97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2521 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2521  Patatin  100 
 
 
420 aa  808    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4934  Patatin  58.78 
 
 
429 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.791288  normal  0.414026 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  26.68 
 
 
383 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  29.34 
 
 
421 aa  116  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3141  patatin  24.74 
 
 
375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133686  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1274  patatin  29.09 
 
 
376 aa  113  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.534062  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  31.9 
 
 
382 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  29.05 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  27.97 
 
 
379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0853  patatin  29.75 
 
 
382 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000107118  unclonable  0.000000108981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  31.89 
 
 
382 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  31.19 
 
 
389 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2513  Patatin  32.56 
 
 
400 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.220838  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  26.18 
 
 
374 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1761  patatin  32.76 
 
 
376 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3260  patatin  24.93 
 
 
375 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  30.26 
 
 
391 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  26.94 
 
 
374 aa  103  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2426  Patatin  32.31 
 
 
400 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  25 
 
 
377 aa  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  30.03 
 
 
389 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  25.13 
 
 
374 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  30.03 
 
 
416 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  25.51 
 
 
374 aa  102  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  25.13 
 
 
374 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  32.23 
 
 
382 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  32.73 
 
 
400 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  31.98 
 
 
382 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  25.13 
 
 
374 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  25 
 
 
383 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3101  patatin  27.84 
 
 
378 aa  99.8  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.480347  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  25 
 
 
374 aa  99.8  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  25 
 
 
374 aa  99.8  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  24.74 
 
 
374 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2853  hypothetical protein  26.53 
 
 
370 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2547  patatin  26.03 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  29.79 
 
 
393 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2722  hypothetical protein  26.26 
 
 
370 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  26.78 
 
 
374 aa  98.2  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0365  patatin  31.38 
 
 
410 aa  98.2  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0673192  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1094  Patatin  33.68 
 
 
381 aa  97.8  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.982413  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0108  patatin  28.94 
 
 
422 aa  97.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  34.45 
 
 
419 aa  96.7  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0441  patatin family phospholipase  31.03 
 
 
414 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0422  patatin family phospholipase  31.03 
 
 
415 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.272938  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0605  patatin  31.03 
 
 
414 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0078  patatin  28.57 
 
 
418 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.767923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  25.52 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1160  alpha-beta hydrolase family esterase  33.44 
 
 
400 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1352  patatin family phospholipase  31.03 
 
 
300 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.620499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0242  patatin  31.03 
 
 
300 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.314598  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0395  patatin  31.06 
 
 
463 aa  94  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00554522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  28.99 
 
 
390 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2821  patatin  30.48 
 
 
408 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.438344 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2924  patatin  32.08 
 
 
408 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.761866 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2472  patatin  27.07 
 
 
408 aa  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.797753  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  34.31 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  34.31 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2295  patatin  32.08 
 
 
408 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0597208  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2157  patatin  27.68 
 
 
392 aa  92  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128779  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2958  patatin  30.48 
 
 
408 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2909  patatin  32.08 
 
 
408 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1615  patatin  27.85 
 
 
394 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793061  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4479  patatin  28.93 
 
 
425 aa  90.1  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493587  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6252  patatin  30.82 
 
 
408 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0978  patatin  30.72 
 
 
422 aa  87.8  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3870  patatin family protein  27.6 
 
 
393 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.838023  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2805  Patatin  31.41 
 
 
410 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0168  Patatin  27.81 
 
 
394 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0306  hypothetical protein  27.66 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3832  patatin  28.64 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0161  Patatin  28.12 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4076  Patatin  31 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4614  patatin  27.66 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.758512  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3273  patatin  27.9 
 
 
427 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1844  patatin  29.57 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.237436  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2250  hypothetical protein  32.13 
 
 
394 aa  71.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  25.09 
 
 
332 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  29.21 
 
 
377 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  28.53 
 
 
377 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  24.55 
 
 
291 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3682  Patatin  29.02 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  27 
 
 
387 aa  47.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  27.55 
 
 
375 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  28.09 
 
 
303 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  22.33 
 
 
343 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  21.05 
 
 
334 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  26.96 
 
 
382 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1068  patatin family phospholipase  27.5 
 
 
356 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0343802 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  28.68 
 
 
306 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  27.27 
 
 
358 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3007  Patatin  22.41 
 
 
331 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  28.42 
 
 
306 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  27.51 
 
 
308 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  29.39 
 
 
386 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  27.27 
 
 
414 aa  43.1  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  27.09 
 
 
375 aa  43.5  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.664139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>