80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0744 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0744  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 642 aa  1311    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.19 
 
 		 652 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  29.18 
 
 		 666 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.2 
 
 		 640 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  40 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.59 
 
 		 613 aa  64.3  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.03 
 
 		 647 aa  60.1  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.35 
 
 		 548 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  22.35 
 
 		 607 aa  57  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  22.95 
 
 		 564 aa  57  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  24.41 
 
 		 529 aa  55.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.96 
 
 		 616 aa  54.7  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  29.46 
 
 		 584 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  27.51 
 
 		 712 aa  52.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.97 
 
 		 708 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.28 
 
 		 550 aa  52.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  21.54 
 
 		 598 aa  52  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.79 
 
 		 594 aa  52  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1398  hypothetical protein  29.6 
 
 		 697 aa  52  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  22.83 
 
 		 439 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1796  hypothetical protein  33.73 
 
 		 676 aa  51.2  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  19.5 
 
 		 626 aa  51.2  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  20.19 
 
 		 626 aa  50.8  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  29.82 
 
 		 382 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  29.82 
 
 		 382 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  30.23 
 
 		 409 aa  49.3  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  24.79 
 
 		 390 aa  49.3  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  25.37 
 
 		 367 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  25.37 
 
 		 367 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  32.43 
 
 		 411 aa  48.9  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.13 
 
 		 595 aa  48.9  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  28.15 
 
 		 659 aa  48.5  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  28.1 
 
 		 457 aa  48.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05008  hypothetical protein  23.86 
 
 		 658 aa  48.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  33.33 
 
 		 653 aa  48.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  29.06 
 
 		 376 aa  48.1  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  25.48 
 
 		 628 aa  47.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0565  hypothetical protein  27.78 
 
 		 556 aa  47.4  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  27.5 
 
 		 382 aa  47.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  29.56 
 
 		 703 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  23.03 
 
 		 680 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  30.67 
 
 		 566 aa  47.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1680  hypothetical protein  28.87 
 
 		 771 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0387712  normal  0.041067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3501  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  41.07 
 
 		 582 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  25.21 
 
 		 442 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.15 
 
 		 608 aa  47  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  30.77 
 
 		 688 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  28.08 
 
 		 670 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  31.67 
 
 		 386 aa  46.2  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  38.3 
 
 		 356 aa  45.8  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003897  hypothetical protein  28.57 
 
 		 643 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0901  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.89 
 
 		 672 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  37.31 
 
 		 369 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  39.29 
 
 		 663 aa  45.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.85 
 
 		 591 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1458  hypothetical protein  32.35 
 
 		 431 aa  45.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  40.48 
 
 		 496 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  23.13 
 
 		 422 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0143  ATP-dependent OLD family endonuclease  29.07 
 
 		 681 aa  45.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128728  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  23.37 
 
 		 674 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.33 
 
 		 608 aa  45.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  26.92 
 
 		 588 aa  44.7  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  26.67 
 
 		 708 aa  45.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  29.21 
 
 		 388 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  28.09 
 
 		 395 aa  44.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  19.95 
 
 		 424 aa  44.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  32.22 
 
 		 378 aa  45.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  23.87 
 
 		 399 aa  44.7  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  29.05 
 
 		 596 aa  44.3  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  30.68 
 
 		 441 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  28.87 
 
 		 385 aa  44.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  23.81 
 
 		 378 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  34.52 
 
 		 586 aa  44.7  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  46.67 
 
 		 1171 aa  44.3  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.53 
 
 		 615 aa  44.3  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  25.33 
 
 		 392 aa  44.3  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  41.46 
 
 		 398 aa  43.9  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  27 
 
 		 390 aa  43.9  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  27 
 
 		 390 aa  43.9  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  30.28 
 
 		 591 aa  43.9  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>