227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2402 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2402  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 272 aa  535  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290341  hitchhiker  0.00583984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  36.82 
 
 		 306 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  35.32 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  32.43 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  30.5 
 
 		 274 aa  92.4  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  48.62 
 
 		 361 aa  89.7  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  29.97 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  41.59 
 
 		 361 aa  85.9  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  51.19 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  29.79 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1974  transcriptional regulator, MerR family  30.96 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000269645  unclonable  0.0000000367636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  52.78 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  34.76 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  30.33 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  31.88 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  22.27 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  50 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  23.11 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  40.82 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  23.85 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  20.85 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13800  predicted transcriptional regulator  50.77 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  48.53 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  48.57 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  45.21 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  22.49 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  26.85 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  50 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2029  regulatory protein, MerR  39.78 
 
 		 178 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115977  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  33.85 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16760  predicted transcriptional regulator  37.93 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.498002 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  41.46 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  21.74 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  28.07 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  21.19 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  21.28 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  21.28 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 282 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  28.7 
 
 		 276 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  21.12 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  21.12 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  40.48 
 
 		 399 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  26.85 
 
 		 276 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  37.36 
 
 		 215 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  37.36 
 
 		 214 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  30.77 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  21.28 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0888  transcriptional regulator, MerR family  33.06 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  36.27 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  48.48 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 143 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 143 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  34.31 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  38.67 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 143 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  22.99 
 
 		 271 aa  49.3  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  22.22 
 
 		 257 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  33.33 
 
 		 280 aa  48.9  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  25.17 
 
 		 142 aa  48.9  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1604  MerR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 132 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>