More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0962 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 292 aa  588  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  72.26 
 
 		 293 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  57.39 
 
 		 292 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  59.93 
 
 		 297 aa  364  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  60 
 
 		 295 aa  359  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  56.21 
 
 		 291 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  56.21 
 
 		 291 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  58.9 
 
 		 294 aa  331  7.000000000000001e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 		 290 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  51.38 
 
 		 290 aa  306  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 		 290 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1762  dihydrodipicolinate synthase  50.86 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  52.07 
 
 		 290 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  52.41 
 
 		 290 aa  301  8.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 		 290 aa  295  8e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 		 294 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  48.62 
 
 		 290 aa  286  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  47.59 
 
 		 294 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 		 292 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 		 294 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  46.55 
 
 		 319 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  49.14 
 
 		 291 aa  278  6e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  48.45 
 
 		 293 aa  276  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  48.94 
 
 		 288 aa  277  2e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  48.46 
 
 		 293 aa  275  9e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  47.24 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  47.93 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  44.83 
 
 		 292 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  46.67 
 
 		 295 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 		 293 aa  272  5.000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  44.9 
 
 		 294 aa  271  7e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  49.31 
 
 		 289 aa  271  7e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  44.64 
 
 		 297 aa  271  1e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  50 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  44.9 
 
 		 294 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 		 290 aa  269  4e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  49.65 
 
 		 289 aa  268  7e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  46.04 
 
 		 291 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  45.52 
 
 		 294 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 		 292 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  49.3 
 
 		 289 aa  266  4e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0072  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 304 aa  265  5.999999999999999e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1663  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 292 aa  264  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 292 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  43.4 
 
 		 297 aa  265  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 292 aa  264  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  44.72 
 
 		 301 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  44.01 
 
 		 300 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  44.01 
 
 		 300 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  44.01 
 
 		 300 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  44.93 
 
 		 297 aa  263  4e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  44.01 
 
 		 300 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  44.01 
 
 		 300 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  44.01 
 
 		 300 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  44.01 
 
 		 300 aa  262  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  44.01 
 
 		 300 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  44.01 
 
 		 300 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  44.01 
 
 		 300 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 292 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  44.01 
 
 		 301 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 		 301 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  45.8 
 
 		 297 aa  261  8e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35340  dihydrodipicolinate synthase  45.96 
 
 		 287 aa  261  8.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1552  dihydrodipicolinate synthase  45.26 
 
 		 286 aa  260  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224782  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  46.85 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 294 aa  259  4e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  44.01 
 
 		 301 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  45.61 
 
 		 296 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  46.47 
 
 		 290 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  42.37 
 
 		 300 aa  258  7e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  46.05 
 
 		 296 aa  258  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  46.39 
 
 		 293 aa  258  9e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  44.37 
 
 		 292 aa  257  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4387  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 292 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  43.66 
 
 		 294 aa  255  5e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 298 aa  256  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51270  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 		 292 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 		 298 aa  255  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 		 298 aa  256  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 		 292 aa  255  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  43.31 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2476  dihydrodipicolinate synthase  44.1 
 
 		 290 aa  255  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  45.3 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  46.5 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  43.1 
 
 		 296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3473  dihydrodipicolinate synthase  45.17 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0644338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  45.92 
 
 		 323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  44.56 
 
 		 296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  44.21 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 		 296 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  43.24 
 
 		 296 aa  252  6e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  44.3 
 
 		 308 aa  252  6e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 		 292 aa  251  8.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  42.51 
 
 		 291 aa  251  9.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  41.55 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  43.51 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  43.51 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>