103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5195 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5195  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  501  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2591  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 204 aa  88.2  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2528  regulatory protein GntR, HTH  33.15 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1983  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  35.85 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0876  GntR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 220 aa  52.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.398436  normal  0.0490604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0224  transcriptional regulator, GntR family  34.23 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5547  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5912  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6417  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 226 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 260 aa  48.9  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  41.33 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4655  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  38.81 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1556  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0389  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3370  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 323 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  27.36 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0904  GntR domain protein  30.77 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.277363  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3552  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 232 aa  46.2  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2595  GntR domain protein  36.84 
 
 		 227 aa  45.4  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.709124  normal  0.171909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 238 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 238 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4995  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2767  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00604327  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2389  putative transcriptional regulator  39.66 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3745  transcriptional regulator, GntR family  37.18 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5666  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7701  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788387  normal  0.631599 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1944  hypothetical protein  34.48 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3165  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2643  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.577807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2875  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3903  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  40.32 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4963  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.16936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2179  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1812  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515993  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2524  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  37.1 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0240  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0931  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  37.1 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  30.86 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1372  GntR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 242 aa  43.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4203  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 229 aa  43.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8476  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610669  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4996  transcriptional regulator, GntR family  38.27 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555583  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  37.1 
 
 		 232 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3944  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 265 aa  42.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 234 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0010  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 239 aa  42.4  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  hitchhiker  0.00449189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 215 aa  42.7  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5932  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 210 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733777  normal  0.0408892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4128  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal  0.239591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3933  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 236 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.787186  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5719  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 238 aa  42  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 211 aa  42  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 221 aa  42  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0339  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 236 aa  42  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2933  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 245 aa  42  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>