23 
 
 
523 aa  303  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0622  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  32.92 
 
 
546 aa  292  9e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0604  light-independent protochlorophyllide reductase subunit B  25.7 
 
 
480 aa  176  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0508  nitrogenase  23.68 
 
 
402 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3256  chlorophyllide reductase subunit Z  24.76 
 
 
493 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3743  chlorophyllide reductase subunit Z  24.37 
 
 
493 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000151038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3699  chlorophyllide reductase subunit Z  26.48 
 
 
487 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.166207  hitchhiker  0.00421596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1712  chlorophyllide reductase subunit Z  24.81 
 
 
482 aa  90.5  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0173  chlorophyllide reductase subunit Z  21.99 
 
 
469 aa  86.7  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3999  chlorophyllide reductase subunit Z  24.94 
 
 
483 aa  86.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.464812  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3754  chlorophyllide reductase subunit Z  24.68 
 
 
483 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6435  bacteriochlorophyllide reductase Z subunit  24.37 
 
 
483 aa  84.7  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786393  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2500  chlorophyllide reductase subunit Z  23.75 
 
 
469 aa  83.6  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4028  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  23.75 
 
 
509 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2732  chlorophyllide reductase subunit Z  24.72 
 
 
488 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0556  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  25.15 
 
 
462 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.263807  normal  0.366302 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0157  chlorophyllide reductase subunit Z  23.05 
 
 
469 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0793  nitrogenase  23.89 
 
 
466 aa  82  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2054  chlorophyllide reductase subunit Z  23.33 
 
 
485 aa  81.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0126422 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1295  chlorophyllide reductase subunit Z  23.08 
 
 
482 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0851  chlorophyllide reductase subunit Z  24.52 
 
 
493 aa  80.1  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00549555  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2816  chlorophyllide reductase subunit Z  26.35 
 
 
488 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14348  normal  0.423388 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1614  oxidoreductase/nitrogenase component 1  21.76 
 
 
425 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3519  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit Z  24.17 
 
 
488 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.111024 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0260  putative chlorophyllide reductase, BchZ subunit  24.94 
 
 
491 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1904  chlorophyllide reductase subunit Z  24.94 
 
 
491 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.481662  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0558  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  24.63 
 
 
541 aa  78.2  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000289733  normal  0.238141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  24.29 
 
 
494 aa  77.8  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1147  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.27 
 
 
465 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0359167  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1608  chlorophyllide reductase subunit Z  25 
 
 
509 aa  77.4  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0168  chlorophyllide reductase subunit Z  23.42 
 
 
469 aa  77  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2591  Nitrogenase  24.5 
 
 
463 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160092  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2034  chlorophyllide reductase subunit Z  24.68 
 
 
491 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2978  chlorophyllide reductase subunit Z  24.59 
 
 
480 aa  76.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2909  Nitrogenase  22.58 
 
 
460 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0124  chlorophyllide reductase subunit Z  23.09 
 
 
469 aa  73.6  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.957131  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2816  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  23.53 
 
 
448 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0177  chlorophyllide reductase subunit Z  21.64 
 
 
468 aa  71.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1153  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  24.15 
 
 
454 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0447596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4029  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  20.55 
 
 
466 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0093  Nitrogenase  26.35 
 
 
511 aa  70.1  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2608  Nitrogenase  21.33 
 
 
459 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00388329  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0148  nitrogenase  21.17 
 
 
459 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2010  nitrogenase  23.83 
 
 
448 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.696694  normal  0.320293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2004  nitrogenase  25.15 
 
 
515 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.811675 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1716  chlorophyllide reductase subunit Z  23.54 
 
 
468 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0772  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  25.8 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2616  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  21.14 
 
 
544 aa  67.4  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.941004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1199  nitrogenase component I, alpha chain  19.15 
 
 
476 aa  67  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0060  nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis protein NifE  19.33 
 
 
476 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.477113  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1145  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain  23.46 
 
 
546 aa  66.6  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990957 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0146  nitrogenase component I, alpha chain  21.68 
 
 
482 aa  66.6  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0166  nitrogenase associated protein E  23.03 
 
 
518 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2702  nitrogenase-related protein  22.22 
 
 
431 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00973436  normal  0.117239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1997  nitrogenase  24.37 
 
 
452 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0403  oxidoreductase/nitrogenase component 1  32.38 
 
 
430 aa  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.455367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>