More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1136 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1136  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  615  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01279  putative transcriptional regulator with periplasmic binding protein domain (LysR family)  48.06 
 
 		 307 aa  265  5e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0224916  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1757  transcriptional regulator, LysR family  53.33 
 
 		 310 aa  264  2e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4539  LysR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.28189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3825  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  48.39 
 
 		 307 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1430  LysR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.596969  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1351  LysR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4046  LysR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19100  transcriptional regulator, LysR family  49.1 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.672089  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3833  LysR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 307 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0769  LysR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1296  LysR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.46858  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1901  putative transcriptional regulator  47.48 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22470  LysR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0122765  hitchhiker  0.000000469703 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0700  putative transcriptional regulator  50.67 
 
 		 326 aa  235  6e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2193  transcriptional regulator, LysR family protein  41.88 
 
 		 299 aa  230  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000418662  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1789  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2438  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1930  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2030  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 302 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2431  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 302 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2315  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 302 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.958011  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1875  regulatory protein, LysR  42.24 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1852  LysR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2032  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10229  hitchhiker  0.000329187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1889  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.457269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2089  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.419213 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1944  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 300 aa  222  6e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2021  LysR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 299 aa  220  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.58425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2088  LysR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.82775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2584  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3745  putative transcriptional regulator  41.03 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7777  transcriptional regulator, LysR family  41.24 
 
 		 310 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1027  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.361847  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4464  transcriptional regulator, LysR family  33.81 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5255  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 298 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.443087  normal  0.0197845 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2089  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2324  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 306 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1503  transcriptional regulator, LysR family  35.8 
 
 		 306 aa  135  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0885147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50160  LysR family transcriptional regulator protein  34.15 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1734  transcriptional regulator, LysR family  34.48 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2294  LysR substrate binding domain-containing protein  33.6 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0349652 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2406  LysR substrate binding domain-containing protein  33.6 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal  0.0417714 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3030  LysR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.503722  normal  0.316328 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2193  LysR substrate binding domain protein  33.6 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.453125  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2247  LysR substrate binding domain protein  33.6 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160886  normal  0.244849 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2296  LysR substrate binding domain protein  33.6 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0629525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2592  putative transcriptional regulator  29.61 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1043  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6122  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2614  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00872541  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1769  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01918  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.39 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.577058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01904  hypothetical protein  32.39 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.444507  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2727  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2652  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1604  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2949  transcriptional regulator, LysR family  31.98 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.666822  hitchhiker  0.000000000477709 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2153  LysR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1044  LysR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1784  transcriptional regulator, LysR family  31.17 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4296  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1570  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0308383  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1642  transcriptional regulator, LysR family  31.98 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0837368  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1217  transcriptional regulator, LysR family  31.98 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.50196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1625  LysR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.27656 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2306  LysR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2629  LysR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0897024  normal  0.716838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00136  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0939848  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0757  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 300 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827898 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1428  transcriptional regulator, LysR family  29.1 
 
 		 322 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1733  transcriptional regulator, LysR family  29 
 
 		 304 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.540209  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2269  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1984  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.482578  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1965  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2021  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424738 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3588  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2375  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1672  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.551623  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05788  transcriptional regulator  28.52 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000157  transcriptional regulator LysR family  28.41 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204379  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2325  transcriptional regulator, LysR family protein  26.97 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.695132  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2153  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.638305 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1907  LysR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2161  regulatory protein, LysR  29.26 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1088  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 307 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0130625 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5712  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.462122 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1388  LysR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.837907  normal  0.0605197 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4973  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 312 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00010332  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5474  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.361907  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3011  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2686  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.524728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2290  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000611943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2362  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0454134  normal  0.136219 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3204  transcriptional regulator, LysR family  30.99 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.340375 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2480  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0120237  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3318  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2996  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1875  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3283  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.995558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>