More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0798 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  100 
 
 
396 aa  818    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  69.85 
 
 
400 aa  584  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  60.2 
 
 
383 aa  479  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  60.31 
 
 
388 aa  472  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  54.59 
 
 
386 aa  432  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  51.65 
 
 
385 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  47.57 
 
 
387 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  48.34 
 
 
385 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  50.51 
 
 
389 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  48.57 
 
 
386 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  52.94 
 
 
385 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  52.17 
 
 
385 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  47.96 
 
 
396 aa  371  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  48.08 
 
 
392 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  47.44 
 
 
384 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  50.13 
 
 
389 aa  360  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  43.19 
 
 
402 aa  343  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  42.46 
 
 
386 aa  339  5e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  42.46 
 
 
384 aa  338  8e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  43.26 
 
 
397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  42.97 
 
 
388 aa  333  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  43.54 
 
 
381 aa  331  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  44.76 
 
 
379 aa  330  3e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  43.08 
 
 
385 aa  329  4e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  44.65 
 
 
390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  42.28 
 
 
403 aa  327  3e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  42.12 
 
 
403 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  41.94 
 
 
384 aa  317  2e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  42.15 
 
 
376 aa  316  6e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  42.15 
 
 
376 aa  315  8e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  41.43 
 
 
412 aa  315  8e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  41.6 
 
 
376 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  43.59 
 
 
382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  41.6 
 
 
373 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  41.87 
 
 
376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  41.87 
 
 
376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  41.87 
 
 
376 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  42.93 
 
 
402 aa  313  2.9999999999999996e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  42.36 
 
 
420 aa  311  9e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  40.87 
 
 
424 aa  310  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  41.32 
 
 
376 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  41.05 
 
 
376 aa  307  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  41.32 
 
 
376 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  40.5 
 
 
376 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  38.76 
 
 
407 aa  295  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  41.82 
 
 
386 aa  285  8e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  34.5 
 
 
441 aa  229  9e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  33.83 
 
 
429 aa  216  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  34.83 
 
 
461 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  36.78 
 
 
401 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  33.82 
 
 
464 aa  206  8e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  31.44 
 
 
475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  34.46 
 
 
471 aa  199  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  32.68 
 
 
525 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  32.52 
 
 
460 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  32.71 
 
 
378 aa  188  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  31.46 
 
 
429 aa  186  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  32.45 
 
 
469 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  33.59 
 
 
470 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  30.61 
 
 
443 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  31.96 
 
 
988 aa  166  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  30.2 
 
 
1005 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  29.31 
 
 
1010 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  29.64 
 
 
1010 aa  153  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  30.54 
 
 
1498 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  29.58 
 
 
1024 aa  150  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  27.88 
 
 
1018 aa  144  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  28.32 
 
 
1024 aa  142  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  27.21 
 
 
1046 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  27.81 
 
 
1024 aa  139  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  28.06 
 
 
1029 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  27.63 
 
 
763 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  28.06 
 
 
1024 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  28.05 
 
 
1020 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  28.12 
 
 
424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  27.81 
 
 
839 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  27.81 
 
 
1029 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  28.28 
 
 
1021 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  27.81 
 
 
1029 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  30.85 
 
 
908 aa  133  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  29.24 
 
 
444 aa  126  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  27.93 
 
 
424 aa  119  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  27.55 
 
 
421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  25.95 
 
 
430 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  34.78 
 
 
560 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  28.82 
 
 
436 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  28.09 
 
 
428 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  33.53 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  26.46 
 
 
434 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  25 
 
 
422 aa  87.4  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  23.03 
 
 
430 aa  86.7  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  25.72 
 
 
433 aa  86.3  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12683  Predicted amidohydrolase  25.44 
 
 
447 aa  80.5  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  26.36 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2514  hypothetical protein  22.25 
 
 
438 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.739214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1507  hypothetical protein  22.19 
 
 
448 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  22.45 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  23.12 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2869  hypothetical protein  21.93 
 
 
448 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1402  hypothetical protein  22.48 
 
 
429 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.769269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>