More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0851 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0851  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
310 aa  606  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.581553  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30330  Mg-dependent DNase  65.8 
 
 
303 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0666529  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2730  TatD-related deoxyribonuclease  63.43 
 
 
305 aa  377  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0972  hydrolase, TatD family  63.23 
 
 
303 aa  355  5.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.571283  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1956  TatD-related deoxyribonuclease  57.98 
 
 
303 aa  338  5e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.942839 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1552  Mg-dependent DNase  47.44 
 
 
319 aa  271  1e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1043  hydrolase, TatD family  51.66 
 
 
274 aa  261  8e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.322597  normal  0.991725 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05370  hydrolase, TatD family  50.51 
 
 
317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0586524  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1248  hydrolase, TatD family  45.42 
 
 
326 aa  246  3e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116067 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03330  hydrolase, TatD family  48.96 
 
 
287 aa  243  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.849452  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1211  TatD family hydrolase  48.62 
 
 
295 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.515901  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13290  hydrolase, TatD family  49.35 
 
 
374 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  45.72 
 
 
285 aa  229  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  46.21 
 
 
272 aa  228  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1281  hydrolase, TatD family  49.66 
 
 
301 aa  227  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000534361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  48.21 
 
 
274 aa  215  8e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4069  hydrolase, TatD family  42.95 
 
 
307 aa  215  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.344791  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  44.93 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  41.45 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  45.67 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  42.35 
 
 
309 aa  212  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  46.71 
 
 
275 aa  212  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0903  hydrolase, TatD family  44.29 
 
 
287 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8621  Mg-dependent DNase  43.65 
 
 
286 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  45.76 
 
 
280 aa  206  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  45.42 
 
 
274 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0587  hydrolase, TatD family  43.06 
 
 
328 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0643  hydrolase, TatD family  42.71 
 
 
256 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4802  TatD family hydrolase  40.75 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3234  hydrolase, TatD family  39.73 
 
 
281 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1931  TatD family hydrolase  39.52 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178442  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4644  TatD family hydrolase  40.82 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4351  TatD family hydrolase  40.82 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0254021 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  37.05 
 
 
464 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4265  TatD-related deoxyribonuclease  39.86 
 
 
265 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0176  TatD family hydrolase  48.04 
 
 
274 aa  161  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.487487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  36.81 
 
 
285 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11027  deoxyribonuclease tatD (yjjV protein)  38.36 
 
 
264 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.789199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  38.1 
 
 
293 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  36.12 
 
 
278 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  35.86 
 
 
462 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  36.4 
 
 
458 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  29.17 
 
 
256 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  33.56 
 
 
606 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  36.4 
 
 
458 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  36.56 
 
 
271 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0074  TatD-related deoxyribonuclease  33.11 
 
 
276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  33.82 
 
 
457 aa  139  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  34.48 
 
 
462 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  30.21 
 
 
256 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  37.31 
 
 
461 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  37.59 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  33.45 
 
 
256 aa  135  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  34.69 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  35.05 
 
 
256 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  33.11 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  36.62 
 
 
268 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  34.38 
 
 
258 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  33.22 
 
 
257 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1993  TatD family deoxyribonuclease  32.89 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  34.11 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  35.09 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  33.69 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  34.59 
 
 
262 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  28.47 
 
 
258 aa  126  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  28.72 
 
 
256 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  29.45 
 
 
256 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  32.97 
 
 
261 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  37.69 
 
 
265 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  31.49 
 
 
259 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  35.37 
 
 
258 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0604  hydrolase, TatD family  33.56 
 
 
269 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.598066  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  30.28 
 
 
263 aa  125  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  35.37 
 
 
258 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  32.13 
 
 
260 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  34.32 
 
 
270 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  29.89 
 
 
255 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  29.09 
 
 
256 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0212  hydrolase, TatD family  27.4 
 
 
270 aa  123  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.02285e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  34.81 
 
 
265 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  28.62 
 
 
257 aa  122  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  28.62 
 
 
257 aa  122  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  28.72 
 
 
255 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  29.07 
 
 
255 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  28.37 
 
 
255 aa  122  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  27.8 
 
 
255 aa  122  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  30.45 
 
 
256 aa  122  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  36.04 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  33.79 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  28.37 
 
 
255 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  28.37 
 
 
255 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  33.06 
 
 
256 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  28.37 
 
 
255 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  28.37 
 
 
255 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  34.34 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  34.86 
 
 
266 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  28.03 
 
 
255 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  32.16 
 
 
259 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003003  putative deoxyribonuclease YcfH  30.71 
 
 
255 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  28.03 
 
 
255 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>