66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2112 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 449 aa  914    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 		 410 aa  98.2  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 462 aa  93.2  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 424 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 418 aa  90.1  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 434 aa  90.1  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 438 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1435  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.52 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0110058  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2466  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000586108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  23.67 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  22.51 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  22.04 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  21.56 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  25.62 
 
 		 229 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 440 aa  57  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 424 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.97 
 
 		 450 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 424 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 420 aa  55.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  22.31 
 
 		 434 aa  53.5  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 421 aa  52.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 446 aa  52.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  24.29 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  30.06 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  20.89 
 
 		 438 aa  51.2  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 		 433 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  34.35 
 
 		 443 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.28 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  20.71 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  20.94 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.52 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  21.01 
 
 		 423 aa  47.4  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  18.97 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 504 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1240  extracellular solute-binding protein  41.27 
 
 		 465 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000394663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 459 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  21.52 
 
 		 437 aa  44.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  22.94 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 436 aa  44.3  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 464 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 461 aa  43.5  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.34 
 
 		 444 aa  43.5  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 408 aa  43.5  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  20.99 
 
 		 438 aa  43.1  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  30.32 
 
 		 421 aa  43.1  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 433 aa  43.1  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>