More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2270 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2270  two component transcriptional regulator, LytTR family  100 
 
 		 234 aa  474  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1600  LytTR family two component transcriptional regulator  30.8 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1752  LytTr family DNA-binding response regulator  27.31 
 
 		 236 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046925  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1482  LytTr family DNA-binding response regulator  26.89 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00010327  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2646  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.27 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0583  response regulator  28.76 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02240  response regulator of the LytR/AlgR family  23.83 
 
 		 237 aa  96.3  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1167  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.58 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0468  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.5 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3118  LytTR family two component transcriptional regulator  27.31 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259319  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1697  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.03 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.325505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2345  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.73 
 
 		 240 aa  89  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.681344 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1994  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.72 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0486  DNA-binding response regulator  29.8 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0347807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0498  DNA-binding response regulator  29.39 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000000794566  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2858  response regulator receiver  26.04 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0974  LytTR family two component transcriptional regulator  25.73 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.118297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.57 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.32 
 
 		 281 aa  81.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0033  DNA-binding response regulator  25.22 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00150761  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.61 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0114  LytTR family two component transcriptional regulator  29.76 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.310837  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12140  response regulator of the LytR/AlgR family  24.02 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2400  response regulator receiver protein  26.72 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.14107  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  27.75 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1352  two-component response regulator transcription regulator protein  21.21 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1645  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.23 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  20.25 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.95 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1290  two component transcriptional regulator, LytTR family  20.59 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.212023 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0254  response regulator  27.82 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1924  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.66 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  26.85 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  26.85 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  27.78 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  23.38 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6125  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.79 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2766  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.5 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  26.98 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1279  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.8 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1879  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.93 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.247337  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.65 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.39 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0577  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.39 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  22.08 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  20.9 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  23.53 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  26.27 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2425  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.32 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  26.27 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1227  two component transcriptional regulator, LytTR family  20.17 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299238  normal  0.813842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6269  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.69 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02291  predicted response regulator in two-component system withYpdA  23.58 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.58 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  23.58 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  23.58 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  23.58 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  23.58 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.72 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0428  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.73 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.472628  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3613  response regulator  23.58 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.560415 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2533  response regulator  23.58 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1621  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4280  response regulator receiver protein  26.56 
 
 		 269 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  20.92 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3405  LytTR family two component transcriptional regulator  24.65 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.732179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2171  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.79 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0294549  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4051  response regulator receiver protein  26.56 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0093  response regulator  30.11 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4126  response regulator receiver protein  26.56 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.408771 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01640  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.06 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  22.83 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  22.54 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3396  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.51 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.655263 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04910  two-component system response regulator  26.49 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.981835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  25.12 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0399  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.63 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3358  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.48 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2452  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.17 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0310324  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3485  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.48 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2253  LytTr DNA-binding region  22.27 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3221  putative two-component response-regulatory protein YehT  24.48 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  26.47 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1083  putative two-component response-regulatory protein YehT  25.41 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.450563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3280  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.67 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0671  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.75 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2443  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.42 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0097  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  23.51 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1047  LytTr DNA-binding region  22.95 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.791092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  24.14 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1259  response regulator receiver protein  24.76 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04138  two-component system regulatory protein  21.49 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  20.62 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  25 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0733  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.96 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0959  putative two-component response-regulatory protein YehT  25.37 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>