89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3039 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3039  secretion protein HlyD  100 
 
 		 509 aa  1007    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598574  normal  0.745605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1130  secretion protein HlyD  44.51 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.0570738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1754  secretion protein HlyD family protein  40.98 
 
 		 486 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0938  secretion protein HlyD family protein  29.52 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000158667  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0405  membrane-fusion protein  29.85 
 
 		 422 aa  206  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.390525  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0894  chromosome segregation ATPase-like protein  37 
 
 		 666 aa  202  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0093  membrane-fusion protein  28.06 
 
 		 422 aa  196  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.149408  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6117  type I secretion adaptor protein  27.6 
 
 		 439 aa  150  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2502  hypothetical protein  33.1 
 
 		 373 aa  130  8.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.507952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0111  hypothetical protein  31.69 
 
 		 312 aa  97.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0871  hypothetical protein  30.41 
 
 		 372 aa  87  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  27.12 
 
 		 549 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  27.12 
 
 		 549 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.69 
 
 		 514 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  25.97 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.3 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.77 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2229  hypothetical protein  34.78 
 
 		 169 aa  65.1  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.513911  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0567  secretion protein HlyD family  22.62 
 
 		 491 aa  63.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  22.82 
 
 		 417 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6495  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.54 
 
 		 479 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3697  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.86 
 
 		 481 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  23.55 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.38 
 
 		 474 aa  57  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  21.97 
 
 		 509 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  21.97 
 
 		 509 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3121  secretion protein HlyD family protein  20.55 
 
 		 498 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.16 
 
 		 474 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.73 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2166  secretion protein HlyD family protein  22.84 
 
 		 431 aa  54.7  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892226  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.48 
 
 		 480 aa  53.9  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.57 
 
 		 480 aa  53.9  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.52 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1732  putative secretion protein  23.48 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.68 
 
 		 465 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1002  putative secretion protein  23.48 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3518  secretion protein HlyD family protein  24.32 
 
 		 550 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1816  putative secretion protein  23.48 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0165273  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0276  putative secretion protein  23.48 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396567  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1320  putative secretion protein  23.48 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600864  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0289  secretion protein, putative  23.48 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.68 
 
 		 465 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1140  secretion protein, putative  23.11 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.03 
 
 		 447 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  24.87 
 
 		 457 aa  52  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  22.99 
 
 		 390 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.22 
 
 		 447 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.540903  normal  0.68595 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1567  hemolysin secretion protein D  22.78 
 
 		 473 aa  50.4  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.496852  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.68 
 
 		 433 aa  50.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  24.87 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  24.87 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  23.08 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0224  secretion protein HlyD  28.92 
 
 		 627 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.68 
 
 		 491 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.65 
 
 		 509 aa  48.5  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0787  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.55 
 
 		 403 aa  47.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.59 
 
 		 456 aa  47.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.295152  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  21.93 
 
 		 498 aa  47.4  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1500  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.38 
 
 		 473 aa  47.4  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1890  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  20.59 
 
 		 456 aa  47.4  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0786  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.76 
 
 		 472 aa  47  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.378265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.2 
 
 		 477 aa  47  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.22 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4345  secretion protein HlyD family protein  25.18 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0751758  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4553  secretion protein HlyD family protein  24.05 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0947  auxiliary membrane fusion protein family transporter  23.64 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.324185  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.94 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.14 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  24.91 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0850  secretion protein HlyD family protein  22.75 
 
 		 379 aa  46.2  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000138704  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2559  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.77 
 
 		 446 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3148  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.16 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  23.43 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3156  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.77 
 
 		 446 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3355  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.48 
 
 		 446 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01631  membrane-fusion protein  26.29 
 
 		 414 aa  45.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.160838  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0052  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.99 
 
 		 395 aa  45.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  30 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  22.84 
 
 		 481 aa  44.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.69 
 
 		 439 aa  44.7  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  21.06 
 
 		 430 aa  43.9  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10350  putative secretion protein  23.1 
 
 		 418 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0621  secretion protein HlyD  30.1 
 
 		 710 aa  43.9  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749458  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2977  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  21.6 
 
 		 435 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.72 
 
 		 350 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  22.61 
 
 		 434 aa  43.5  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  23.43 
 
 		 457 aa  43.5  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  35.29 
 
 		 390 aa  43.5  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.01612  normal  0.250186 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2843  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family protein  23.53 
 
 		 404 aa  43.5  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>