More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3075 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3075  Polyprenyl synthetase  100 
 
 
296 aa  585  1e-166  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  48.79 
 
 
299 aa  239  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  50.99 
 
 
299 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  44.36 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  47.15 
 
 
306 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  43.28 
 
 
316 aa  206  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  47.01 
 
 
295 aa  205  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  47.58 
 
 
299 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  44.61 
 
 
320 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  43.59 
 
 
295 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  42.27 
 
 
300 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  43.4 
 
 
299 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  47.39 
 
 
297 aa  202  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  45.28 
 
 
300 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  41.52 
 
 
300 aa  201  9e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  39.41 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1082  geranyltranstransferase  44.15 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  44.19 
 
 
337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  44.53 
 
 
299 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  47.04 
 
 
295 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  41.58 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  44.7 
 
 
315 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  44.19 
 
 
307 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  43.94 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  44.03 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  51.95 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  44.03 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  48.97 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  45.83 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  40.68 
 
 
300 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  39.78 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  39.93 
 
 
294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  41.96 
 
 
290 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  45.25 
 
 
297 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  41.57 
 
 
290 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  39.18 
 
 
299 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  44.06 
 
 
301 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  44.94 
 
 
294 aa  193  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  45.52 
 
 
297 aa  192  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  43.26 
 
 
297 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  41.06 
 
 
294 aa  190  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  44.7 
 
 
296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1719  polyprenyl synthetase  53.85 
 
 
299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130705  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  42.03 
 
 
327 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  40.27 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3372  polyprenyl synthetase  42.19 
 
 
298 aa  189  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  41.81 
 
 
299 aa  188  8e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  48.88 
 
 
298 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  48.93 
 
 
306 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  41.14 
 
 
294 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  42.8 
 
 
294 aa  186  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  41.14 
 
 
294 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  41.14 
 
 
294 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  42 
 
 
294 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  41.14 
 
 
294 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  42.97 
 
 
293 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  43.12 
 
 
293 aa  185  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  45.18 
 
 
297 aa  185  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  41.48 
 
 
309 aa  185  8e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2439  Polyprenyl synthetase  37.8 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.097508  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  40.8 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  40.55 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  43.23 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  43.14 
 
 
297 aa  183  3e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  46.79 
 
 
296 aa  183  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  42.91 
 
 
293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  42.91 
 
 
293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  42.91 
 
 
293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  42.38 
 
 
294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  42.38 
 
 
294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  42.38 
 
 
294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  41.67 
 
 
294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  42.33 
 
 
293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  42.38 
 
 
294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  41.95 
 
 
296 aa  182  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  42.38 
 
 
294 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  42.38 
 
 
294 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  42.38 
 
 
294 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  42.86 
 
 
293 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  43.58 
 
 
297 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  45.19 
 
 
292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  41.5 
 
 
297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  45.77 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  48.1 
 
 
297 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  45.66 
 
 
296 aa  179  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  49.18 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3282  polyprenyl synthetase  42.57 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  44.1 
 
 
293 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  42.75 
 
 
293 aa  179  7e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  43.32 
 
 
300 aa  179  7e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1613  polyprenyl synthetase  42.8 
 
 
293 aa  178  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1037  farnesyl-diphosphate synthase  44.76 
 
 
311 aa  178  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.101791 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  42.75 
 
 
293 aa  178  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1580  polyprenyl synthetase  42.8 
 
 
293 aa  178  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.211276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  43.79 
 
 
297 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  43.03 
 
 
298 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  45.86 
 
 
290 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2278  hypothetical protein  39.63 
 
 
298 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2250  hypothetical protein  40 
 
 
298 aa  176  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  45.19 
 
 
296 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>