More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0644 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0644  xylulokinase  100 
 
 
480 aa  946    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632042  normal  0.0960286 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  68.67 
 
 
492 aa  610  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  65.27 
 
 
479 aa  571  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  65 
 
 
465 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2828  xylulokinase  64.56 
 
 
490 aa  569  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  67.3 
 
 
460 aa  565  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  62.58 
 
 
463 aa  560  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  64.29 
 
 
465 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  63.5 
 
 
458 aa  548  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  61.55 
 
 
480 aa  541  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2984  xylulokinase  66.94 
 
 
482 aa  541  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.765011  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  63.05 
 
 
480 aa  537  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  63.27 
 
 
475 aa  527  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3306  xylulokinase  65.35 
 
 
479 aa  524  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0167704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  59.43 
 
 
495 aa  517  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  63.98 
 
 
460 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  60.69 
 
 
486 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  59.12 
 
 
482 aa  505  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  60.13 
 
 
464 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  60.17 
 
 
466 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4666  xylulokinase  58.3 
 
 
505 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114264  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  57.72 
 
 
461 aa  478  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  59.24 
 
 
464 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  58.49 
 
 
465 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2176  xylulokinase  63.55 
 
 
472 aa  474  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000507955 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  58.49 
 
 
465 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  58.49 
 
 
465 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  52.88 
 
 
506 aa  462  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  55.37 
 
 
464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  57.29 
 
 
469 aa  442  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  51.48 
 
 
463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7020  carbohydrate kinase FGGY  41.6 
 
 
540 aa  312  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  42.37 
 
 
493 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  42.37 
 
 
493 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  43.41 
 
 
493 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  36.82 
 
 
495 aa  234  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  35.27 
 
 
498 aa  234  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  35 
 
 
510 aa  233  7.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  35.96 
 
 
498 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  34.72 
 
 
496 aa  223  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  34.77 
 
 
493 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  35.67 
 
 
496 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  34.33 
 
 
493 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  34.56 
 
 
498 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  35 
 
 
496 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  35.22 
 
 
497 aa  213  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  35.22 
 
 
502 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  34.57 
 
 
499 aa  210  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  31.66 
 
 
505 aa  205  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  33.85 
 
 
496 aa  192  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  32.24 
 
 
501 aa  186  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.82 
 
 
492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.82 
 
 
492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  31.25 
 
 
518 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.67 
 
 
500 aa  183  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  34.81 
 
 
498 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  33.33 
 
 
499 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  32.27 
 
 
493 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  34.76 
 
 
512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  31.6 
 
 
486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  32.67 
 
 
483 aa  173  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  33.41 
 
 
484 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  33.41 
 
 
484 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  33.41 
 
 
484 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  33.41 
 
 
484 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  33.19 
 
 
484 aa  171  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  33.41 
 
 
484 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  33.19 
 
 
484 aa  171  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  31.43 
 
 
484 aa  169  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  28.63 
 
 
489 aa  169  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  32.1 
 
 
493 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  30.34 
 
 
487 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  32.38 
 
 
490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  31.42 
 
 
483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  32.38 
 
 
490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  32.58 
 
 
493 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  32.58 
 
 
493 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  32.38 
 
 
490 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  32.96 
 
 
484 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  32.38 
 
 
490 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  32.1 
 
 
493 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  34.57 
 
 
504 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  32.99 
 
 
493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  31.89 
 
 
488 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  32.65 
 
 
493 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  31.93 
 
 
484 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  31.95 
 
 
493 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  31.95 
 
 
493 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5066  xylulokinase  32.96 
 
 
488 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442874  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5794  xylulokinase  32.96 
 
 
488 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  31.95 
 
 
493 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  31.77 
 
 
485 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  33.84 
 
 
492 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  33.48 
 
 
486 aa  163  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  30.82 
 
 
484 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  30.82 
 
 
484 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  32.29 
 
 
488 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3983  xylulokinase  30.67 
 
 
484 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.308981  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  33.84 
 
 
506 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  31.45 
 
 
493 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>