More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1170 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  100 
 
 		 326 aa  669    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  91.1 
 
 		 326 aa  617  1e-176  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  91.41 
 
 		 327 aa  620  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  87.73 
 
 		 327 aa  596  1e-169  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  88.65 
 
 		 327 aa  596  1e-169  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  84.05 
 
 		 327 aa  574  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  80.06 
 
 		 327 aa  544  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  60.06 
 
 		 320 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  58.73 
 
 		 318 aa  381  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  57.96 
 
 		 317 aa  379  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  57.96 
 
 		 319 aa  376  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  57.46 
 
 		 317 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  57.78 
 
 		 320 aa  374  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  56.83 
 
 		 317 aa  362  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  56.51 
 
 		 317 aa  357  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  54.78 
 
 		 314 aa  337  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  54.78 
 
 		 314 aa  337  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  52.86 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  50.16 
 
 		 311 aa  323  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  50.34 
 
 		 317 aa  320  3e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  52.53 
 
 		 315 aa  317  1e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  51.47 
 
 		 321 aa  315  9e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  53.75 
 
 		 313 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  49.19 
 
 		 312 aa  311  9e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  50.5 
 
 		 306 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  49.03 
 
 		 313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  48.21 
 
 		 310 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  52.77 
 
 		 311 aa  302  7.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  55.67 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  47.88 
 
 		 310 aa  299  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  54.4 
 
 		 318 aa  298  7e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  54.55 
 
 		 311 aa  296  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  50.81 
 
 		 311 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  48.86 
 
 		 314 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  46.62 
 
 		 325 aa  292  6e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  51.02 
 
 		 311 aa  291  9e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  46.84 
 
 		 305 aa  289  4e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  50.34 
 
 		 313 aa  289  5.0000000000000004e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  50.49 
 
 		 314 aa  286  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  46.47 
 
 		 321 aa  283  4.0000000000000003e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  47.57 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  53.02 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  45.37 
 
 		 315 aa  279  4e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  46.38 
 
 		 314 aa  278  8e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  46.13 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  46.45 
 
 		 312 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  46.71 
 
 		 312 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  46.13 
 
 		 312 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  43.65 
 
 		 324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  45.3 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  48.32 
 
 		 319 aa  266  5e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  46.98 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  44.55 
 
 		 592 aa  252  6e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  45.07 
 
 		 308 aa  251  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  45.18 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  42.95 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  43.67 
 
 		 332 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  43.14 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  40.45 
 
 		 348 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  42.49 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  42.95 
 
 		 318 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  40.69 
 
 		 347 aa  229  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  42.33 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  41.84 
 
 		 317 aa  229  6e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  40.34 
 
 		 322 aa  228  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  43.34 
 
 		 342 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  40.33 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  39 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  41.64 
 
 		 340 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  39.88 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  41.69 
 
 		 342 aa  226  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  38.31 
 
 		 313 aa  225  7e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  40.89 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  40.26 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  42.95 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4275  transketolase central region  39.49 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  42.95 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  40 
 
 		 323 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  38.83 
 
 		 332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  42.62 
 
 		 332 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  39.63 
 
 		 339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  42.28 
 
 		 332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  40.85 
 
 		 689 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  41.25 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  39.32 
 
 		 339 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  39.32 
 
 		 339 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  40.89 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3958  transketolase subunit B  39.87 
 
 		 340 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.158278  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4383  Transketolase central region  40.88 
 
 		 342 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967269  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6139  Transketolase central region  41.42 
 
 		 332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  42.81 
 
 		 317 aa  215  9e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  42.16 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3618  transketolase subunit B  38.41 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189872  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3641  transketolase, central region  38.22 
 
 		 334 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3003  transketolase central region  39.56 
 
 		 340 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5659  Transketolase central region  40.07 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.252415  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  39.59 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  42.65 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  42.65 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  42.65 
 
 		 317 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>