194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0772 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 
229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  74.56 
 
 
236 aa  337  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  74.04 
 
 
236 aa  328  5.0000000000000004e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  69.87 
 
 
240 aa  310  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  68.4 
 
 
234 aa  299  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  63.76 
 
 
231 aa  279  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  63.44 
 
 
228 aa  277  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  67.69 
 
 
244 aa  276  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  63.04 
 
 
231 aa  272  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  64.98 
 
 
238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.83 
 
 
230 aa  259  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  59.74 
 
 
241 aa  252  3e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  58.08 
 
 
235 aa  251  9.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  60.09 
 
 
230 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  60.09 
 
 
230 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  60.09 
 
 
230 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  60.09 
 
 
229 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  59.65 
 
 
230 aa  244  8e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  61.95 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  57.69 
 
 
227 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  60 
 
 
229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  59.36 
 
 
231 aa  242  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  57.89 
 
 
227 aa  240  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  58.41 
 
 
234 aa  239  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  62.44 
 
 
229 aa  236  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  55.17 
 
 
234 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  58.08 
 
 
232 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.95 
 
 
233 aa  229  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  55.7 
 
 
236 aa  229  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  56.58 
 
 
232 aa  228  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  57.73 
 
 
239 aa  227  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  57.02 
 
 
232 aa  224  8e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  53.98 
 
 
228 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  57.02 
 
 
240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  52 
 
 
246 aa  184  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  50.5 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.65 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  38.5 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  36.9 
 
 
237 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.06 
 
 
226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  34.93 
 
 
213 aa  108  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  31.56 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.04 
 
 
247 aa  106  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  35.11 
 
 
223 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.04 
 
 
214 aa  105  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.06 
 
 
232 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  36 
 
 
227 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.57 
 
 
235 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.36 
 
 
241 aa  102  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  34.34 
 
 
230 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.55 
 
 
238 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.04 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.05 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.94 
 
 
237 aa  98.6  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.39 
 
 
212 aa  97.8  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  33.33 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  41.04 
 
 
224 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.47 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  32.34 
 
 
228 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40 
 
 
239 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  35.24 
 
 
221 aa  93.2  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.87 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  41.54 
 
 
227 aa  92.8  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.31 
 
 
218 aa  92.8  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.29 
 
 
240 aa  92.4  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  41.22 
 
 
229 aa  90.9  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  32.42 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.17 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  31.47 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  36.36 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  28.95 
 
 
218 aa  90.1  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.94 
 
 
227 aa  89.4  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.19 
 
 
232 aa  89  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.66 
 
 
216 aa  88.6  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  38.17 
 
 
237 aa  88.2  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.07 
 
 
221 aa  88.2  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.95 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  32.47 
 
 
234 aa  88.2  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.84 
 
 
227 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  34.9 
 
 
230 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  36.76 
 
 
248 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  36.3 
 
 
240 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  36.3 
 
 
240 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  36.3 
 
 
240 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.69 
 
 
233 aa  85.9  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  29.09 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.22 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  27.8 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.43 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  33.51 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.87 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  41.54 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  30.26 
 
 
218 aa  82  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  33.83 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1382  iron-dependent repressor, putative  30.72 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2623  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.4 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  30.18 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.59 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00437401  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  35.16 
 
 
217 aa  79  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>