82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0928 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0928  CRISPR-associated protein Cas2  100 
 
 		 94 aa  193  7e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.98778  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2055  CRISPR-associated Cas2 family protein  87.23 
 
 		 94 aa  171  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2458  CRISPR-associated protein Cas2  77.66 
 
 		 94 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.455052  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2334  CRISPR-associated protein Cas2  65.96 
 
 		 94 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4177  hypothetical protein  46.15 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344603  hitchhiker  0.0000136631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2484  CRISPR-associated Cas2 family protein  48.75 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00090653  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4556  CRISPR-associated protein Cas2  50.6 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2235  CRISPR-associated Cas2 family protein  50.7 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2387  CRISPR-associated Cas2 family protein  47.19 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2060  CRISPR-associated Cas2 family protein  39.56 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1985  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.25 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.503159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1356  CRISPR-associated Cas2 family protein  40.22 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2674  CRISPR-associated Cas2 family protein  46.84 
 
 		 91 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3010  CRISPR-associated Cas2 family protein  44.3 
 
 		 91 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000764596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2973  CRISPR-associated protein Cas2  42.86 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5842  CRISPR-associated protein Cas2  40.96 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5341  CRISPR-associated protein Cas2  40.43 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.29646 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3452  CRISPR-associated protein Cas2  45 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0545024  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1626  CRISPR-associated Cas2 family protein  45.12 
 
 		 92 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1719  CRISPR-associated protein Cas2  38.96 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66907e-22 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0520  CRISPR-associated protein Cas2  35.87 
 
 		 97 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000806628  hitchhiker  0.000000945034 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1560  CRISPR-associated Cas2 family protein  37.8 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2463  CRISPR-associated protein Cas2  36.84 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.556859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0503  CRISPR-associated protein Cas2  35.87 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1301  hypothetical protein  32.99 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.312014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1430  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.99 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0151581  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2840  CRISPR-associated protein Cas2  37.8 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.016788  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1748  hypothetical protein  39.44 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1663  CRISPR-associated protein Cas2  32.99 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0276459  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3505  hypothetical protein  34.12 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.310945  normal  0.541343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0834  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.08 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0441097  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1004  hypothetical protein  32.99 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000128367  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1977  CRISPR-associated protein Cas2  32.99 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0971  hypothetical protein  44.62 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3525  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.25 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02695  crispr-associated protein Cas2  35.63 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.617835  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3579  CRISPR-associated protein Cas2  33.33 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0791  CRISPR-associated protein Cas2  36.46 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.551484  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0150  CRISPR-associated protein Cas2  42.86 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.752001 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2972  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.96 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2650  CRISPR-associated protein Cas2  36.36 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000760904  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1935  hypothetical protein  31.96 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0492  hypothetical protein  31.96 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0853  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.468384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0233  hypothetical protein  45.07 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0481  hypothetical protein  37.33 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.187986  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12830  hypothetical protein  38.81 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000022807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0607  hypothetical protein  38.89 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.822652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3347  hypothetical protein  35.06 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000459873  normal  0.229524 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5518  CRISPR-associated protein Cas2  39.06 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.336556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1244  CRISPR-associated protein Cas2  34.18 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107639  normal  0.587434 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1153  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.91 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0359094  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4329  CRISPR-associated Cas2 family protein  38.89 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00448142  normal  0.268879 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1857  hypothetical protein  35.62 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.224692  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2189  CRISPR-associated protein Cas2  29.9 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2912  CRISPR-associated protein Cas2  31.33 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.206657  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1008  CRISPR-associated Cas2 family protein  31.31 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1476  CRISPR-associated protein Cas2  32.29 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.46179 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0709  CRISPR-associated protein Cas2  39.74 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000457759  hitchhiker  0.00541423 
 
 
-
 
NC_002950  PG1981  CRISPR-associated Cas2 family protein  30.38 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31570  CRISPR-associated protein Cas2  31.25 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0225  CRISPR-associated protein Cas2  48.72 
 
 		 54 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.724313 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3370  hypothetical protein  30.21 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1440  CRISPR-associated protein Cas2  38.46 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.122416  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1652  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.33 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.175728  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0622  CRISPR-associated Cas2 family protein  28.07 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15209  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4853  CRISPR-associated protein Cas2  36.92 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1728  CRISPR-associated Cas2 family protein  32.29 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3645  CRISPR-associated protein Cas2  28.87 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0311  CRISPR-associated protein Cas2  36.92 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.449685  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1483  CRISPR-associated protein Cas2  28.87 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0734  hypothetical protein  34.21 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0419204  normal  0.160516 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0620  CRISPR-associated Cas2 family protein  33.85 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0662433  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1634  CRISPR-associated protein Cas2  28.12 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0178  CRISPR-associated Cas2 family protein  36.54 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2432  CRISPR-associated Cas2 family protein  35.09 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.160442  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0818  CRISPR-associated protein Cas2  31.94 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3118  hypothetical protein  28.26 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00145067  normal  0.997256 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0128  CRISPR-associated protein Cas2  32.84 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1973  CRISPR-associated protein Cas2  29.89 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.514425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1189  CRISPR-associated protein Cas2  35.38 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1801  CRISPR-associated protein Cas2  50 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>