142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2039 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2039  hypothetical protein  100 
 
 		 581 aa  1100    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.566112  normal  0.522751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21280  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  53.98 
 
 		 553 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00165363  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1440  hypothetical protein  52.71 
 
 		 549 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2288  DNA-repair protein  46.01 
 
 		 562 aa  389  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3467  DNA-repair protein  44.01 
 
 		 528 aa  343  5.999999999999999e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3156  UMUC domain protein DNA-repair protein  42.17 
 
 		 510 aa  322  9.000000000000001e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000974062  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15750  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  38.14 
 
 		 589 aa  310  5e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0334276  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3240  hypothetical protein  43.97 
 
 		 524 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488053  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2945  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  38.41 
 
 		 505 aa  304  3.0000000000000004e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.000000598538  decreased coverage  0.00000434939 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13428  hypothetical protein  40.34 
 
 		 527 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4898  hypothetical protein  42.27 
 
 		 531 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.834206  normal  0.0834013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1747  hypothetical protein  39.66 
 
 		 536 aa  298  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1175  hypothetical protein  41.03 
 
 		 532 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1192  hypothetical protein  41.03 
 
 		 529 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1523  hypothetical protein  40.92 
 
 		 522 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1202  hypothetical protein  41.03 
 
 		 529 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.344019  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1186  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.72 
 
 		 549 aa  260  6e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000707508  normal  0.0119021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0923  hypothetical protein  46.65 
 
 		 527 aa  251  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1896  putative DNA-directed DNA polymerase  36.93 
 
 		 520 aa  243  7e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.582074  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0994  hypothetical protein  37.56 
 
 		 527 aa  242  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5241  hypothetical protein  38.42 
 
 		 535 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0112063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3073  DNA-directed DNA polymerase  30.84 
 
 		 414 aa  76.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  29.85 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  25.89 
 
 		 407 aa  62  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3296  DNA-directed DNA polymerase  27.97 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4251  hypothetical protein  32.77 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240238  normal  0.380401 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.34 
 
 		 499 aa  60.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1740  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  31.07 
 
 		 393 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  23.87 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  24.29 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  26.34 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  27.76 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5287  DNA-directed DNA polymerase  27.15 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  28.11 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  24.26 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  30.67 
 
 		 593 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  25.96 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1745  DNA polymerase IV  23.95 
 
 		 428 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3159  DNA-directed DNA polymerase  26.18 
 
 		 431 aa  55.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.382923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  26.07 
 
 		 408 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  28.72 
 
 		 420 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1285  DNA polymerase IV  25.56 
 
 		 431 aa  54.3  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25949  normal  0.0407739 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  23.81 
 
 		 409 aa  54.3  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  26.2 
 
 		 479 aa  54.3  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5871  DNA-directed DNA polymerase  27.3 
 
 		 381 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.937041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2021  DNA polymerase IV  29.41 
 
 		 357 aa  54.3  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  24.3 
 
 		 399 aa  53.9  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000131963  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  28.29 
 
 		 395 aa  53.5  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  26.15 
 
 		 425 aa  53.5  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  23.49 
 
 		 367 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3489  DNA-directed DNA polymerase  31.07 
 
 		 394 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  27.23 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  28.62 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3696  DNA-directed DNA polymerase  25.18 
 
 		 422 aa  52  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0931583  normal  0.897611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  22.51 
 
 		 354 aa  52  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2201  hypothetical protein  38 
 
 		 555 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  30.58 
 
 		 419 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  25.11 
 
 		 431 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  23.16 
 
 		 393 aa  51.6  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1647  DNA-directed DNA polymerase  25.86 
 
 		 432 aa  51.6  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.162886  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  26.71 
 
 		 507 aa  51.6  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  23.81 
 
 		 390 aa  51.2  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  29.6 
 
 		 422 aa  51.2  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  27.72 
 
 		 473 aa  50.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  29.33 
 
 		 430 aa  50.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  25.83 
 
 		 471 aa  50.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  22.48 
 
 		 358 aa  50.8  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3427  DNA polymerase IV  25.37 
 
 		 358 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0935  DNA polymerase IV  25.37 
 
 		 358 aa  50.8  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2123  UMUC-like DNA-repair protein  25.17 
 
 		 387 aa  50.4  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48636  hitchhiker  0.00329078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  24.67 
 
 		 364 aa  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  26.29 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  23.16 
 
 		 429 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  24.05 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  23.27 
 
 		 411 aa  49.7  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  26.52 
 
 		 356 aa  49.3  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  28.44 
 
 		 529 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1114  DNA polymerase IV  23.46 
 
 		 357 aa  48.9  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  21.73 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  23.46 
 
 		 359 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  30.32 
 
 		 419 aa  48.5  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3355  DNA polymerase IV  23.5 
 
 		 358 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3394  DNA polymerase IV  29.86 
 
 		 364 aa  48.5  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320161  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0949  DNA polymerase IV  23.14 
 
 		 359 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  26.45 
 
 		 466 aa  48.5  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  28.44 
 
 		 409 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  24.44 
 
 		 500 aa  48.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4054  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  27.71 
 
 		 526 aa  48.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  24.37 
 
 		 408 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3568  DNA-directed DNA polymerase  21.53 
 
 		 393 aa  47.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  24.37 
 
 		 383 aa  47.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  24.37 
 
 		 361 aa  47.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03909  deoxycytidyl transferase (Eurofung)  23.13 
 
 		 1139 aa  47  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.310555 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  27.31 
 
 		 423 aa  47  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  23.76 
 
 		 410 aa  47  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  22.42 
 
 		 353 aa  47  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1864  hypothetical protein  23.55 
 
 		 763 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  22.42 
 
 		 359 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  23.5 
 
 		 384 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3552  DNA polymerase IV  23.5 
 
 		 358 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>