More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1421 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  100 
 
 
235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  59.48 
 
 
236 aa  288  7e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  59.48 
 
 
236 aa  288  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  59.91 
 
 
241 aa  287  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  59.74 
 
 
236 aa  286  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  60.52 
 
 
277 aa  281  8.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0600  ABC transporter related  60.94 
 
 
234 aa  270  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  57.08 
 
 
237 aa  268  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  56.03 
 
 
280 aa  262  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  51.06 
 
 
247 aa  260  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  54.74 
 
 
245 aa  260  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  55.79 
 
 
276 aa  258  7e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3135  ABC transporter related  55.32 
 
 
242 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  56.84 
 
 
243 aa  257  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  54.04 
 
 
284 aa  257  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  54.08 
 
 
260 aa  254  9e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  53.65 
 
 
290 aa  254  9e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  53.88 
 
 
289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  55.79 
 
 
249 aa  253  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0716  ABC transporter related  54.04 
 
 
245 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0745  ABC transporter related  54.04 
 
 
245 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3089  ABC transporter related protein  58.37 
 
 
234 aa  249  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  53.88 
 
 
271 aa  248  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1737  ABC transporter related protein  58.37 
 
 
234 aa  248  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  51.07 
 
 
257 aa  246  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  52.59 
 
 
279 aa  246  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  52.97 
 
 
245 aa  240  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  48.93 
 
 
256 aa  240  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  52.16 
 
 
242 aa  239  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  50.64 
 
 
286 aa  235  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  51.07 
 
 
236 aa  235  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  51.57 
 
 
233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2095  ABC transporter related  54.7 
 
 
276 aa  231  7.000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156364  normal  0.0133806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  48.5 
 
 
237 aa  230  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  49.14 
 
 
235 aa  229  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.15 
 
 
234 aa  228  9e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  48.51 
 
 
238 aa  226  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  49.35 
 
 
238 aa  226  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  48.29 
 
 
237 aa  226  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  48.29 
 
 
238 aa  225  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  49.79 
 
 
236 aa  225  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  50.86 
 
 
234 aa  224  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0815  ATPase  47.66 
 
 
243 aa  223  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  45.73 
 
 
238 aa  221  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  46.75 
 
 
231 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  48.07 
 
 
237 aa  220  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  48.5 
 
 
237 aa  220  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3093  ABC transporter related  48.72 
 
 
245 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  47.01 
 
 
235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  50 
 
 
245 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1826  ABC transporter related  47.62 
 
 
231 aa  218  5e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  47.01 
 
 
234 aa  218  5e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 
233 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  47.01 
 
 
235 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  47.21 
 
 
233 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  43.83 
 
 
238 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3396  ABC transporter related  47.21 
 
 
238 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0282544 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  46.78 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0866  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173602  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4943  ABC transporter related  46.78 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4428  ABC transporter related  46.78 
 
 
233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693118 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  47.64 
 
 
235 aa  215  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0655  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.78 
 
 
233 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.279613 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5015  ABC transporter related  46.78 
 
 
233 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5272  ABC transporter related  46.78 
 
 
233 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  46.58 
 
 
234 aa  215  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  47.64 
 
 
258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 
235 aa  214  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  47.77 
 
 
239 aa  214  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  44.02 
 
 
234 aa  214  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  45.92 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 
235 aa  214  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  44.64 
 
 
242 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  45.26 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2476  ABC transporter-related protein  46.35 
 
 
233 aa  213  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.865811  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  44.64 
 
 
242 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  48.72 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3960  ABC transporter related  50 
 
 
235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3352  ABC transporter related  46.35 
 
 
233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  45.49 
 
 
238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  45.49 
 
 
238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  49.58 
 
 
237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0988  ABC transporter-related protein  45.34 
 
 
247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2754  ABC transporter related  45.3 
 
 
238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  43.35 
 
 
235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  46.35 
 
 
233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3510  ABC transporter-related protein  46.69 
 
 
247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.06 
 
 
238 aa  211  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  46.81 
 
 
239 aa  211  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4524  ABC transporter related  46.06 
 
 
247 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180068  normal  0.792034 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  45.96 
 
 
236 aa  210  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  45.73 
 
 
235 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3204  ABC transporter related  44.44 
 
 
237 aa  211  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4656  ABC transporter related  46.06 
 
 
247 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114918 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3339  ABC transporter related  48.5 
 
 
233 aa  210  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2250  ABC transporter related  45.3 
 
 
238 aa  210  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  44.21 
 
 
242 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
259 aa  210  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  44.87 
 
 
236 aa  210  2e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3843  ABC transporter related  48.5 
 
 
235 aa  209  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>